New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1350737 | 74 (1.190) | 5 (0.080) | 4/254 | NT | 6.3% | coding (1048/1251 nt) | nrdB | ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit beta |
? | NC_002947 | = 1350750 | 78 (1.320) | coding (1035/1251 nt) | nrdB | ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit beta |
TTCTCCTTCTTCAAGTCCATGATCTCGCTCATCCATGGGAACGGGTTGGTAGTCCCCGGATACTCTTCTTTCAAACCAATCTGAGTCAAACGACGGTTAGCAATGAACTTGAGGTAATCCTCCATCATCGCTGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTGGCATGGTGTCTCGGGCGTATTCGATCTCCAGCTGGGTCCCTTGCAGGATCATCTGGGTCGCTTCTTCCTTCATCGCCGCATCCCACAGGTGCGGGTTTTCGATCTTGATCTGGTTGATCACGTCGATACCGAAG > NC_002947/1350595‑1350885 | ttctCCTTCTTCAAGTCCATGATCTCGCTCATCCATGGGAACGGGTTGGTAGTCCCCGGATACTCTTCTTTCAAACCAATCTGAGTCAAACGACGGTTAGCAATGAACTTGAGGTAATCCTCCATCATCGCTGCGTTCATGCCCAGCAc > 5:348712/1‑149 (MQ=255) ccTTCTTCAAGTCCATGATCTCGCTCATCCATGGGAACGGGTTGGTAGTCCCCGGATACTCTTCTTTCAAACCAATCTGAGTCAAACGACGGTTAGCAATGAACTTGAGGTAATCCTCCATCATCGCTGCGTTCATGCCCAGCAcgccg > 4:373995/1‑149 (MQ=255) cttcttCAAGTCCATGATCTCGCTCATCCATGGGAACGGGTTGGTAGTCCCCGGATACTCTTCTTTCAAACCAATCTGAGTCAAACGACGGTTAGCAATGAACTTGAGGTAATCCTCCATCATCGCTGCGTTCATGCCCAGCAcgccgc > 7:181333/1‑149 (MQ=255) tCAAGTCCATGATCTCGCTCATCCATGGGAACGGGTTGGTAGTCCCCGGATACTCTTCTTTCAAACCAATCTGAGTCAAACGACGGTTAGCAATGAACTTGAGGTAATCCTCCATCATCGCTGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTgg < 6:138121‑M2/148‑3 (MQ=255) cAAGTCCATGATCTCGCTCATCCATGGGAACGGGTTGGTAGTCCCCGGATACTCTTCTTTCAAACCAATCTGAGTCAAACGACGGTTAGCAATGAACTTGAGGTAATCCTCCATCATCGCTGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTggca < 8:233023‑M2/149‑5 (MQ=255) cAAGTCCATGATCTCGCTCATCCATGGGAACGGGTTGGTAGTCCCCGGATACTCTTCTTTCAAACCAATCTGAGTCAAACGACGGTTAGCAATGAACTTGAGGTAATCCTCCATCATCGCTGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTg > 8:30394‑M2/1‑145 (MQ=255) cAAGTCCATGATCTCGCTCATCCATGGGAACGGGTTGGTAGTCCCCGGATACTCTTCTTTCAAACCAATCTGAGTCAAACGACGGTTAGCAATGAACTTGAGGTAATCCTCCATCATCGCTGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTg > 5:336705‑M2/1‑145 (MQ=255) gTCCATGATCTCGCTCATCCATGGGAACGGGTTGGTAGTCCCCGGATACTCTTCTTTCAAACCAATCTGAGTCAAACGACGGTTAGCAATGAACTTGAGGTAATCCTCCATCATCGCTGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTGGCATgg < 3:188872/149‑1 (MQ=255) gTCCATGATCTCGCTCATCCATGGGAACGGGTTGGCAGTCCCCGGATACTCTTCTTTCAAACCAATCTGAGTAAAACGAAGGATAGCAATGAACTTGAGGTAATCCTCCATCATCGCTGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTggcatgc < 2:383852‑M2/149‑8 (MQ=255) cATGATCTCGCTCATCCATGGGAACGGGTTGGTAGTCCCCGGATACTCTTCTTTCAAACCAATCTGAGTCAAACGACGGTTAGCAATGAACTTGAGGTAATCCTCCATCATCGCTGCGTTCATGCCacgcggcgtgctgggcatgaac < 1:326636‑M1/148‑23 (MQ=255) cATGATCTCGCTCATCCATGGGAACGGGTTGGTAGTCCCCGGATACTCTTCTTTCAAACCAATCTGAGTCAAACGACGGTTAGCAATGAACTTGAGGTAATCCTCCATCATCGCTGCGTTCATGCCacgcggcgtgctgggcatgaac < 8:46537‑M1/148‑23 (MQ=255) tctCATCCATGGGAACGGGTTGGTAGTCCCCGGATACTCTTCTTTCAAACCAATCTGAGTCAAACGACGGTTAGCAATGAACTTGAGGTAATCCTCCATCATCGCTGCGTTCATGCCacgcggcgtgctgggcatgaacgcagcgat < 4:18814‑M1/146‑31 (MQ=255) gCTCATCCATGGGAACGGGTTGGTAGTCCCCGGATACTCTTCTTTCAAACCAATCTGAGTCAAACGACGGTTAGCAATGAACTTGAGGTAATCCTCCATCATCGCTGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTGGCATGGTGTCTCGGGc < 4:62127/147‑1 (MQ=255) gCTCATCCATGGGAACGGGTTGGTAGTCCCCGGATACTCTTCTTTCAAACCAATCTGAGTCAAACGACGGTTAGCAATGAACTTGAGGTAATCCTCCATCATCGCTGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTGGCATGGTGTCTCGGGc < 1:300356/147‑1 (MQ=255) 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atcatcGCTGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTGGCATGGTGTCTCGGGCGTATTCGATCTCCAGCTGGGTCCCTTGCAGGATCATCTGGGTCGCTTCTTCCTTCATCGCCGCATCCCACAGGTGCGGGTTTTCGATCTTGATCTGGtt < 8:219780/149‑1 (MQ=255) atcGCTGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTggcatgaacgcagcgatgatggaggattacctcaagttcattgctaaccgtcgtttgactcagattggtttgaaagaagagtatccggggactaccaacccgttcccatggatgaga < 4:18814‑M2/147‑118 (MQ=255) tcGCTGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTGGCATGGTGTCTCGGGCGTATTCGATCTCCAGCTGGGTCCCTTGCAGGATCATCTGGGTCGCTTCTTCCTTCATCGCCGCATCCCACAGGTGCGGGTTTTCGATCTTGATCTGGTTGATc < 4:264284/149‑1 (MQ=255) cTGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTGGCATGGTGTCTCGGGCGTATTCGATCTCCAGCTGGGTCCCTTGCAGGatc < 4:125096/77‑1 (MQ=255) cTGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTGGCATGGTGTCTCGGGCGTATTCGATCTCCAGCTGGGTCCCTTGCAGGatc > 3:125096/1‑77 (MQ=255) tGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTggcatgaacgcagcgatgatggaggattacctcaagttcattgctaaccgtcgtttgactcagattggtttgaaagaa > 4:250140‑M2/1‑25 (MQ=255) tGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTggcatgaacgcagcgatgatggaggattacctcaagttcattgctaaccgtcgtttgactcagattggtttgaaagaa < 3:250140‑M2/103‑79 (MQ=255) cGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTGGCATGGTGTCTCGGGCGTATTCGATCTCCAGCTGGGTCCCTTGCAGGATCATCTGGGTCGCTTCTTCCTTCATCGCCGCATCCCACAGGTGCGGGTTTTCGATCTTGATCTGGTTGATCACGt < 2:372030/147‑1 (MQ=255) cGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTGGCATGGTGTCTCGGGCGTATTCGATCTCCAGCTGGGTCCCTTGCAGGATCATCTGGGTCGCTTCTTCCTTCATCGCCGCATCCCACAGGTGCGGGTTTTCGATCTTGATCTGGTTGATCACGt < 2:93976/147‑1 (MQ=255) gTTCATGCCCAGCACGCCGCGTggcatgaacgcagcgatgatggaggattacctcaagttcattgctaaccgtcgtttgactcagattggtttgaaagaagagtatccggggactaccaacccgttcccatggatgagcgagatcatg < 1:326636‑M2/148‑127 (MQ=255) gTTCATGCCCAGCACGCCGCGTggcatgaacgcagcgatgatggaggattacctcaagttcattgctaaccgtcgtttgactcagattggtttgaaagaagagtatccggggactaccaacccgttcccatggatgagcgagatcatg < 8:46537‑M2/148‑127 (MQ=255) gTTCATGCCCAGCACGCCGCGTGGCATGGTGTCTCGGGCGTTTTCGATCTCCAGCTGGGTCCCTTGCAGGATCATCTGGGTCGCTTCTTCCTTCATCGCCGCATCCCACAGGTGCGGGTTTTCGATCTTGATCTGGTTGATCACGTCGa < 1:36684/149‑1 (MQ=255) gTTCATGCCCAGCACGCCGCGTGGCATGGTGTCTCGGGCGTATTCGATCTCCAGCTGGGTCCCTTGCAGGATCATCTGGGTCGCTTCTTCCTTCATCGCCGCATCCCACAGGTGCGGGTTTTCGATCTTGATCTGGTTGATCACGTCGa < 3:283369/149‑1 (MQ=255) gcaTGCCacgcggcgtgctgggcatgaacgcagcgatgatggaggattacctcaagttcattgctatccttcgttttactcagattggtttgaaagaagagtatccggggactgccaacccgttcccatggatgagcgagatcatggac < 2:383852‑M1/148‑143 (MQ=255) tGCCacgcggcgtgctgggcatgaacgcagcgatgatggaggattacctcaagttcattgctaaccgtcgtttgactcagattggtttgaaagaagagtatccggggactaccaacccgttcccatggatgagcgagatcatggacttg < 8:233023‑M1/149‑146 (MQ=255) tGCCCAGCACGCCGCGTGGCATGGTGTCTCGGGCGTATTCGATCTCCAGCTGGGTCCCTTGCAGGATCATCTGGGTCGCTTCTTCCTTCATCGCCGCATCCCACAGGTGCGGGTTTTCGATCTTGATCTGGTTGATCACGTCGATAcc > 4:190332/1‑148 (MQ=255) cccAGCACGCCGCGTGGCATGGTGTCTCGGGCGTATTCGATCTCCAGCTGGGTCCCTTGCAGGATCATCTGGGTCGCTTCTTCCTTCATCGCCGCATCCCACAGGTGCGGGTTTTCGATCTTGATCTGGTTGATCACGTCGATACCGaa < 4:286156/149‑1 (MQ=255) ccacgcggcgtgctgggcatgaacgcagcgatgatggaggattacctcaagttcattgctaaccgtcgtttgactcagattggtttgaaagaagagtatccggggactaccaacccgttcccatggatgagcgagatcatggacttga < 6:138121‑M1/148‑147 (MQ=255) ccAGCACGCCGCGTGGCATGGTGTCTCGGGCGTATTCGATCTCCAGCTGGGTCCCTTGCAGGATCATCTGGGTCGCTTCTTCCTTCATCGCCGCATCCCACAGGTGCGGGTTTTCGATCTTGATCTGGTTGATCACGTCGATACCGAAg > 7:84520/1‑149 (MQ=255) cacgcggcgtgctgggcatgaacgcagcgatgatggaggattacctcaagttcattgctaaccgtcgtttgactcagattggtttgaaagaagagtatccggggactaccaacccgttcccatggatgagcgagatcatggacttg > 8:30394‑M1/1‑1 (MQ=255) cacgcggcgtgctgggcatgaacgcagcgatgatggaggattacctcaagttcattgctaaccgtcgtttgactcagattggtttgaaagaagagtatccggggactaccaacccgttcccatggatgagcgagatcatggacttg > 5:336705‑M1/1‑1 (MQ=255) | TTCTCCTTCTTCAAGTCCATGATCTCGCTCATCCATGGGAACGGGTTGGTAGTCCCCGGATACTCTTCTTTCAAACCAATCTGAGTCAAACGACGGTTAGCAATGAACTTGAGGTAATCCTCCATCATCGCTGCGTTCATGCCCAGCACGCCGCGTGGCATGGTGTCTCGGGCGTATTCGATCTCCAGCTGGGTCCCTTGCAGGATCATCTGGGTCGCTTCTTCCTTCATCGCCGCATCCCACAGGTGCGGGTTTTCGATCTTGATCTGGTTGATCACGTCGATACCGAAG > NC_002947/1350595‑1350885 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |