Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,917,209 | T→A | 7.6% | F331I (TTC→ATC) ‡ | mexB → | multidrug resistance protein MexB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,917,209 | 0 | T | A | 7.6% | 186.2 / 5.1 | 66 | F331I (TTC→ATC) ‡ | mexB | multidrug resistance protein MexB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/32); new base A (3/2); total (32/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.68e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.29e-01 |
GGCAAACCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCA > NC_002947/3917062‑3917350 | ggCAAACCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGtt > 3:210847/1‑149 (MQ=255) aaaCCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGt < 5:289126/149‑1 (MQ=255) aaCCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGt > 5:320615/1‑148 (MQ=255) aaCCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGt > 6:213069/1‑148 (MQ=255) aCGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTTGACGAACGGCGAGGTGtc < 4:168934/149‑1 (MQ=255) aCGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACAGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtc < 6:127968/149‑1 (MQ=255) ccgtccgCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATTGAAACCGCTACCCTGGTACGTGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCTTCAAGGTGtcgatc < 8:251235/143‑1 (MQ=255) ccTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTTGACGAACGGCGAGGTGtcgtag < 2:217380/149‑4 (MQ=255) cTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtcgatc > 6:97430/1‑148 (MQ=255) ttCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGCCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGtcgatcga > 1:96906/1‑149 (MQ=255) aGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCa < 5:97430/149‑1 (MQ=255) aGCGTGCAGGTGGCACCCGGGGCCAACGCCATGGAAACCGGTTCCCTGGTTCGGGCGAAGATGCAGGCCCTGGCGGGCTACTTCCGCGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAg < 1:114139/148‑1 (MQ=255) gCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAg < 6:266206/149‑1 (MQ=255) gCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAg < 8:238062/149‑1 (MQ=255) tGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtc < 6:27819/149‑1 (MQ=255) tGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtc < 2:359712/149‑1 (MQ=255) gCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTCGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTCCGACAACCCCAACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtca > 6:17087/1‑149 (MQ=255) cAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CTGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtcat < 8:197952/149‑1 (MQ=255) ggCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGtt < 3:227087/149‑1 (MQ=255) ggCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGCCGCGCTACTTCC‑CGGAAGCCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAACGTGACGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGta > 4:317735/1‑148 (MQ=255) ccAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAg > 2:37968/1‑149 (MQ=255) ccAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAg < 4:152760/149‑1 (MQ=255) aaCGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGc > 3:269832/1‑149 (MQ=255) cATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCAtgc < 6:320615/149‑1 (MQ=255) gAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCAtgctgc < 5:204974/148‑1 (MQ=255) gAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATgctgct > 8:95319/1‑149 (MQ=255) aCCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAg < 3:163711/108‑1 (MQ=255) aCCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAg > 4:163711/1‑108 (MQ=255) cccTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGGAGGtcatc < 1:90036/113‑1 (MQ=255) cccTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGtcatc > 2:90036/1‑113 (MQ=255) ccTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAg < 5:213069/149‑1 (MQ=255) tACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGc > 6:309895/1‑124 (MQ=255) tACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGc < 5:309895/124‑1 (MQ=255) gggCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCAtgttc < 4:269832/149‑1 (MQ=255) gCGTAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTGC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCTGTCAtgttcct < 3:317735/149‑1 (MQ=255) gAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCAtgttcctgt < 6:321668/149‑1 (MQ=255) gAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCAtgttcctgt > 6:214734/1‑149 (MQ=255) gATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGTAGGCGTCAAGTACGACATCCGCTACGACAGCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCAtgttcctgttcc < 5:17087/149‑1 (MQ=255) gACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGATACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGaa > 3:245011/1‑149 (MQ=255) gcgcgcTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGATACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTgc < 4:245011/148‑1 (MQ=255) gcgcgcTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTgcg > 5:146419/1‑149 (MQ=255) cgcgcTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTgcgc < 5:109560/149‑1 (MQ=255) cc‑cGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTg < 5:214734/148‑1 (MQ=255) cGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATc > 6:175410/1‑149 (MQ=255) aGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGa < 1:37968/149‑1 (MQ=255) gCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACCCCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGAcc > 5:355309/1‑149 (MQ=255) gTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCt > 5:277809/1‑149 (MQ=255) tCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTg > 1:142204/1‑149 (MQ=255) aGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCTTGTTTGATTCAATGATGCTGGTTTTATCAGTAATTTTCCTTTTCCTTAAGAAACTGCCCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTc < 6:207510/149‑1 (MQ=255) tACGACATCCCCTACGACACATCGCCGTTCGTCAACGTGTAGATCTAGCACGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTCCTGGTGTTCGCAGTCATCTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGATGATCCCGAACCTGGTCg > 2:179361/1‑148 (MQ=255) aTCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGt > 8:262251/1‑149 (MQ=255) ccccTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTgg > 5:219249/1‑149 (MQ=255) cccTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCa < 7:193239/104‑1 (MQ=255) cccTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCa > 8:193239/1‑104 (MQ=255) cccTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCATGTTAGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATCTTCCTGTTCATGCAGAACCTCCGCTACACGCTGATCCCGACCCTTGTCGTGCAATTgg > 3:294655/1‑148 (MQ=255) cTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCAt < 7:6394/149‑1 (MQ=255) cTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCAt < 7:95319/149‑1 (MQ=255) tcGACACCTTGACGAACGGCGAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCAtt > 6:239978/2‑148 (MQ=37) tcGACACCTTGACGAACGGCGAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCAtt > 4:363356/2‑148 (MQ=37) tcGACACCTTGACGAACGGCGAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTCTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCAtt > 1:287597/2‑148 (MQ=37) aCGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTg > 4:27332/1‑143 (MQ=255) aCGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTg < 3:27332/143‑1 (MQ=255) gACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGAt > 1:145303/1‑149 (MQ=255) acacCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGATCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATg < 4:210847/149‑1 (MQ=255) acacCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATg > 5:382896/1‑149 (MQ=255) cTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCa > 7:294725/1‑149 (MQ=255) cTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCa > 3:142532/1‑149 (MQ=255) | GGCAAACCGGCCACGGCCTTCAGCGTGCAGTTGTCACCCGGCGCCAACGCCATGGAAACCGCTACCCTGGTACGGGCGAAGATGCAGGACCTGGCGCGCTACTTCC‑CGGAAGGCGTCAAGTACGACATCCCCTACGACACCTCGCCGTTCGTCAAGGTGTCGATCGAGCAGGTCATCAACACCCTGTTCGAGGCCATGCTGCTGGTGTTCGCAGTCATGTTCCTGTTCCTGCAGAACCTGCGCTACACGCTGATCCCGACCCTGGTCGTGCCAGTGGCATTGATGGGCA > NC_002947/3917062‑3917350 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |