| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,783,110 | G→A | 5.8% | L67L (CTG→CTA) | nikD → | nickel ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,783,110 | 0 | G | A | 5.8% | 211.2 / 2.3 | 69 | L67L (CTG→CTA) | nikD | nickel ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/31); new base A (2/2); total (36/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.16e-01 | |||||||||||
CGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCGG > NC_002947/3782963‑3783258 | cGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCCGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACtgctgc < 3:249867/149‑1 (MQ=255) cATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGc > 6:345808/1‑147 (MQ=255) aTGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAg > 8:320345/1‑149 (MQ=255) tGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGc > 1:322375/1‑149 (MQ=255) gTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCgct > 1:245994/1‑149 (MQ=255) ttGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCgctggctg > 6:27551/1‑148 (MQ=255) gCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCagtggctggc < 3:40499/148‑3 (MQ=255) cAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAg > 2:209536/1‑149 (MQ=255) cTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAg > 8:239832/1‑149 (MQ=255) ccgcGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAgtgt > 8:205101/1‑147 (MQ=255) cgcgGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTTGCTGCAAGCAGTGTCag < 7:239832/149‑1 (MQ=255) ggcgAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAgg < 1:90780/149‑1 (MQ=255) cgAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTc < 3:5617/149‑1 (MQ=255) tCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCt > 4:129952/1‑148 (MQ=255) tGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGAc > 5:196665/1‑149 (MQ=255) gCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTg > 6:151156/1‑146 (MQ=255) gCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTg < 5:151156/146‑1 (MQ=255) cACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGa < 4:132624/146‑1 (MQ=255) gTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGcc > 3:109961/1‑149 (MQ=255) tGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCCGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTg < 7:250053/149‑1 (MQ=255) ggTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTg < 5:345808/148‑1 (MQ=255) gTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGt < 3:129952/149‑1 (MQ=255) ggTGCCAGCTGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGtgct < 8:160136/149‑1 (MQ=255) tGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGtgctg > 2:124150/1‑148 (MQ=255) aGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCaaaa > 7:17822/1‑149 (MQ=255) cGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTACTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAAcc > 2:358426/1‑149 (MQ=255) cGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTACTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAAcc > 2:364061/1‑149 (MQ=255) cAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAg‑cg < 5:107377/149‑1 (MQ=255) aTCCCTCTGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCt < 8:63946/149‑1 (MQ=255) cTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCaa > 2:45727/1‑149 (MQ=255) cTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCaa > 7:300843/1‑149 (MQ=255) tCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAAc > 7:165402/1‑149 (MQ=255) aGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAAccc > 3:326675/1‑149 (MQ=255) cTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTACTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCgg < 1:364061/149‑1 (MQ=255) cTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTACTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCgg < 1:358426/149‑1 (MQ=255) ccTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTgc < 4:109961/149‑1 (MQ=255) cTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTgcg > 5:295374/1‑149 (MQ=255) cTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTgcg < 6:295374/149‑1 (MQ=255) ttGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACAt > 1:164124/1‑149 (MQ=255) ttGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACAt > 8:113350/1‑149 (MQ=255) gCTCGACCTGCTAACACCTGGCCTCGCCCGCACCCAATGACAACTGCTGCGCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATg < 3:19521/148‑1 (MQ=255) cTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATgg < 5:27551/148‑1 (MQ=255) cTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGgc < 8:17822/149‑1 (MQ=255) tCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGgc > 3:256485/1‑148 (MQ=255) gACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGgcc < 1:209536/148‑1 (MQ=255) ccTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGgccagcc < 7:7139/149‑1 (MQ=255) ccTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCGGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGgccagcc < 7:205101/149‑1 (MQ=255) cTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGGCGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCtt > 1:83614/1‑122 (MQ=255) cTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCtt < 2:83614/122‑1 (MQ=255) tGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAgccat > 2:289809/1‑149 (MQ=255) cTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAgccat < 2:245994/147‑1 (MQ=255) ccaccTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAgccatgccat < 2:380945/149‑1 (MQ=255) caccTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATc < 5:300638/149‑1 (MQ=255) caccTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATc > 4:201383/1‑149 (MQ=255) accTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATc > 6:149274/1‑148 (MQ=255) tGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGaaa > 1:95457/1‑149 (MQ=255) gCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACg < 2:322375/149‑1 (MQ=255) ccTCGCCCGCACCCAAGGACACCTGCTGCTCGCGGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCCGTGTCCGCGGTCGCCTGACCCGCCTGGTGCTGCAAACCCCGCGCAG‑CGCCTTCACCCCGGTGCGCAACATGGCCTGCCATGCCATCGAACCGc < 8:300843/149‑1 (MQ=255) tCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCt > 2:170376/1‑148 (MQ=255) gCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCa < 3:201383/148‑1 (MQ=255) gCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCa < 3:349941/148‑1 (MQ=255) gCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAg < 1:46471/149‑1 (MQ=255) aCCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGt < 6:199157/107‑1 (MQ=255) aCCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGt > 5:199157/1‑107 (MQ=255) cccAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGa < 4:338988/149‑1 (MQ=255) aaGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAgg > 8:326981/1‑148 (MQ=255) aaGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAgg > 1:255505/1‑148 (MQ=255) aCAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCa > 7:127474/1‑149 (MQ=255) aCAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCa > 4:297165/1‑149 (MQ=255) aaCTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATCCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCAc > 8:334275/1‑148 (MQ=255) ctgctgCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAg > 2:42653/1‑149 (MQ=255) ctgctCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGgcc < 6:189024/105‑1 (MQ=255) ctgctCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGgcc > 5:189024/1‑105 (MQ=255) gctCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCgg > 3:61895/1‑149 (MQ=255) | CGTGCTGGTGCATGACGTTGACTTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAG‑CGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCGG > NC_002947/3782963‑3783258 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |