| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,728,814:1 | +T | 5.1% | coding (685/891 nt) | PP_3294 → | universal stress protein family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,728,814 | 1 | . | T | 5.1% | 327.7 / 10.3 | 79 | coding (685/891 nt) | PP_3294 | universal stress protein family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (43/32); new base T (2/2); total (45/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGACTCAATGCAAGGGGCAGTTGCACCTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGCCAAGGTGATCGGCGATACCACCGAGC > NC_002947/3728667‑3728961 | gCGACTCAATGCAAGGGGCAGTTGCACCTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATg‑g > 7:227014/1‑149 (MQ=255)gCGACTCAATGCAAGGGGCAGTTGCACCTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATg‑g > 4:302075/1‑149 (MQ=255) cTCAATGCAAGGGGCAGTTGCACCTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATc < 4:157717/149‑1 (MQ=255) tCAATGCAAGGGGCAGTTGCACCTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATg‑g > 7:208172/1‑144 (MQ=255) tCAATGCAAGGGGCAGTTGCACCTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATg‑g < 8:208172/144‑1 (MQ=255) aaTGCAAGGGGCAGTTGCACCTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGTGTGGGCGATGC‑CATGTGCATCgg > 6:81675/1‑148 (MQ=255) aaTGCAAGGGGCAGTTGCACCTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGcc > 4:44173/1‑149 (MQ=255) aaTGCAAGGGGCAGTTGCACCTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGcc > 3:153398/1‑149 (MQ=255) aaGGGGCAGTTGCACCTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑Cacac > 6:50538/1‑149 (MQ=255) aGTTGCACCTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGCAACTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCATTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCg > 1:116174/1‑149 (MQ=255) gTTGCACCTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGTGTGGGCGATGC‑CATGTGCATCGGC‑‑CA‑ACGCA‑TCgaa < 5:81675/149‑3 (MQ=37) ttGCACCTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCa < 6:307387/149‑1 (MQ=255) aCCTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTAGGGTAAACCAATTACCCCAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCAttt > 5:237053/1‑148 (MQ=255) ccTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCa < 4:236530/149‑1 (MQ=255) cTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTACGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAg > 6:78235/1‑149 (MQ=255) ctctCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGc > 6:235157/1‑147 (MQ=255) ctctCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGc < 5:235157/147‑1 (MQ=255) tcGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACCTG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAgg > 6:332876/1‑149 (MQ=255) cGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGccc < 6:146908/148‑1 (MQ=255) gACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCt > 5:269186/1‑149 (MQ=255) gACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCt > 7:121090/1‑149 (MQ=255) aCCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTgcgc > 4:242452/1‑144 (MQ=255) aCCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTgcgc < 3:242452/144‑1 (MQ=255) ccTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTgc < 5:392753/149‑1 (MQ=255) cccATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTgcgc < 3:302075/147‑1 (MQ=255) cATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATCCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTg > 5:308843/1‑148 (MQ=255) gCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATc > 4:50984/1‑147 (MQ=255) gCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATc > 4:233196/1‑147 (MQ=255) aTGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTc > 3:152678/1‑149 (MQ=255) tGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTa > 1:362649/1‑148 (MQ=255) tGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGC‑CATGTGCATCggc > 8:344154/1‑93 (MQ=255) tGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGC‑CATGTGCATCggc < 7:344154/95‑3 (MQ=255) ccAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATc < 4:153398/149‑1 (MQ=255) gCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGaaa < 6:269186/147‑1 (MQ=255) ccGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACAt < 7:193839/133‑1 (MQ=255) ccGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACAt > 8:193839/1‑133 (MQ=255) ccGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAAtt > 7:104308/1‑149 (MQ=255) ccGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAAt < 3:44173/148‑1 (MQ=255) cGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTg < 1:180764/149‑1 (MQ=255) gC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGAt < 3:99900/149‑1 (MQ=255) gC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGAt < 8:79670/149‑1 (MQ=255) c‑ccTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATg < 8:227014/149‑1 (MQ=255) gggTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAg < 5:249024/147‑1 (MQ=255) ggTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCg > 4:3149/1‑65 (MQ=255) ggTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCg < 3:3149/65‑1 (MQ=255) ggTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCCTGGGCACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAgt > 1:121953/1‑149 (MQ=255) ggTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAgtgg > 2:60117/1‑149 (MQ=255) ggTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAgtg < 5:50538/148‑1 (MQ=255) gTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTACTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCggtggt > 2:293994/1‑149 (MQ=255) tAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAgtggtg < 8:121090/149‑1 (MQ=255) tAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGA‑TGGCCGATGCACCTG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAgtggtg < 5:332876/149‑1 (MQ=255) aCCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTc > 3:143759/1‑149 (MQ=255) ccAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCg > 5:55552/1‑149 (MQ=255) aTTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCa > 6:235092/1‑149 (MQ=255) gcgAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTg > 2:309511/1‑149 (MQ=255) tCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGcc < 5:155522/149‑1 (MQ=255) aCTGGAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCa < 6:237053/149‑1 (MQ=255) aCTGCAGCTGCCTTTCGATTCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCa < 6:308843/149‑1 (MQ=255) aCTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCa < 1:309511/149‑1 (MQ=255) aCTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCa < 3:233196/149‑1 (MQ=255) aCTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCa < 3:50984/149‑1 (MQ=255) tGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAgg > 6:331148/1‑149 (MQ=255) cAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCa > 4:6568/1‑149 (MQ=255) aGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATc > 3:327105/1‑98 (MQ=255) aGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATc < 4:327105/98‑1 (MQ=255) ccTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTggtggt < 4:220972/122‑1 (MQ=255) ccTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTggtggt > 3:220972/1‑122 (MQ=255) tttCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGcc > 6:41605/1‑148 (MQ=255) tCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGCCAAg > 4:163889/1‑149 (MQ=255) cGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGCCAAg < 3:163889/148‑1 (MQ=255) cGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCAATGTGCCAAgg > 8:136939/1‑149 (MQ=255) gATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGCCAAGGt < 6:55552/149‑1 (MQ=255) gATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGCCAAGGt > 3:92537/1‑149 (MQ=255) aTGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCAGCCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGCCAAGGt > 1:264844/1‑149 (MQ=255) aTGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGCCAAGGt > 1:141386/1‑148 (MQ=255) aTGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGCCAAGGt > 7:12518/1‑148 (MQ=255) gT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGCCAAGGTGATCg < 5:235092/149‑1 (MQ=255) acaTG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGCCAAGGTGATCGGCGATcccacc > 4:80655/1‑148 (MQ=255) acaTG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGCCAAGGTGATCGGCGATaccacc > 7:288938/1‑148 (MQ=255) acaTG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGCCAAGGTGATCGGCGATaccacc > 4:173396/1‑148 (MQ=255) acaTG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGGGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGCCAAGGTGATCGGCGATaccacc > 4:78793/1‑148 (MQ=255) caTG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGCCAAGGTGATCGGCGATaccacc > 8:32549/1‑147 (MQ=255) tG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGCCAAGGTGATCGGCGATACCACCGAGc > 5:310481/1‑149 (MQ=255) | GCGACTCAATGCAAGGGGCAGTTGCACCTGCTCTCGGCTTACGACCTGCCCATCGCCATGCTGGCCAACCCTGACCTTGCCGGC‑CCTTGGGTAAACCAATTACGCGAGTCACTGCAGCTGCCTTTCGATGCGT‑TGGCCGATGCACATG‑GCATCGCC‑‑CACACGCA‑CCGGCATTTCAGCGAAGGTGCGCCCCTGCGCGTGATCAAGTCCTACATCGCCACGCTGAAAATTGATGCAGTGGTGGTCGGCACCGTGCAGCCCAGGCATTGGGCCAAGGTGATCGGCGATACCACCGAGC > NC_002947/3728667‑3728961 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |