Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,625,544 | Δ1 bp | 6.3% | intergenic (‑57/+20) | PP_3195 ← / ← PP_3196 | hypothetical protein/nodulation protein d1 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,625,544 | 0 | T | . | 6.3% | 185.2 / 7.2 | 63 | intergenic (‑57/+20) | PP_3195/PP_3196 | hypothetical protein/nodulation protein d1 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/33); new base . (2/2); total (28/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.76e-01 |
CGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGAATTCAC > NC_002947/3625399‑3625688 | cGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTg < 7:19963/149‑1 (MQ=255) gAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAGACACCGCAGCGGTG‑CTGGGGcatcg < 1:174771/149‑5 (MQ=255) tCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGTCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCCGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGgcc < 6:130885/149‑1 (MQ=255) cGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGgccgc > 6:122069/1‑149 (MQ=255) cGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGgccgc > 5:49943/1‑149 (MQ=255) ccACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCt > 6:187479/1‑147 (MQ=255) aCTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAgg > 3:77467/1‑149 (MQ=255) aCAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGgcgc < 6:234840/149‑1 (MQ=255) ggcaggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCa < 8:44421/149‑1 (MQ=255) gcgggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCGGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGACGCCTCTCAGGAGGTGgcgcg > 3:37016/4‑146 (MQ=255) caggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCaga < 5:372146/149‑1 (MQ=255) aggcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCagag < 5:42962/149‑1 (MQ=255) gcaggGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAACCGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCa > 4:141135/1‑149 (MQ=255) gggCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCt < 7:356486/149‑1 (MQ=255) ggCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTg > 2:164945/1‑149 (MQ=255) gcgcGGTTTGAATGCAAGGTACGCACGCAGGGCAGGGTGGGTCCAATCGTGATCGGGGATCCGAGGGATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTgg < 4:37016/149‑1 (MQ=255) gcgGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCt < 6:343453/149‑1 (MQ=255) gTTTGCAGGCAAGGTACGAAGTCACGGCAGGGTGGGTCCAATCCTGATCAGGGATTCGAGTTATCGAGATGCGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCTGTGTCTGCGGCGATGGCAGAAGCTCATGCGGTGCCGCACAGAGCATCTGGCtcag > 6:189657/1‑146 (MQ=255) aaGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTg > 6:52511/1‑149 (MQ=255) ggCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGgcgcgc > 5:88034/1‑126 (MQ=255) ggCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGgcgcgc < 6:88034/126‑1 (MQ=255) ggCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGgc > 7:17552/1‑149 (MQ=255) ggCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGgc > 8:45673/1‑149 (MQ=255) ggCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGAGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGATCAGGCGGTGGCTCGCATAGCATATGGCTGCGTGCTGgc > 8:108957/1‑149 (MQ=255) aaGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGGTGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCa > 1:74419/1‑149 (MQ=255) cggacgcagggcaggGTGGGGCCAATCGTGATCCGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGaa < 8:360853/143‑1 (MQ=255) ggcagggcagGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACa < 7:45673/149‑1 (MQ=255) cagggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACt > 1:292439/1‑134 (MQ=255) cagggTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACt < 2:292439/134‑1 (MQ=255) aaTCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑c < 4:233499/132‑1 (MQ=255) aaTCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑c > 3:233499/1‑132 (MQ=255) aaTCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGaa < 5:122069/149‑1 (MQ=255) aaTCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGaa < 4:172484/149‑1 (MQ=255) tCGTGATCATTGATGCGAGGTATCTCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGc < 6:9057/149‑1 (MQ=255) tGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCAt < 6:49943/149‑1 (MQ=255) aTCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCt > 8:167881/1‑149 (MQ=255) aTCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCt > 2:301233/1‑149 (MQ=255) aGGTAGCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCTATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACGGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTc < 6:282756/149‑1 (MQ=255) tATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGcc < 7:108957/149‑1 (MQ=255) tATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACAGCAGCGGTGTCTGGGGCGATTGCCGCCGCTCAGGCGGTGACGAGCAGAGCATCTGGATGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑AGCTGATGCGCTCGCGAAGCAATCTGTGCATGGGGTCGcc > 8:354376/1‑149 (MQ=255) tCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCACTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGt > 7:317550/1‑149 (MQ=255) gcgAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCg > 2:346692/1‑146 (MQ=255) gcgAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCg < 1:346692/146‑1 (MQ=255) gcgAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTc > 6:15841/1‑148 (MQ=255) aaCGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCAtgc > 3:3458/1‑149 (MQ=255) cgATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCg < 6:151824/149‑1 (MQ=255) tGCGCCAG‑CTCCGCTGCGGTGTGTTGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGTGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTg < 4:77467/149‑1 (MQ=255) tGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTg < 3:141135/149‑1 (MQ=255) ccccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGc < 1:293329/148‑1 (MQ=255) cccagacACCGCAGCGGTG‑CTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTCTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCca > 7:340661/7‑149 (MQ=255) cccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCca < 5:52511/149‑1 (MQ=255) ccagacACCGCAGCGGTG‑CTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCca > 4:237001/6‑148 (MQ=255) ccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACATCCGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCca < 1:301233/149‑1 (MQ=255) ccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGc < 1:109715/93‑1 (MQ=255) ccAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGc > 2:109715/1‑93 (MQ=255) aG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCcaca < 5:156636/148‑1 (MQ=255) aG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑AGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCca > 6:156636/1‑146 (MQ=255) gacACCGCAGCGGTG‑CTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGc < 3:237001/147‑1 (MQ=255) aCCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCAt < 7:167881/149‑1 (MQ=255) ccGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCAt > 4:159481/1‑148 (MQ=255) cGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGa < 1:164945/149‑1 (MQ=255) cGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGTGGCACCGCAGCATggacgg < 8:17552/148‑6 (MQ=255) ggTGTCTGGGGCGGTGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGAATTCAc < 2:74419/149‑1 (MQ=255) | CGGTCGTGGAGTCCGGCGCCCACTTGAGCGACAGGCAGGCAGGGCGCGGTTTGAAGGCAAGGTACGCAGGCAGGGCAGGGTGGGGCCAATCGTGATCAGGGATGCGAGGTATCGCGAAACGCGATGCCCCAG‑CACCGCTGCGGTGTCTGGGGCGATGGCCGCCGCTCAGGCGGTGGCGCGCAGAGCATCTGGCTGCGTGCTGGCGCACTGAATGACAT‑CGCTGATGCGCTCGCGAAGCCATCTGTGCATGGGGTCGCCGTCCATGCTGCGGTGCCACAGCATGAATTCAC > NC_002947/3625399‑3625688 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |