Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,457,227 | A→T | 6.7% | I21N (ATC→AAC) ‡ | hbdH ← | 3‑hydroxybutyrate dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,457,227 | 0 | A | T | 6.7% | 222.0 / 5.1 | 74 | I21N (ATC→AAC) ‡ | hbdH | 3‑hydroxybutyrate dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (26/43); new base T (2/3); total (28/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.32e-01 |
AAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGATGACCACGAACACCGCCAGGGTCTTGATCAGGGTAATACCAA > NC_002947/3457081‑3457372 | aaGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATg > 1:14732/1‑149 (MQ=255) cTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCa < 4:3260/149‑1 (MQ=255) cTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCa < 2:285457/149‑1 (MQ=255) tagATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAAACTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGAGGGGCCCGGCTCACCAAAGCCGTTGCGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAg > 2:348080/3‑149 (MQ=255) gATCTGGACCACATCCGATAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCATCGCCCAgg < 6:173533/148‑1 (MQ=255) gATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAg < 3:39723/147‑1 (MQ=255) tGGACCACATCCGACGGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGACAAt > 2:30241/1‑149 (MQ=255) gACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAAt < 8:176004/147‑1 (MQ=255) gACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGc < 5:219012/149‑1 (MQ=255) cacaTCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGAt < 6:359020/132‑1 (MQ=255) cacaTCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGAt > 5:359020/1‑132 (MQ=255) cacaTCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGc < 3:93884/149‑1 (MQ=255) aTCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCtgg < 5:105250/149‑1 (MQ=255) ccGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCtggtg < 4:241605/149‑1 (MQ=255) cGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCtggtg < 8:212802/148‑1 (MQ=255) gTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCgg > 3:53154/1‑149 (MQ=255) gTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCgg < 7:268410/149‑1 (MQ=255) cGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGa < 4:60645/149‑1 (MQ=255) ggtggtGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGt < 8:164883/149‑1 (MQ=255) gtgCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGATCCGGTGACGAGTGCAg > 5:200810/1‑149 (MQ=255) gtgCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCa < 2:160686/148‑1 (MQ=255) acaACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCGGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGtttt < 1:32411/149‑1 (MQ=255) acaACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGtttt > 2:273922/1‑149 (MQ=255) acaACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGtttt < 3:207012/149‑1 (MQ=255) acaACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGtttt < 1:273922/149‑1 (MQ=255) aaCCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGc < 6:371422/149‑1 (MQ=255) aaCCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGc < 1:27/149‑1 (MQ=255) aCCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCaa < 5:101945/148‑1 (MQ=255) aCCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAg > 6:332941/1‑149 (MQ=255) aCCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGACAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAg < 3:169775/149‑1 (MQ=255) ccccGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAgg < 3:327360/149‑1 (MQ=255) cccGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAggg < 4:9794/149‑1 (MQ=255) ccGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGtttt < 1:146306/137‑1 (MQ=255) ccGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGtttt > 2:146306/1‑137 (MQ=255) ccGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATg < 4:295804/148‑1 (MQ=255) ggCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCgg < 3:310088/113‑1 (MQ=255) ggCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCgg > 4:310088/1‑113 (MQ=255) tttCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTcc < 1:176249/149‑1 (MQ=255) tttCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTcc > 7:334886/1‑149 (MQ=255) ccGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCtt < 3:3436/148‑1 (MQ=255) cGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTa < 6:190113/148‑1 (MQ=255) gCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCa < 2:78012/79‑1 (MQ=255) gCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCa > 1:78012/1‑79 (MQ=255) ggCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATg > 2:101693/1‑149 (MQ=255) cccGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTgg < 3:101246/149‑1 (MQ=255) aCCAACGCCGTTGAGCACGCTGTTGGCGCCCGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATCCCCAGGCCAATGCCGCTGGGGGAACCGGTCACGAGGGCAGTGTTGCCTTCCAGGGTCATGCAATCCTCCTTAGACGATCCCAGTGGCGGAGAAc < 2:14732/149‑1 (MQ=255) ccAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACg > 6:257684/1‑149 (MQ=255) cAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGt < 7:293241/82‑1 (MQ=255) cAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGt > 8:293241/1‑82 (MQ=255) cAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGt > 4:48010/1‑149 (MQ=255) aaaGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTg < 1:348080/149‑1 (MQ=255) aaGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTgg > 3:306295/1‑149 (MQ=255) aaGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTgg > 3:346668/1‑149 (MQ=255) ccGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCa > 2:201640/1‑99 (MQ=255) ccGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCa < 1:201640/99‑1 (MQ=255) ccGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGa > 2:119560/1‑149 (MQ=255) aGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGATGAcc < 5:257684/148‑1 (MQ=255) aCGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGATGACCACg > 7:33929/1‑148 (MQ=255) gATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGATGACCACGaa > 7:212814/1‑148 (MQ=255) aTGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGATGACCACGAaca < 8:212814/149‑1 (MQ=255) ccAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGATGACCACGAACACCGCCAggg > 5:309869/1‑149 (MQ=255) ccAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGGGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGATGACCACGAACACCGCCAggg < 4:12536/149‑1 (MQ=255) ggCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGATGa < 5:376177/123‑1 (MQ=255) ggCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGATGa > 6:376177/1‑123 (MQ=255) aaTACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGATGNCCACGAACACCGCCAGGGTCTTGATCAggg < 1:30241/149‑1 (MQ=255) aaTACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGATGACCACGAACACCGCCAGGGTCTTGATCAggg < 8:334886/149‑1 (MQ=255) gccTGGGCATCGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGa > 6:350461/2‑113 (MQ=255) gccTGGGCATCGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGa < 5:350461/112‑1 (MQ=255) ccTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGATGACCACGAACACCGCCAGGGTCTTGATCAGGGTaa < 1:101693/148‑1 (MQ=255) ccTGGGCATCGCCCAGGTCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGt > 3:142796/1‑95 (MQ=255) ccTGGGCATCGCCCAGGTCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGt < 4:142796/95‑1 (MQ=255) cTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGATGACCACGAACACCGCCAGGGTCTTGa < 8:266744/138‑1 (MQ=255) cTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGATGACCACGAACACCGCCAGGGTCTTGa > 7:266744/1‑138 (MQ=255) cGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGATGACCACGAACACCGCCAGGGTCTTGATCAGGGTAATACCaa > 2:183867/1‑148 (MQ=255) | AAGCCTCGATCTGGACCACATCCGACAGGTCGGCCGGGTGGTGCACAACCTTCACCCCGTGCCGGGCAATTTCCGCCATGGCGGGGCCCGGGTCACCAAAGCCGTTGAGCACGATGTTGGCGCCAGCCCGGGCCAATACCTGGGCGATGCCCAGGCCAATGCCGCTGGTGGAACCGGTGACGAGTGCAGTTTTGCCTTCAAGGGTCATGCAATGCTCCTTAGACGATGCCAGTGGCGTAGAACGTGGCGATGACCACGAACACCGCCAGGGTCTTGATCAGGGTAATACCAA > NC_002947/3457081‑3457372 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |