New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3529839 | 44 (0.710) | 4 (0.070) | 3/250 | NT | 8.1% | coding (1656/3102 nt) | dnaEB | error‑prone DNA polymerase |
? | NC_002947 | = 3529872 | 50 (0.860) | coding (1689/3102 nt) | dnaEB | error‑prone DNA polymerase |
CGGTGGAGAATGCCGCGATGCCGGAGCGCACGGTGATCCAGTGGGACAAGGATGACCTGGACATGGTTGGCCTGCTCAAGGTCGACGTACTGGCGTTGGGCATGCTCAGCGCCTTGCGTCGCTGCTTCGACCAGCTGCAGCACCACCGTGGCCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/3529685‑3529839 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtggccggGTCTTCGCTGGGGATGGTCGCCAGGGTCAGGTGCCGGCCACGGTGGTGCTGCAGCTGGTCGAAGCAGCGACGCAAGGCGCTGAGCATGCCCAACGCCAGTACGTCGACCTTGAGCAGGCCAACCATGTCCAGGTCATCCTTGTCCCAC < NC_002947/3529872‑3529725 CGGTGGAGAATGCCGAGATGCCGGAGCGCACTGTGATCCAGTGGTACAAGGATGACCTGTTCATGGTTGGCCTGCTCAAGGTCTACGTACTGGCGTTGGGCATGCTCAGCGCCTTGCGTCGCTGCTTCGACCAGCTGCAGCACCACCGT < 6:228250/149‑1 CAAGGATGACCTGGACATGGTTGGCCTGCTCAAGGTCGACGTACTGGCGTTGGGCATGCTCAGCGCCTTGCGTCGCTGCTTCGACCAGCTGCAGCACCACCGTGGCCGGGTCTTCGCTGGGGATGGTCGCCAGGGTCAGGTGCCGGCCA < 1:322065/149‑1 CAAGGATGACCTGGACATGGTTGGCCTGCTCAAGGTCGACGTACTGGCGTTGGGCATGCTCAGCGCCTTGCGTCGCTGCTTCGACCAGCTGCAGCACCACCGTGGCCGGGTCTTCGCTGGGGATGGTCGCCAGGGTCAGGTGCCGGCCA < 1:347205/149‑1 AGGATGACCTGGACATGGTTGGCCTGCTCAAGGTCGACGTACTGGCGTTGGGCATGCTCAGCGCCTTGCGTCGCTGCTTCGACCAGCTGCAGCACCACCGTGGCCGGGTCTTCGCTGGGGATGGTCGCCAGGGTCAGGTGCCGGCCACG < 5:83868/149‑1 GGATGACCTGGACATGGTTGGCCTGCTCAAGGTCGACGTACTGGCGTTGGGCATGCTCAGCGCCTTGCGTCGCTGCTTCGACCAGCTGCAGCACCACCGTGGCCGGGTCTTCGCTGGGGTTGGTCGCCAGGGTCAGGTGCCGGCCACGG < 8:80886/149‑1 GTGGCGGGGTCTTCGGTGGGGATGGTCGCCAGGGTCAGGTGCCGGCCACGGTGGTGCTGCAGCTGGTCGAAGCAGCGACGCAAGGCGCTGAGCATGCCCAACGCCAGTACGTC < 5:308145/113‑1 GTGGCCGGGTCTTCGCTGGGGATGGTCGCCAGGGTCAGGTGCCGGCCACGGTGGTGCTGCAGCTGGTCGAAGCAGCGACGCAAGGCGCTGAGCATGCCCAACGCCAGTACGTCGACCTTGAGCAGGCCAACCATGTCCAGGTCATCCTT < 8:266324/149‑1 GTGGCCGGGTCTTCGCTGGGGATGGTCGCCAGGGTCAGGTGCCGGCCACGGTGGTGCTGCAGCTGGTCGAAGCAGCGACGCAAGGCGCTGAGCATGCCCAACGCCAGTACGTC > 6:308145/1‑113 TGGCCGGGTCTTCGCTGGGGATGGTCGCCAGGGTCAGGTGCCGGCCACGGTGGTGCTGCAGCTGGTCGAAGCAGCGACGCAAGGCGCTGAGCATGCCCAACGCCAGTACGTCGACCTTGAGCAGGCCAACCATGTCCAGGTCATCCTTG > 6:126620/1‑149 GCCGGGTCTTCGCTGGGGATGGTCGCCAGGGTCAGGTGCCGGCCACGGTGGTGCTGCAGCTGGTCGAAGCAGCGACGCAAGGCGCTGAGCATGCCCAACGCCAGTACGTCGACCTTGAGCAGGCCAACCATGTCCAGGTCATCCTTGT < 2:61519/148‑1 GGTCTTCGCTGGGGATGGTCGCCAGGGTCAGGTGCCGGCCACGGTGGTGCTGCAGCTGGTCGTAGCAGCGACGCAAGGCGCTGAGCATGCCCAACGCCAGTACGTCGACCTTGAGCAGGCCAACCATGTCCAGGTCATCCTTGTCCCAC < 8:91752/149‑1 GGTCTTCGCTGGGGATGGTCGCCAGGGTCAGGTGCCGGCCACGGTGGTGCTGCAGCTGGTCGAAGCAGCGACGCAAGGCGCTGAGCATGCCCAACGCCAGTACGTCGACCTTGAGCAGGCCAACCATGTCCAGGTCATCCTTGTCCCAC < 3:349169/149‑1 GGTCTTCGCTGGGGATGGTCGCCAGGGTCAGGTGCCGGCCACGGTGGTGCTGCAGCTGGTCGAAGCAGCGACGCAAGGCGCTGAGCATGCCCAACGCCAGTACGTCGACC > 7:292973/1‑110 GGTCTTCGCTGGGGATGGTCGCCAGGGTCAGGTGCCGGCCACGGTGGTGCTGCAGCTGGTCGAAGCAGCGACGCAAGGCGCTGAGCATGCCCAACGCCAGTACGTCGACC < 8:292973/110‑1 CGGTGGAGAATGCCGCGATGCCGGAGCGCACGGTGATCCAGTGGGACAAGGATGACCTGGACATGGTTGGCCTGCTCAAGGTCGACGTACTGGCGTTGGGCATGCTCAGCGCCTTGCGTCGCTGCTTCGACCAGCTGCAGCACCACCGTGGCCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/3529685‑3529839 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtggccggGTCTTCGCTGGGGATGGTCGCCAGGGTCAGGTGCCGGCCACGGTGGTGCTGCAGCTGGTCGAAGCAGCGACGCAAGGCGCTGAGCATGCCCAACGCCAGTACGTCGACCTTGAGCAGGCCAACCATGTCCAGGTCATCCTTGTCCCAC < NC_002947/3529872‑3529725 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |