| New junction evidence | |||||||||||
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aggctttccacgcctcgcccgacggcctgctgctgtcgcgccagagcgacggtttgctgctggaggtgaacgaaggcttctgccgcctcaccggctacgacctcaacccaaccatcgaccagacctcgctggacctgggtatctgGGTc > 8:131188‑M1/146‑149 (MQ=255) aggctttccacgcctcgcccgacggcctgctgctgtcgcgccagagcgacggtttgctgctggaggtgaacgaaggcttctgccgcctcaccggctacgacctcaacccaaccatcgaccagacctcgctggacctgggtatctgGGTc > 5:54176‑M1/146‑149 (MQ=255) tGATGTCGCGGGCGATGGTCAGCATGCAGTCAACGCCGGTAATCGGCAGGGGCCGGGCGGAAAGCTCGCAC‑AGTCGGATCTGCCCGTCGCTGCGGCGGATATGACAGGTGAAGTCGCGCACGAAGCCGTCGCGGTTTAGCTGGTCGAc > 5:261271/1‑148 (MQ=255) tttccacgcctcgcccgacggcctgctgctgtcgcgccagagcgacggtttgctgctggaggtgaacgaaggcttctgccgcctcaccggctacgacctcaacccaaccatcgaccagacctcgctggacctgggtatctggg > 3:22751‑M1/142‑143 (MQ=255) tttccacgcctcgcccgacggcctgctgctgtcgcgccagagcgacggtttgctgctggaggtgaacgaaggcttctgccgcctcaccggctacgacctcaacccaaccatcgaccagacctcgctggacctgggtatctggg < 4:22751‑M1/2‑1 (MQ=255) tttccacgcctcgcccgacggcctgctgctgtcgcgccagagcgacggtttgctgctggaggtgaacgaaggcttctgccgcctcaccggctacgacctcaacccaaccatcgaccagacctcgctggacctgggtatctgGGTCGAcc < 3:223856‑M1/8‑1 (MQ=255) tCGCGGGCGATGGTCAGCATGCAGTCAACGCCGGTAATCGGCAGGGGCCGGGCGGAAAGCTCGCAC‑AGTCGGATCTGCCCGTCGCTGCGGCGGATATGACAGGTGAAGTCGCGCACGAAGCCGTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCg > 8:84995/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCGATGGTCAGCATGCAGTCAACGCCGGTAATCGGCAGGGGCCGGGCGGAAAGCTCGCAC‑AGTCGGATCTGACCGTCGCTGCGGCGGATATGACAGGTGAAGTCGCGCACGAAGCCGTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCGt > 6:378358/1‑149 (MQ=255) gcgGGCGATGGTCAGCATGCAGTCAACGCCGGTAATCGGCAGGGGCCGGGCGGAAAGCTCGCAC‑AGTCGGATCTGCCCGTCGCTGCGGCGGATATGACAGGTGAAGTCGCGCACGAAGCCGTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCGtt > 5:320968/1‑149 (MQ=255) cgGGCGATGGTCAGCATGCAGTCAACGCCGGTAATCGGCAGGGGCCGGGCGGAAAGCTCGCAC‑AGTCGGATCTGCCCGTCGCTGCGGCGGATATGACAGGTGAAGTCGCGCACGAAGCCGTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCGttt < 6:227497/149‑1 (MQ=255) gggCGATGGTCAGCATGCAGTCAACGCCGGTAATCGGCAGGGGCCGGGCGGAAAGCTCGCAC‑AGTCGGATCTGCCCGTCGCTGCGGCGGATATGACAGTTGAAGTCGCGCACGAAGCCGTCGCGGTTTAGCTTGTCGACCAGGCGTTTg < 2:56715/149‑1 (MQ=255) gggCGATGGTCAGCATGCAGTCAACGCCGGTAATCGGCAGGGGCCGGGCGGAAAGCTCGCAC‑AGTCGGATCTGCCCGTCGCTGCGGCGGATATGACAGGTGAAGTCGCGCACGAAGCCGTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCGTTTg < 1:86474/149‑1 (MQ=255) gATGGTCAGCATGCAGTCAACGCCGGTAATCGGCAGGGGCCGGGCGGAAAGCTCGCAC‑AGTCGGATCTGCCCGTCGCTGCGGCGGATATGACAGGTGAAGTCGCGCACGAAGCCGTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCGTTTGCGCt > 8:10305/1‑149 (MQ=255) aTGGTCAGCATGCAGTCAACGCCGGTAATCGGCAGGGGCCGGGCGGAAAGCTCGCAC‑AGTCGGATCTGCCCGTCGCTGCGGCGGATATGACAGGTGAAGTCGCGCACGAAGCCGTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCGTTTGCGCTc < 8:77538/149‑1 (MQ=255) aGCATGCAGTCAACGCCGGTAATCGGCAGGGGCCGGGCGGAAAGCTCGCAC‑AGTCGGATCTGCCCGTCGCTGCGGCGGATATGACAGGTGAAGTCGCGCACGAAGCCGTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCGTTTGCGCTCGTTGa < 5:182591/148‑1 (MQ=255) 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aaGTCGCGCACGAAGCCGTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCGTTTGCGCTCGTTGAGGTCGACCCAGATACCCAGGTCCAGCGAGGTCTGGTCGATGGTTGGGTTGAGGTCGTAGCCGGTGAGGCGGCAGA‑AGCCTTCGTTCACCt < 3:177355/148‑1 (MQ=255) gcgcACGAAGCCGTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCGTTTGCGCTCGTTGAGGTCGACCCAGATACCCAGGTCCAGCGAGGTCTGGTCGATGGTTGGGTTGAGGTCGTAGCCGGTGAGGCGGCAGA‑AGCCTTCGTTCACCTCcagca < 7:194519/149‑1 (MQ=255) gcgcACGAAGCCGTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCGTTTGCGCTCGTTGAGGTCGACCCAGATACCCAGGTCCAGCGAGGTCTGGTCGATGGTTGGGTTGAGGTCGTAGCCGGTGAGGCGGCAGA‑AGCCTTCGTTCACCTCcagc > 8:145300/1‑148 (MQ=255) gcgcACGAAGCCGTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCGTTTGAGCTCGTTGAGGTCGACCCAGATACCCAGGTCCAGCGAGGTCTGGTCGATGGTTGGGTTGAGGTCGTAGCCGGTGAGGCGGCAGA‑AGCCTTCGTTCACCTCcag > 1:76003/1‑147 (MQ=255) gAAGCCGTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCGTTTGCGCTCGTTGAGGTCGACCCAGATACCCAGGTCCAGCGAGGTCTGGTCGATGGTTGGGTTGAGGTCGTAGCCGGTGa < 6:368526/113‑1 (MQ=255) gAAGCCGTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCGTTTGCGCTCGTTGAGGTCGACCCAGATACCCAGGTCCAGCGAGGTCTGGTCGATGGTTGGGTTGAGGTCGTAGCCGGTGAGGCGGCAGA‑AGCCTTCGTTCACCTCCAGCAGCAAAc < 5:114819/149‑1 (MQ=255) cGTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCGTTTGCGCTCGTTGAGGTCGACCCAGATACCCAGGTCCAGCGAGGTCTGGTCGATGGTTGGGTTGAGGTCGTAGCCGGTGAGGCGGCAGA‑AGCCTTCGTTCACCTCCAGCAGCAAACCGTCg < 2:90513/149‑1 (MQ=255) gTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCGTTTGCGCTCGTTGAGGTCGACCCAGATACCCAGGTCCAGCGAGGTCTGGTCGATGGTTGGGTTGAGGTCGTAGCCGGTGAGGCGGCAGA‑AGCCTTCGTTCACCTCCAGCAGCAAACCGTCGc > 4:262951/1‑149 (MQ=255) ggTTTAGCTGGTCGACCAGGCGTTTGCGCTCGTTGAGGTCGACCCAGATACCCAGGTCCAGCGAGGTCTGGTCGATGGTTGGGTTGAGGTCGTAGCCGGTGAGGCGGCAGA‑AGCCTTCGTTCACCTCCAGCAGCAAGCCGTCGCTCTgg > 1:9063/1‑149 (MQ=255) gCTGGTCGACCAGGCGTTTGCGCTCGTTGAGGTCGACCCAGATACCCAGGTCCAGCGAGGTCTGGTCGATGGTTGGGTTGAGGTCGTAGCCGGTGAGGCGGCAGACAGCCTTCGTTCACCTCCAGCAGCAAACCGTCGCTCTGGCGCGa < 1:74445/149‑1 (MQ=255) gCTGGTCGACCAGGCGTTTGCGCTCGTTGAGGTCGACCCAGATACCCAGGTCCAGCGAGGTCTGGTCGATGGTTGGGTTGAGGTCGTAGCCGGTGAGGCGGCAGA‑AGCCTTCGTTCACCTCCAGCAGCAAACCGTCGCTCTGGCGCGa > 4:304984/1‑148 (MQ=255) gCTGGTCGACCAGGCGTTTGCGCTCGTTGAGGTCGACCCAGATACCCAGGTCCAGCGAGGTCTGGTCGATGGTTGGGTTGAGGTCGTAGCCGGTGAGGCGGCAGA‑AGCCTTCGTTCACCTCCAGCAGCAAACCGTCGCTCTGGCGCGa < 7:10305/148‑1 (MQ=255) cTGGTCGACCAGGCGTTTGCGCTCGTTGAGGTCGACCCAGATACCCAGGTCCAGCGAGGTCTGGTCGATGGTTGGGTTGAGGTCGTAGCCGGTGAGGCGGCAGA‑AGCCTTCGTTCACCTCCAGCAGCAAACCGTCGCTCTGGCGCGa > 1:253656/1‑147 (MQ=255) tGGTCGACCAGGCGTTTGCGCTCGTTGAGGTCGACCCAGATACCCAGGTCCAGCGAGGTCTCGTCGATGGTTGGGTTGAGGTCGTAGCCGGTGAGGCGGCAGA‑AGCCTTCGTTCACCTCCAGCAGCAAACCGTCCCTCTGGCGCGAcag > 6:133624/1‑149 (MQ=255) GGTCGACCAGGCGTTTGCGCTCGTTGAGGTCGACCAAGATACCCAGGTCCAGCGAGCTCTCGTCGATGGTTGGGTTGAGGTCGTAGCCGGTGAGGCGGCAGA‑AGCCTTCGTTCACCTCCAGCAGCAAACCGTCGCTCTGGCGCGAcag < 6:229911‑M1/148‑1 (MQ=255) | CGCTCGGTGATGTCGCGGGCGATGGTCAGCATGCAGTCAACGCCGGTAATCGGCAGGGGCCGGGCGGAAAGCTCGCAC‑AGTCGGATCTGCCCGTCGCTGCGGCGGATATGACAGGTGAAGTCGCGCACGAAGCCGTCGCGGTTTAGCTGGTCGACCAGGCGTTTGCGCTCGTTGAGGTCGACCCAGATACCCAGGTCCAGCGAGGTCTGGTCGATGGTTGGGTTGAGGTCGTAGCCGGTGAGGCGGCAGA‑AGCCTTCGTTCACCTCCAGCAGCAAACCGTCGCTCTGGCGCGACAG > NC_002947/468936‑469231 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |