New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1381318 = | 51 (0.820) | 5 (0.080) | 5/254 | NT | 9.3% | coding (69/1065 nt) | dinB | DNA polymerase IV |
? | NC_002947 | 1381373 = | 49 (0.830) | coding (124/1065 nt) | dinB | DNA polymerase IV |
TGTAGCAAGGCAGGTGAGCTGTTTCAAAGCTGGGTGCATGCGATACTATCTGTATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGTCATCGCGGCATGCGCTGAAGCTTTGCCCCGATCTGTTGA > NC_002947/1381170‑1381466 | tgtAGCAAGGCAGGTGAGCTGTTTCAAAGCTGGGTGCATGCGATACTATCTGTATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTgacgac < 3:4748/149‑1 (MQ=255) gCAAGGCAGGTGAGCTGTTTCAAAGCTGGGTGCATGCGATACTATCTGTATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCcgc < 8:49660/149‑1 (MQ=255) cAAGGCAGGTGAGCTGTTTCAAAGCTGGGTGCATGCGATACTATCTGTATGATTTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCcgcg > 7:353292/1‑149 (MQ=255) aGGTGAGCTGTTTCAAAGCTGGGTGCATGCGATACTATCTGTATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGc < 1:189866/149‑1 (MQ=255) aGGTGAGCTGTTTCAAAGCTGGGTGCATGCGATACTATCTGTATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGc < 4:351254/149‑1 (MQ=255) gTGAGCTGTTTCAAAGCTGGGTGCATGCGATACTATCTGTATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCg > 2:363980/1‑149 (MQ=255) gAGCTGTTTCAAAGCTGGGTGCATGCGATACTATCTGTATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCAACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGt > 3:291153/1‑149 (MQ=255) gTTTCAAAGCTGGGTGCATGCGATACTATCTGTATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGccc > 8:278584/1‑149 (MQ=255) tcacggtaggcctcgaagcgcggcttgacgatcaacagatcggggcaaagcttcagcgcatgccgcgatgacatggccgagcgcacaccataggcacgcgcttcatagttgcaggtggcgattacCCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCAt < 1:252487‑M1/24‑1 (MQ=255) cAAAGCTGGGTGCATGCGATACTATCTGTATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATg > 6:253810/1‑149 (MQ=255) gCATGCGATACTATCTGTATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTgggggg > 6:92223/1‑149 (MQ=255) aTGCGATACTATCTGTATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCt > 7:310774/1‑149 (MQ=255) aTGCGATACTATCTGTATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGAGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGCCGGTGGGGGGCt > 3:121167/1‑149 (MQ=255) cGATACTATCTGTATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGc < 1:363980/149‑1 (MQ=255) aTCTGTATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGt > 8:223405/1‑131 (MQ=255) aTCTGTATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGt < 7:223405/131‑1 (MQ=255) gacgatcaacagatcggggcaaagcttcagcgcatgccgcgatgacatggccgagcgcacaccataggcacgcgcttcatagttgcaggtggcgattacCCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCa > 2:252487‑M1/100‑147 (MQ=255) tATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATcgcg > 5:1785/1‑149 (MQ=255) tGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCgg < 8:189922/148‑1 (MQ=255) gAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCgggg > 6:158344/1‑149 (MQ=255) gAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCgggg > 5:103074/1‑149 (MQ=255) aaTTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCgggg > 8:12149/1‑148 (MQ=255) aaTTTACAGTGCTGACGGGCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCCCGGCGCCTGCGATTGTTTCTACGCTGCGTTCGACATGCGGGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCgggg < 8:353292/148‑1 (MQ=255) tttACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTaa > 3:364602/1‑149 (MQ=255) ctgatcggggcaaagcttcagcgcatgccgcgatgacatggccgagcgcacaccataggcacgcgcttcatatttgcaggtggcgattacCCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTaa > 8:260161‑M1/91‑149 (MQ=255) aCAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATc < 8:310774/148‑1 (MQ=255) aCAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATc < 5:381624/148‑1 (MQ=255) aCAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCg > 6:218332/1‑149 (MQ=255) ggTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAAc < 7:278584/149‑1 (MQ=255) gtcCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATg < 3:370709/149‑1 (MQ=255) cATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCCACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGaa < 5:341748/148‑1 (MQ=255) aTGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAgc > 3:70604/1‑149 (MQ=255) cgcAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTa < 5:253810/149‑1 (MQ=255) aatatcatcCACGTCGACTGCGATTGTTTCTAAGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGGCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACAATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATgg < 2:122123/146‑1 (MQ=255) aaGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATgg > 3:181596/1‑149 (MQ=255) aGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGgt > 7:28689/1‑149 (MQ=255) atcatcCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGgtgt < 4:70604/149‑1 (MQ=255) tcatcCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGtgtg < 5:99001/149‑1 (MQ=255) tcatcCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGtgtg > 6:357145/1‑149 (MQ=255) ccACATCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCt > 6:122113/1‑149 (MQ=255) cacaTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTc > 7:38398/1‑149 (MQ=255) cACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTc < 5:92223/149‑1 (MQ=255) cGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCgg < 5:341263/149‑1 (MQ=255) gACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGA‑CCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCAt < 6:144091/148‑1 (MQ=255) cTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGt < 6:103074/149‑1 (MQ=255) aTTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGCCCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGTCATcg > 8:87122/1‑149 (MQ=255) tGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGTCATcgc < 5:158344/148‑1 (MQ=255) tttCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCACCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGTCATCGCgg > 2:218577/1‑148 (MQ=255) acgcgcttcatagttgcaggtggcgattacCCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCggg > 6:381078‑M1/31‑85 (MQ=255) acgcgcttcatagttgcaggtggcgattacCCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCggg < 5:381078‑M1/55‑1 (MQ=255) cTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGTCATCGCGGCATGCGCt > 1:89222/1‑148 (MQ=255) cGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGTCATCGCGGCATGCGCTGa < 5:357145/147‑1 (MQ=255) gATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGTCATCGCGGCATGCGCTGAAGc > 5:68740/1‑149 (MQ=255) cGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGTCATCGCGGCATGCGCTGAAGCttt > 7:81769/1‑149 (MQ=255) gagaTGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGTCATCGCGGCATGCGCTGAAGCttt < 5:218332/148‑1 (MQ=255) gagaTGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGTCATCGCGGCATGCGCTGAAGCTTTg < 5:122113/149‑1 (MQ=255) agaTGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGTCATCGCGGCATGCGCTGAAGCTTTGc > 7:217250/1‑149 (MQ=255) tGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGTCATCGCGGCATGCGCTGAAGCTTTGCCCCGATc > 7:33117/1‑149 (MQ=255) cgacCCGCGCCTGGCCGGGCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGACACCTGCAACTATGAAGCTGGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGTCATCGCGGCATGCGCTGAAGCTTTGCCCCGATCTGt < 4:121167/149‑1 (MQ=255) gacCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGTCATCGCGGCATGCGCTGAAGCTTTGCCCCGATCTGtt < 2:89222/149‑1 (MQ=255) CCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGTCATCGCGGCATGCGCTGAAGCTTTGCTCCGATCTGTTGa < 3:93316‑M1/149‑1 (MQ=255) | TGTAGCAAGGCAGGTGAGCTGTTTCAAAGCTGGGTGCATGCGATACTATCTGTATGAATTTACAGTGCTGACGGTCGTCCATGTCCTTGCGCAAGATCATCCACGTCGACTGCGATTGTTTCTACGCTGCGATCGAGATGCGTGACGACCCGCGCCTGGCCGGTCGCCCCATGGCGGTGGGGGGCTCGCCCGACCATCGCGGGGTAATCGCCACCTGCAACTATGAAGCGCGTGCCTATGGTGTGCGCTCGGCCATGTCATCGCGGCATGCGCTGAAGCTTTGCCCCGATCTGTTGA > NC_002947/1381170‑1381466 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |