| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,865,284 | C→G | 6.5% | E121Q (GAG→CAG) | PP_3414 ← | methyl‑accepting chemotaxis transducer/sensory box protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,865,284 | 0 | C | G | 6.5% | 226.7 / 3.6 | 72 | E121Q (GAG→CAG) | PP_3414 | methyl‑accepting chemotaxis transducer/sensory box protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/37); new base G (2/3); total (32/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTTGATCACCCGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCTTTTTGCATAGTCCGGCT > NC_002947/3865138‑3865427 | cTTGATCACCCGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGt > 5:272082/1‑149 (MQ=255)cTTGATCACCCGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGt < 8:157850/149‑1 (MQ=255) aTCACCCGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAg > 5:341457/1‑149 (MQ=255) cccGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACg > 4:146741/1‑149 (MQ=255) cccGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACg < 5:70043/149‑1 (MQ=255) cccGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACg > 3:144995/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCGCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCCGTGCTGGACGAGCACCGGc < 2:157020/149‑1 (MQ=255) ggggggTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGt < 5:10459/147‑1 (MQ=255) gggggTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAg < 7:186903/148‑1 (MQ=255) ggggTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCt < 6:253343/149‑1 (MQ=255) gggTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTg < 4:123216/149‑1 (MQ=255) aCTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGACACCTTGATTACGCTGGTGACTTTCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTc > 6:322548/1‑148 (MQ=255) tCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTccag > 2:175836/1‑149 (MQ=255) tCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTccag > 7:17178/1‑149 (MQ=255) cGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCtt < 6:233702/127‑1 (MQ=255) cGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCtt > 5:233702/1‑127 (MQ=255) ggCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGcc < 8:89903/149‑1 (MQ=255) tGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTg > 4:69347/1‑149 (MQ=255) aTGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGt < 8:17178/148‑1 (MQ=255) aTGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGt < 6:111001/148‑1 (MQ=255) aTGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGt < 8:243904/148‑1 (MQ=255) aTGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTc > 6:239966/1‑149 (MQ=255) gCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGa < 5:360137/148‑1 (MQ=255) gCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGAt < 3:280923/149‑1 (MQ=255) ccTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATa < 4:144995/149‑1 (MQ=255) gCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGGGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTc > 3:321000/1‑148 (MQ=255) cAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGt > 1:192179/1‑137 (MQ=255) cAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGt < 2:192179/137‑1 (MQ=255) ggCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTAGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAAc < 6:341457/149‑1 (MQ=255) gCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTc > 6:250535/1‑144 (MQ=255) gCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTc < 5:250535/144‑1 (MQ=255) cTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGt < 3:156684/149‑1 (MQ=255) cGCTTTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCg > 6:374865/1‑149 (MQ=255) tctcGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCt > 2:333554/1‑148 (MQ=255) gTGCTCCTGCACGACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTCCGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGa < 4:243141/146‑1 (MQ=255) gTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAg > 5:355457/1‑149 (MQ=255) tCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTcca < 7:174166/94‑1 (MQ=255) tCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTcca > 8:174166/1‑94 (MQ=255) tCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCtt > 8:296044/1‑149 (MQ=255) caccacCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTtgccc < 1:175836/148‑1 (MQ=255) caccacCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTtgc < 8:286491/146‑1 (MQ=255) caccacCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTtgc > 7:286491/1‑146 (MQ=255) caccacCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCCGTGCTGGACGAGCAc < 5:330689/69‑1 (MQ=38) caccacCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCCGTGCTGGACGAGCAc > 6:330689/1‑69 (MQ=255) accCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTtgccctgccc > 5:284881/1‑149 (MQ=255) accCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTtgccctgccc < 3:146741/149‑1 (MQ=255) gCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAAc > 2:217009/1‑149 (MQ=255) cTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACt > 7:117242/1‑149 (MQ=255) gggTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTcg > 2:2257/1‑149 (MQ=255) tGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCgcgc < 1:217009/149‑1 (MQ=255) tCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAg > 1:5582/1‑149 (MQ=255) ccGACGCCACCTTGAGTAGGCTGGTGACTTGCCGGTGGTGGTGCAGCCCGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCGCCGCCGTGGCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGGCTGGCGCGGCCCCAACTCGCGccggcgg > 4:370662/1‑144 (MQ=255) cGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGtt < 8:117242/149‑1 (MQ=255) cGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGt < 4:192784/148‑1 (MQ=255) gCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCATCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTg < 3:153123/149‑1 (MQ=255) gCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTg < 6:355457/149‑1 (MQ=255) gCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTg < 5:374865/149‑1 (MQ=255) ccACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTgg < 6:272082/149‑1 (MQ=255) ccTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTAc > 5:146734/1‑149 (MQ=255) gATTACGCGGGTGACTTGCCGGTGCTGGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTCTTAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCg < 1:267804/148‑1 (MQ=255) aTTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCgg < 2:229133/148‑1 (MQ=255) ttACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGgcg > 1:138172/1‑149 (MQ=255) aCGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGgcgc < 3:370662/148‑1 (MQ=255) tGGTGACTTGCCTGTGCGCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCttttt < 8:120583/149‑1 (MQ=255) tGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCttttt > 3:292851/1‑149 (MQ=255) gTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCTTTTTg < 7:296044/148‑1 (MQ=255) gTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCTTTTTGc < 8:27325/149‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCTTTTTGCATAGt > 8:17759/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCTTTTTGCATAGTcc > 7:95965/1‑149 (MQ=255) ggTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCTTTTTGCATAGTCCGGc < 5:239966/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGAGCTTTTTGCATAGTCCGGc > 2:223346/1‑149 (MQ=255) atGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCTTTTTGCATAGTCCGGCt < 8:18317/148‑1 (MQ=255) | CTTGATCACCCGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCTTTTTGCATAGTCCGGCT > NC_002947/3865138‑3865427 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |