Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,089,078:1 | +C | 5.3% | coding (761/1029 nt) | astA‑I ← | arginine N‑succinyltransferase subunit beta |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,089,078 | 1 | . | C | 5.3% | 306.7 / 11.1 | 76 | coding (761/1029 nt) | astA‑I | arginine N‑succinyltransferase subunit beta |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (36/36); new base C (2/2); total (38/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.38e-01 |
AGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTACAGCGGGAACTTGGGCA > NC_002947/5088936‑5089222 | aGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCg > 7:6823/1‑148 (MQ=255) gTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGaa < 6:166161/149‑1 (MQ=255) gTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGCCCGGCCATCGa < 3:347807/149‑1 (MQ=255) gTGATGCGACACTCCTCGCGATTGCGGTTGTGGAGGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGAT‑GCCGGCCCGGCCATCGag < 4:224657/149‑2 (MQ=255) aTGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGa < 4:322377/148‑1 (MQ=255) aTGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGa < 6:21714/148‑1 (MQ=255) aTGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGAt < 3:294484/149‑1 (MQ=255) gACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTc > 1:68242/1‑148 (MQ=255) gtcgCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGc > 6:391196/1‑149 (MQ=255) tcgCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGcc > 6:90670/1‑149 (MQ=255) tcgCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGcc > 6:302106/1‑149 (MQ=255) gcgcTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGccc < 2:68242/148‑1 (MQ=255) gcgcTTGCGGGTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCt < 8:240054/149‑1 (MQ=255) gcTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑gg > 7:78344/1‑149 (MQ=255) ggTTGTGGATTATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGTCGTAGCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTGTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGtt < 8:6823/148‑1 (MQ=255) ggTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTg < 1:13997/149‑1 (MQ=255) ttGTGGATGATGAAAGAGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGaa < 7:284447/149‑1 (MQ=255) gatgatGACAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCtt < 8:75550/149‑1 (MQ=255) atgatgAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTc < 2:28651/149‑1 (MQ=255) gaAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAAGGTCTGGCTCTAGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCt > 1:79395/1‑149 (MQ=255) aaaGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCtt < 5:391196/149‑1 (MQ=255) aaaGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCt < 1:195252/148‑1 (MQ=255) aGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCtt > 2:367187/1‑147 (MQ=255) cgTCNTCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGc > 5:26934/1‑148 (MQ=255) gTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGt < 4:34040/104‑1 (MQ=255) gTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGt > 3:34040/1‑104 (MQ=255) tCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAg > 5:289279/1‑149 (MQ=255) cATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAgc > 8:87520/1‑149 (MQ=255) aTCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAgcg > 6:247295/1‑149 (MQ=255) tCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAgcgc > 8:67916/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAg > 7:121272/1‑115 (MQ=255) gCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAg < 8:121272/115‑1 (MQ=255) gCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGcc < 8:78344/148‑1 (MQ=255) gCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCg > 8:228206/1‑149 (MQ=255) ttgCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCt > 7:249096/3‑149 (MQ=255) gCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCg < 2:66256/149‑1 (MQ=255) gTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGgt < 8:222845/149‑1 (MQ=255) gTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGgt < 2:336677/149‑1 (MQ=255) acctaccGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGgtgt > 2:223118/1‑149 (MQ=255) ctaccGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑gg < 3:197420/101‑1 (MQ=255) ctaccGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCt < 7:67916/149‑1 (MQ=255) ctaccGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCt > 6:13996/1‑149 (MQ=255) ctaccGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCGCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑gg > 4:197420/1‑101 (MQ=255) accGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCttt > 2:247234/1‑149 (MQ=255) cGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTtgt < 2:353888/149‑1 (MQ=255) ccAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTtgtg > 1:214059/1‑148 (MQ=255) cAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGca < 2:214059/149‑1 (MQ=255) ccAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTtgt < 1:255017/141‑1 (MQ=255) ccAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTtgt > 2:255017/1‑141 (MQ=255) cAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGc > 2:150176/1‑149 (MQ=255) cAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACCTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTACTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTAGGTGTCTTTGTGCACACGGc > 3:216433/1‑149 (MQ=255) gTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGAt < 5:13996/149‑1 (MQ=255) tCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATc < 6:26934/149‑1 (MQ=255) gCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTtgt < 3:313443/131‑1 (MQ=255) gCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTtgt > 4:313443/1‑131 (MQ=255) gCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCacac > 1:175773/1‑149 (MQ=255) ctctCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCg < 6:162537/120‑1 (MQ=255) ctctCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCg > 5:162537/1‑120 (MQ=255) ctctCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACt < 1:150176/149‑1 (MQ=255) tctcGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGa > 3:344232/1‑99 (MQ=255) tctcGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGa < 4:344232/99‑1 (MQ=255) gcgTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTgcgcg > 3:175723/1‑149 (MQ=255) ggCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGAGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCtt > 1:57660/1‑149 (MQ=255) gcgGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCg > 3:176794/1‑148 (MQ=255) cgGATCTTGGCAGTGTCACACTCCATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGa < 6:171135/149‑1 (MQ=255) gATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACa < 1:223118/149‑1 (MQ=255) gATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACa < 2:79395/149‑1 (MQ=255) cTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAgg > 7:148928/1‑148 (MQ=255) aGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAgg > 1:266410/1‑149 (MQ=255) tgtCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGgtg < 4:60544/149‑1 (MQ=255) tCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGgtgt < 5:247295/148‑1 (MQ=255) tCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTa < 1:367187/149‑1 (MQ=255) atcttCGAT‑GCCGGCCCGGCCATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTa > 5:185310/5‑147 (MQ=255) acacTCGATGGCCGGTCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGACCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTACa > 7:107061/1‑149 (MQ=255) acacTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTa > 3:158354/1‑147 (MQ=255) tcttCGAT‑GCCGGCCCGGCCATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTTTACAg > 3:56265/4‑149 (MQ=255) cctgcccgg‑CATCGAAGATGTCGAAGTAGCCAT‑GGAAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCCCCGGCTCGGTGTCTTAGTGCACACCGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGCACAGGAAGCAGGAGTACAGCGGGAACATg > 8:360518/6‑149 (MQ=255) ccgggccgg‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTACAGCGGGAACTTg > 6:223665/1‑149 (MQ=255) ccgggccgg‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTACAGCGGGAACTTg < 2:266410/149‑1 (MQ=255) cgggccgg‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTACAGCGGGAACTTgg < 7:87520/149‑1 (MQ=255) cgg‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCTGGGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTACAGCGGGAACTTGGGCa > 1:23659/1‑148 (MQ=255) | AGTGATGCGACAGTCGTCGCGCTTGCGGTTGTGGATGATGAAAGGGGTCGCGTCATCGCCTGGCGTACCTACCGCCAGCACCAGGGTCTGGCTCTCGCGTACGGCGCGGATCTTGGCAGTGTCACACTCGATGGCCGGGCCGG‑CATCGAAGATGTCGACGTAGCCCT‑GGTAGTTGAAGCCTTCCTGCTTGAGCATGGCCAGCGCCGGCTCGGTGTCTTTGTGCACACGGCCGATCACACTGCGCGCCGCTTCGGACAGGAAGCAGGTGTACAGCGGGAACTTGGGCA > NC_002947/5088936‑5089222 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |