New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2331588 = | 37 (0.600) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 8.2% | coding (132/1164 nt) | PP_2049 | alcohol dehydrogenase |
? | NC_002947 | 2331635 = | 55 (0.940) | coding (179/1164 nt) | PP_2049 | alcohol dehydrogenase |
CGAACAAGGAGAGTGCGATGCAGCCTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCGGCATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGG > NC_002947/2331440‑2331736 | cGAACAAGGAGAGTGCGATGCAGCCTTTCAGCTTTGCCACCACAGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATc‑gcccgc < 3:73268/149‑1 (MQ=255) cAAGGAGAGTGCGATGCAGCCTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTg < 7:227345/149‑1 (MQ=255) cAAGGAGAGTGCGATGCAGCCTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTg < 7:214877/149‑1 (MQ=255) cAAGGAGAGTGCGATGCAGCCTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTg > 4:207819/1‑149 (MQ=255) gcaaccagcttggccacatccatcgagctgccgccgccgaaccccaccaccaggtcggcgccgatatgccgggcgcgctgggcggccgccagcacgcatgcctcgctggggtcggccgtaacctcactgaagatcgccacaccgaCCtt > 7:278250‑M1/146‑149 (MQ=255) gcaaccagcttggccacatccatcgagctgccgccgccgaaccccaccaccaggtcggcgccgatatgccgggcgcgctgggcggccgccagcacgcatgcctcgctggggtcggccgtaacctcactgaagatcgccacaccgaCCtt > 6:142855‑M1/146‑149 (MQ=255) aaccagcttggccacatccatcgagctgccgccgccgaaccccaccaccaggtcggcgccgatatgccgggcgcgctgggcggccgccagcacgcatgcctcgctggggtcggccgtaacctcactgaagatcgccacaccgaCCTTgg > 4:158270‑M1/144‑149 (MQ=255) aaccagcttggccacatccatcgagctgccgccgccgaaccccaccaccaggtcggcgccgatatgccgggcgcgctgggcggccgccagcacgcatgcctcgctgaggtcggccgtaacctcactgaagatcgccacaccgaCCTTgg < 2:262917‑M1/6‑1 (MQ=255) gTGCGATGCAGCCTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTc < 8:232223/149‑1 (MQ=255) cGATGCAGCCTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGAt < 7:164096/149‑1 (MQ=255) tGCAGCCTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGAc > 3:18584/1‑149 (MQ=255) ccTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTTGAGCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACctg > 1:111265/1‑149 (MQ=255) atccatcgagctgccgccgccgaaccccaccaccaggtcggcgccgatatgccgggcgcgctgggcggccgccagcacgcatgcctcgctggggtcggccgtaacctcactgaagatcgccacaccgaCCTTGGCATGCTCGATGACct < 7:283812‑M1/21‑1 (MQ=255) aGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCAT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTCAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCggg > 3:18468/1‑149 (MQ=255) ccaccaCTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCAc < 1:109076/148‑1 (MQ=255) caccacTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACgg > 2:352907/1‑149 (MQ=255) ccacTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCCGGGTTCACGGCa < 3:207819/149‑1 (MQ=255) ccgaaccccaccaccaggtcggcgccgatatgccgggcgcgctgggcggccgccagcacgcatgcctcgctggggtcggccgtaacctcactgaagatcgccacaccgaCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCa < 3:34635‑M1/40‑1 (MQ=255) gcAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAgg > 2:258832/1‑149 (MQ=255) tCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCTGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGgt < 1:309766/149‑1 (MQ=255) ccaccaggtcggcgccgatatgccgggcgcgctgggcggccgccagcacgcatgcctcgctggggtcggccgtaacctcactgaagatcgccacaccgaCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCg > 4:34635‑M1/100‑149 (MQ=255) accaggtcggcgccgatatgccgggcgcgctgggcggccgccagcacgcatgcctcgctggggtcggccgtaacctcactgaagatcgccacaccgaCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGgt > 8:283812‑M1/98‑149 (MQ=255) aaCCCGGCGCGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATc > 5:18190/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCtt > 2:320730/1‑148 (MQ=255) gcgcGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCTCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGACTTGGCATGCTCGAAGACCTGCTGGCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGt > 5:330676/1‑149 (MQ=255) ggTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTGCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAgg < 7:222567/149‑1 (MQ=255) gCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATCAGCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGAcc > 1:305171/1‑149 (MQ=255) tgCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAgg < 1:352907/148‑1 (MQ=255) tgCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAg < 7:73197/147‑1 (MQ=255) tGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCg > 2:379640/1‑149 (MQ=255) tGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTggcgg < 6:18190/149‑1 (MQ=255) ccAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGgcc < 7:317485/149‑1 (MQ=255) cGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCa < 8:97670/149‑1 (MQ=255) ttttGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAgcgc > 2:183441/1‑149 (MQ=255) ttttGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAgcgc > 4:201271/1‑149 (MQ=255) tttGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAgcgcg > 5:47989/1‑149 (MQ=255) tttGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAgcgcg > 5:53572/1‑149 (MQ=255) aTCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGAGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCTGc < 5:72765/148‑1 (MQ=255) aCCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCGGCATATCGgc > 2:111672/1‑149 (MQ=255) aCCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCGGCATATCGgc < 2:305171/149‑1 (MQ=255) cccGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGTCGCCCAGCGCGCCCGGCATATCGgcg > 2:380568/1‑149 (MQ=255) cccGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCgg > 4:325319/1‑139 (MQ=255) cccGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCgg < 3:325319/139‑1 (MQ=255) ccGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCTCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCGGCATATCGgcgc > 1:262917/1‑149 (MQ=255) ccGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCGGCATATCGgcgc > 2:170266/1‑149 (MQ=255) ccGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCGGCATATCGgcgc > 2:36176/1‑149 (MQ=255) cGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCGGCATATCGGCGcc < 1:379640/149‑1 (MQ=255) gTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCGGCATATCGGCGCCGAc < 4:18584/149‑1 (MQ=255) aTC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCAAGCGCGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCCGCGCGCCCGGGATATCGGCGCCGAcat > 8:333171/1‑147 (MQ=255) gcccgccTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCGGCATATCGGCGCCGACCtggt > 4:378781/1‑149 (MQ=255) cccgccTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCGGCATATCGGCGCCGACCtggtg > 4:282807/1‑149 (MQ=255) cccgccTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCGGCATATCGGCGCCGACCtggtg > 1:62158/1‑149 (MQ=255) cccgccTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCGGCATATCGGCGCCGACCtggtg > 2:80284/1‑149 (MQ=255) cccgccTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGATAACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCGGCATATCGGCGCCGACCtggtg > 1:254533/1‑149 (MQ=255) CCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCGGCATATCGGCGCCGACCtggtggtgg > 2:62158‑M1/1‑149 (MQ=255) | CGAACAAGGAGAGTGCGATGCAGCCTTTCAGCTTTGCCACCACTGCGCAGATCCTCTGCGAACCCGGCGCGGTGCAGCGCCTT‑‑GCAGGTCTGTGCCGTGAGCGCGGTGCCAAGCGTGTTTTGATTATCAGTGACCCGGGTATC‑GCCCGCCTTGGCATGCTCGATGACCTGCTGCCGGGGTTCACGGCAGCCAAGGTCGGTGTGGCGATCTTCAGTGAGGTTACGGCCGACCCCAGCGAGGCATGCGTGCTGGCGGCCGCCCAGCGCGCCCGGCATATCGGCGCCGACCTGGTGGTGG > NC_002947/2331440‑2331736 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |