| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,333,908 | Δ1 bp | coding (338/2976 nt) | PP_4695 → | two‑component system sensor histidine kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,333,908 | 0 | G | . | 97.3% | 321.8 / 1.9 | 74 | coding (338/2976 nt) | PP_4695 | two‑component system sensor histidine kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base . (37/35); total (38/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
CAGTACGGCTACGGCTTCCTTGCCTGTTACCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCCGCAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGTCAAAGCCCGGGTGGCCTTTGC > NC_002947/5333766‑5334046 | cAGTACGGCTACGGCTTCCTTGCCTGTTACCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGCCCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTAcc > 6:364655/1‑149 (MQ=255)cAGTACGGCTACGGCTTCCTTGCCTGTTACCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTAcc < 6:77703/149‑1 (MQ=255) gTACGGCTACGGCTTCCTTGCCTGTTACCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTg > 3:216979/1‑149 (MQ=255) gTACGGCTACGGCTTCCTTGCCTGTTACCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTg < 7:378210/149‑1 (MQ=255) acggctacggctTCCTTGCCTGTTACCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTgg < 3:92516/148‑1 (MQ=255) ggctacggctTCCTTGCCTGATACCTGGGGGTCTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCTCCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGcc > 5:22125/1‑149 (MQ=255) gctacggctTCCTTGCCTGTTACCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCg > 7:356273/1‑149 (MQ=255) cggctTCCTTGCCTGTTACCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCggg < 6:74687/147‑1 (MQ=255) cggctTCCTTGCCTGTTACCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCggg < 5:62561/147‑1 (MQ=255) cggctTCCTTGCCTGTTACCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGc < 4:216979/149‑1 (MQ=255) cggctTCCTTGACTGTTACCTTGGGGTTTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCggg < 8:245647/147‑1 (MQ=255) gctTCCTTGCCTGTTACCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCt < 8:356273/149‑1 (MQ=255) gCCTGTTACCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGaccac < 1:280654/148‑1 (MQ=255) gTTACCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACcatca > 7:364157/1‑149 (MQ=255) gTTACCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACcatca > 3:86355/1‑149 (MQ=255) aCCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTAc < 5:194897/120‑1 (MQ=255) aCCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTAc > 6:194897/1‑120 (MQ=255) cTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATg < 2:11545/149‑1 (MQ=255) gggggTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCt > 4:197026/1‑149 (MQ=255) ggggTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCt < 3:197026/148‑1 (MQ=255) ggTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCAGCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTGC‑CAGTTCCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGAt < 2:280961/149‑1 (MQ=255) tCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGGCTTGACCACCATCAGCATGCAGAGTg > 8:3344/1‑147 (MQ=255) tCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGa < 5:74179/126‑1 (MQ=255) tCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGa > 6:74179/1‑126 (MQ=255) tCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGc > 4:3779/1‑149 (MQ=255) gcgcATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGtgc < 7:360082/149‑1 (MQ=255) gcgcATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGt < 4:86355/147‑1 (MQ=255) cgcATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCg > 4:388279/1‑145 (MQ=255) cgcATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCg < 3:388279/145‑1 (MQ=255) gcATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGtgctg > 5:245099/1‑149 (MQ=255) ttCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGAccacca < 3:232298/123‑1 (MQ=255) ttCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGAccacca > 4:232298/1‑123 (MQ=255) ttCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCa < 6:367352/149‑1 (MQ=255) ctgctgGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTg > 4:283636/1‑149 (MQ=255) ctgGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGc < 8:364157/147‑1 (MQ=255) cgcCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCt < 3:223165/149‑1 (MQ=255) ccGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTg < 3:3779/149‑1 (MQ=255) gTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCCGCAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTg > 4:154850/1‑147 (MQ=255) gctgctCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGcc < 7:56652/141‑1 (MQ=255) gctgctCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGcc > 8:56652/1‑141 (MQ=255) ctgctCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATc < 5:364655/149‑1 (MQ=255) gctCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATc > 3:279300/1‑147 (MQ=255) ctctACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTACGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATCCTGATTGGCGAGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAg > 4:194583/1‑149 (MQ=255) tctACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAg‑g > 6:156645/1‑149 (MQ=255) tctACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCAGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAg‑g > 4:315170/1‑149 (MQ=255) tACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCg > 1:179014/1‑149 (MQ=255) cGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTgg > 6:319461/1‑149 (MQ=255) gATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGc > 2:163551/1‑149 (MQ=255) cAAGATCACCCGCCCCTCTCAGCTGTCATCGCTGGCCGCGCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CCGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCCTCCTGCTGATTGGCGGGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGTTcctg < 2:214373/135‑3 (MQ=255) cAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGCCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCAATCCTCGCCTTCCAGAGCCAg > 1:214373/1‑135 (MQ=255) aaGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGAtt < 6:245099/147‑1 (MQ=255) aGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGa > 5:199279/1‑149 (MQ=255) tCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCa < 1:146513/149‑1 (MQ=255) cACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CCGTCCCTGGGCCGGGGCCTTGACAACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGAAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAg > 8:401719/1‑149 (MQ=255) aCCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCtt < 4:279300/149‑1 (MQ=255) tATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTAcc > 1:328711/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCg > 5:352921/1‑149 (MQ=255) tCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCgg < 3:283636/149‑1 (MQ=255) tCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCga > 3:55946/1‑148 (MQ=255) aGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCCGCAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGt < 3:154850/149‑1 (MQ=255) tCATCGCTGGCCGACGTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTTCCTGTGGCGGGGCCTTGACCACCATCAACATGGTGATTGGCGTGCTTCGATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCg < 6:22125/149‑1 (MQ=255) aTCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGt > 3:221385/1‑149 (MQ=255) tCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGt > 4:44848/1‑148 (MQ=255) cGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGTTCAAAgaga > 2:308918/1‑145 (MQ=255) cGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGTCAAAGCCCg < 2:328711/149‑1 (MQ=255) cGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGTCAAAGCCCg < 2:179014/149‑1 (MQ=255) cGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGTCAAAGCCCg > 1:172418/1‑149 (MQ=255) cGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAC‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGTCAAAGCCCg > 4:121256/1‑149 (MQ=255) cGACCTGCTGGCCTTCAGCTTCC‑CAGTACCTGGTCCGGGGCCTTGACCTCCATCATCATGCTTATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAGCGCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGTCaaa < 1:308918/145‑1 (MQ=255) gACCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGTCAAAGCCCgg < 6:352921/149‑1 (MQ=255) aCCTGCTGGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGTCAAAGCCCggg < 6:199279/149‑1 (MQ=255) ctgctgGCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGTCAAAGCCCGGGTg > 7:107296/1‑149 (MQ=255) gCCTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGTCAAAGCCCGGGTGgccttt > 3:71894/1‑149 (MQ=255) ccTTCCGCTTCC‑CAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGTCAAAGCCCGGGTGgcctttg > 4:386188/1‑149 (MQ=255) cttccgcttcc‑cAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGTCAAAGCCCGGGTGgcctttgc < 3:386188/149‑1 (MQ=255) gcttcc‑caGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGTCAAAGCCCGGGTGgcctttg < 1:217570/143‑1 (MQ=255) gcttcc‑caGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGTCAAAGCCCGGGTGgcctttg > 2:217570/1‑143 (MQ=255) | CAGTACGGCTACGGCTTCCTTGCCTGTTACCTGGGGGTGTCTGGCGCATTCCTGCTGGCGCCGGTGCTGCTCTACCCGATCCTCAAGATCACCCGCACCTATCAGCTGTCATCGCTGGCCGACCTGCTGGCCTTCCGCTTCCGCAGTACCTGGGCCGGGGCCTTGACCACCATCATCATGCTGATTGGCGTGCTGCCATTGCTGGCCTTGCAGATCCAG‑GCGGTGGCCGATTCGATCAGTATCCTTACCGGTGAACCGGTCAAAGCCCGGGTGGCCTTTGC > NC_002947/5333766‑5334046 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |