New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2267881 = | 51 (0.820) | 3 (0.050) | 3/254 | NT | 5.7% | coding (206/1506 nt) | purF | amidophosphoribosyl transferase |
? | NC_002947 | 2267927 = | 51 (0.860) | coding (252/1506 nt) | purF | amidophosphoribosyl transferase |
CGCTTACGGTCCTCCAGCACCGCGGCCAGGACGCTGCCGGTATCGTGACCAGCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTCGAGCAGTTGGCCAAGGAGATCTACGAGTCC > NC_002947/2267734‑2268026 | ttcagcagcacttccgagtcggagttggtgttgacgtggcgcaggtcggactcgtagatctccttggccaactgctcgacattggtcaggttgccgttgtgagccagggtgatgccgtaaggcgagttgacgtagaacggctgggccTc < 2:187895‑M1/2‑1 (MQ=255) ttcagcagcacttccgagtcggagttggtgttgacgtggcgcaggtcggactcgtagatctccttggccaactgctcgacattggtcaggttgccgttgtgagccagggtgatgccgtaaggcgagttgacgtagaacggctgggccTc < 7:95195‑M1/2‑1 (MQ=255) gcTTACGGTCCTCCAGCACCGCGGCCAGGACGCTGCCGGTATCGTGACCAGCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCg > 7:166391/1‑149 (MQ=255) cagcacttccgagtcggagttggtgttgacgtggcgcaggtcggactcgtagatctccttggccaactgctcgacattggtcaggttgccgttgtgagccagggtgatgccgtaaggcgagttgacgtagaacggctgggccTCGGCCa < 8:94917‑M1/7‑1 (MQ=255) cGGTCCTCAAGCACCGCGGCCAGGACGCTGCCGGTATCGTGACCAGCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCa < 6:295797/148‑1 (MQ=255) ctccAGCACCGCGGCCAGGACGCTGCCGGTATCGTGACCAGCCATGACAGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTgcg < 6:188616/149‑1 (MQ=255) tccAGCACCGCGGCCAGGACGCTGCCGGTATCGTGACCAGCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTGGGCAACATCGGTATCGGCGACGTgcgc > 4:89109/1‑149 (MQ=255) cAGCACCGCGGCCAGGACGCTGCCGGTATCGTGACCAGCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTa > 6:323976/1‑149 (MQ=255) aGCACCGCGGCCAGGACGCTGCCGGTATCGTGACCAGCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTAc > 6:322655/1‑149 (MQ=255) cgcgGCCAGGACGCTGCCGGTATCGTGACCAGCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCCCATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCg > 6:372603/1‑130 (MQ=255) ccGGTATCGTGACCAGCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGAcc > 3:64499/1‑149 (MQ=255) cGGTATCGTGACCAGCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCt > 5:117210/1‑149 (MQ=255) gTATCGTGACCAGCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCg > 3:290391/1‑149 (MQ=255) gTGACCAGCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGcc > 3:114931/1‑147 (MQ=255) tcggactcgtagatctccttggccaactgctcgacattggtcaggttgccgttgtgagccagggtgatgccgtaaggcgagttgacgtagaacggctgggccTCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAg > 7:289423‑M1/103‑149 (MQ=255) tGACCAGCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAg > 8:95195/1‑149 (MQ=255) tGACCAGCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAg < 2:224003/149‑1 (MQ=255) ggactcgtagatctccttggccaactgctcgacattggtcaggttgccgttgtgagccagggtgatgccgtaaggcgagttgacgtagaacggctgggccTCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAgg > 8:139443‑M1/101‑148 (MQ=255) ggactcgtagatctccttggccaactgctcgacattggtcaggttgccgttgtgagccagggtgatgccgtaaggcgagttgacgtagaacggctgggccTCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGc > 7:94917‑M1/101‑149 (MQ=255) aGCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCAc > 2:71375/1‑105 (MQ=255) aGCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCAc < 1:71375/105‑1 (MQ=255) gCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAg < 8:15241/149‑1 (MQ=255) ccATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGc > 7:307536/1‑149 (MQ=255) tGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGt > 4:348156/1‑149 (MQ=255) aCGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGtt < 6:117210/148‑1 (MQ=255) cGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCt < 2:162091/149‑1 (MQ=255) gCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTAc < 2:355331/149‑1 (MQ=255) gCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTAc < 4:290391/149‑1 (MQ=255) ccGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACg < 4:64499/149‑1 (MQ=255) cGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGt < 8:166391/149‑1 (MQ=255) cAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACg < 8:307536/149‑1 (MQ=255) gATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCggg < 6:76264/95‑1 (MQ=255) gATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCggg > 5:76264/1‑95 (MQ=255) aaTGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTAc < 2:327576/126‑1 (MQ=255) aaTGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTAc > 1:327576/1‑126 (MQ=255) tGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCAccc < 4:114931/149‑1 (MQ=255) tGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTcac < 5:323976/149‑1 (MQ=255) gcgACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTCACGGCATCACCCTGGCTCACAAc < 4:50513/149‑1 (MQ=255) aCGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGc < 5:322655/149‑1 (MQ=255) gtTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAAcc > 6:194837/1‑149 (MQ=255) cagcagCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTGCCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGAc > 7:280569/1‑149 (MQ=255) gcCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTc < 7:312248/149‑1 (MQ=255) ccACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGGTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGc > 1:273487/1‑123 (MQ=255) ccACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGc < 2:273487/123‑1 (MQ=255) ccACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTc > 8:225628/1‑148 (MQ=255) aTGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGt > 4:34204/1‑143 (MQ=255) aTGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGt < 3:34204/143‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTCGAGCAGtt > 7:43084/1‑149 (MQ=255) cgcCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTCGAGCAGTTGGc > 2:248534/1‑149 (MQ=255) ccTGGTTGGCAACAGCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTCGAGCAGTTGGcc > 7:329530/1‑148 (MQ=255) tGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTCGAGCAGTTGGCCAAg > 8:160296/1‑149 (MQ=255) gTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTCGAGCAGTTGGCCAAg < 7:302821/147‑1 (MQ=255) gCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTCGAGCAGTTGGCCAAGGAGATc > 1:187895/1‑149 (MQ=255) cAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTCGAGCAGTTGGCCAAGGAGATc > 1:246494/1‑148 (MQ=255) cAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTCGAGCAGTTGGCCAAGGAGATc > 6:168160/1‑148 (MQ=255) aaCATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTCGAGCAGTTGGCCAAGGAGATCTa > 7:286656/1‑149 (MQ=255) aCATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTCGAGCAGTTGGCCAAGGAGATCTAc < 5:194837/149‑1 (MQ=255) cATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTCGAGCAGTTGGCCAAGGAGATCTACg < 2:246494/149‑1 (MQ=255) aTCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTCGAGCAGTTGGCCAAGGAGATCTAc > 2:23043/1‑147 (MQ=255) cGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTCGAGCAGTTGGCCAAGGAGATCTACGAGt > 7:201017/1‑149 (MQ=255) gTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTCGAGCAGTTGGCCAAGGAGATCTACGAGTcc < 1:36354/149‑1 (MQ=255) | CGCTTACGGTCCTCCAGCACCGCGGCCAGGACGCTGCCGGTATCGTGACCAGCCATGACGGCCGGTTGTTCCTGCGCAAGGATAATGGCCTGGTGCGCGACGTGTTCCAGCAGCGCCACATGCAGCGCCTGGTTGGCAACATCGGTATCGGCCACGTGCGCTACCCGACTGCGGGCAGCTCGACCTCGGCCGAGGCCCAGCCGTTCTACGTCAACTCGCCTTACGGCATCACCCTGGCTCACAACGGCAACCTGACCAATGTCGAGCAGTTGGCCAAGGAGATCTACGAGTCC > NC_002947/2267734‑2268026 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |