Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 838,007:1 | +C | 5.7% | intergenic (‑43/+37) | pth ← / ← rplY | peptidyl‑tRNA hydrolase/50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 838,007 | 1 | . | C | 5.7% | 356.8 / 15.3 | 88 | intergenic (‑43/+37) | pth/rplY | peptidyl‑tRNA hydrolase/50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (42/41); new base C (2/3); total (44/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.10e-01 |
GGCGCTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCGGAGCTTT > NC_002947/837860‑838154 | ggCGCTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCg‑g > 5:321319/1‑149 (MQ=255) cgcTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCa > 7:196475/1‑149 (MQ=255) tGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGACGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAAGTGGATGGCGGTCACGTGAGGGGCTCTTCGTTGGAGTTGGTGGGTTAAAGTTCGCGCG‑GCACTg > 4:37465/1‑149 (MQ=255) ggCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTg > 2:266683/1‑148 (MQ=255) cAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTaa > 4:180397/1‑149 (MQ=255) cAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGC‑CGCGCGCACTGTaa < 3:372247/149‑1 (MQ=255) cAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGGTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTaa < 8:358929/149‑1 (MQ=255) aaGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGC‑CGCGCGCACTGTAAc < 8:154732/149‑1 (MQ=255) aaGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTAATGCCGGGTCTGATCGTATTCGGCGCCGGGGTTACCCAGTCCAACGATCAACAGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCACTTCCTTCGAGTTCGTGGGTTACAGTGCGAGCG‑CCACTGTaaa > 8:281337/1‑148 (MQ=255) gTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGAt > 2:110336/1‑149 (MQ=255) gTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGAt < 2:236725/149‑1 (MQ=255) ttCATCGAAAAGAGCCCCTGCTTTATGCCGGGGCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGCGGGTTACAGTGC‑CGCGCGCACTGTAAc < 4:262851/143‑1 (MQ=255) ttCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGag > 5:104068/1‑147 (MQ=255) ttCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGCGGGTTACAGTGC‑CGCGCGCACTGTAAc > 3:262851/1‑143 (MQ=255) ttCAACGAAAAGACCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGTGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTAGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATc < 3:37465/149‑1 (MQ=255) cAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCaa > 5:261449/1‑149 (MQ=255) aaCGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTT‑GAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACg > 6:128294/1‑149 (MQ=255) aCGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACg > 4:3911/1‑149 (MQ=255) gAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGcc > 4:108084/1‑149 (MQ=255) aaaGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCgg > 7:105463/1‑149 (MQ=255) aaaGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCgg > 6:248292/1‑149 (MQ=255) aaaGAGCCACCGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCACCGCCgg > 8:206337/1‑149 (MQ=255) gagCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGt > 8:201126/1‑149 (MQ=255) gCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGTTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGc < 6:172765/149‑1 (MQ=255) gCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGc < 4:158312/149‑1 (MQ=255) ccccTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGc > 5:277347/1‑148 (MQ=255) cTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGt > 6:299156/1‑149 (MQ=255) cGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTg < 7:281337/147‑1 (MQ=255) cGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGa < 7:206337/149‑1 (MQ=255) tGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTAc < 6:252207/148‑1 (MQ=255) tGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACt > 1:294375/1‑149 (MQ=255) cGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCgg < 2:158059/149‑1 (MQ=255) tCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAgc < 5:4073/149‑1 (MQ=255) cTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGGTCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAgcg > 8:74093/1‑149 (MQ=255) ttCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCct > 3:36978/1‑149 (MQ=255) ttCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCct < 1:266683/149‑1 (MQ=255) cGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCctt < 3:180397/148‑1 (MQ=255) gTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttct < 6:321319/149‑1 (MQ=255) tATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctg > 2:232717/1‑149 (MQ=255) aTTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgc > 1:169190/1‑149 (MQ=255) ttCGGGGCCTGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttct < 8:144761/146‑1 (MQ=255) ttCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgct < 4:218845/149‑1 (MQ=255) ttCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgag > 7:144761/1‑147 (MQ=255) cGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgctt < 2:169190/148‑1 (MQ=255) ggggCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGGTCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgcttct < 7:74093/149‑1 (MQ=255) ggggCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgcttc < 1:232717/148‑1 (MQ=255) gggCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgcttctg > 2:64914/1‑149 (MQ=255) ggCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTAGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTgg < 8:196475/149‑1 (MQ=255) gCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgcttctg > 1:109378/1‑147 (MQ=255) gCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGa < 5:180869/149‑1 (MQ=255) gCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGa < 5:299156/149‑1 (MQ=255) gCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGa < 3:108084/149‑1 (MQ=255) cGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAg > 1:196855/1‑148 (MQ=255) gggTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCaa < 2:294375/149‑1 (MQ=255) ggTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAAc > 8:208774/1‑149 (MQ=255) gTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAAcg > 4:197496/1‑149 (MQ=255) ttACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAAcgc > 3:247779/1‑149 (MQ=255) cctaGGACAACGATCAACTGGATGGGGGTCACGTCAGGGGCTCTTGCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGAGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTg < 3:166172/146‑1 (MQ=255) 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aaCTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTg < 6:261449/148‑1 (MQ=255) aaCTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTg < 5:248292/148‑1 (MQ=255) aaCTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTCGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGAGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGACTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTgg > 8:10452/1‑149 (MQ=255) cTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCa > 5:366125/1‑149 (MQ=255) gATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCaa < 4:36978/147‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tctTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCcttctgcttct > 4:378120/1‑95 (MQ=255) ccTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCagag > 4:318509/1‑149 (MQ=255) ccTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCaga < 6:277347/148‑1 (MQ=255) gAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGcgac < 4:300600/148‑1 (MQ=255) gtggGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAActc > 4:151403/1‑148 (MQ=255) gtggGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAActc > 1:8272/1‑148 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cg‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCGGAGCttt < 6:104068/149‑1 (MQ=255) | GGCGCTGGCAAGGCGTTCAACGAAAAGAGCCCCTGCGTTATGCCGGGTCTGTTCGTATTCGGGGCCGGGGTTACCCAGGCCAACGATCAACTGGATGGCGGTCACGTCAGGGGCTCTTCCTTGGAGTTGGTGGGTTACAGTGCGCGCG‑GCACTGTAACCCGATCAACGCCGGCGTGCGAGTGGATTACTCGGCAGCGCCTTCTGCTTCTGGAGCAACGCGTGGAGCGTGAACGTTGGCAACAGCTTTGTCATCACCGTGGGCCAGAGCGACGAACTCTACGCCTTTCGGAGCTTT > NC_002947/837860‑838154 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |