| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2362107 | 65 (1.050) | 5 (0.090) | 3/252 | NT | 7.3% | coding (1770/2724 nt) | PP_2076 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 2362130 | 66 (1.120) | coding (1747/2724 nt) | PP_2076 | hypothetical protein | |||||
TTGATACCTGGCCTGCGCTGCGTTGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAG > NC_002947/2361959‑2362253 | ttGATACCTGGCCTGCGCTGCGTTGTGGGTTGATGAGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGG > 1:255333‑M1/1‑149 (MQ=255) gATACCTGGCCTGCGCTGCGTTGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACATGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGG < 2:12750‑M1/147‑1 (MQ=255) gATACCTGGCCTGCGCTGCGTTGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGt > 5:240865/1‑149 (MQ=34) tACCTGGCCTGCGCTGCGTTGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGCACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTcg < 2:296675/149‑1 (MQ=25) tACCTGGCCTGCGCTGCGTTGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTcg > 7:38511/1‑149 (MQ=35) tGGCCTGCGCTGCGTTGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGt > 6:29013/1‑149 (MQ=37) ggCCTGCGCTGCGTTGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTg > 3:50507/1‑149 (MQ=37) gCCTGCGCTGCGTTGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTgc < 6:81853/149‑1 (MQ=37) ctgcgctgcgTTGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTgcgc < 6:281726/149‑1 (MQ=37) cgctgcgTTGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCgca < 5:292816/147‑1 (MQ=37) ttGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTgcc > 3:286714/1‑149 (MQ=37) aTGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGcggcaagtgctgcgcaccgcgacccccaaca < 4:228923‑M1/148‑32 (MQ=255) aTGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGcggcaagtgctgcgcaccgcgacccccaaca < 3:245667‑M1/148‑32 (MQ=255) aTGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGcggcaagtgctgcgcaccgcgacccccaaca < 6:130000‑M1/148‑32 (MQ=255) aTGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAAcgc < 4:95955/149‑1 (MQ=39) ggCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGa < 7:311551/148‑1 (MQ=39) cTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGt < 4:45879/149‑1 (MQ=39) gCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAACCCCTGGGGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTAc < 4:242512/149‑1 (MQ=255) cccGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCTAATCTCGCCAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTAcc < 8:257412/149‑1 (MQ=255) cTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTTCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGc < 6:89315/149‑1 (MQ=255) cGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCa < 3:12802/147‑1 (MQ=39) gCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGAGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACAAGGCATACAg > 7:123964/1‑149 (MQ=255) cAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAg < 5:232301/148‑1 (MQ=39) aGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGc < 2:255333/149‑1 (MQ=39) cTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGAGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACAAGGCATACAGGcc > 3:195633/1‑148 (MQ=255) ttCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGa > 6:117325/1‑149 (MQ=39) aCTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGc > 5:16570/1‑149 (MQ=39) aCTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGc < 4:195633/149‑1 (MQ=39) tCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACAAGGCCTACAGGCCGATGCTg > 7:345842/1‑149 (MQ=255) ggCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGcc < 6:42249/149‑1 (MQ=39) gCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCg > 1:197702/1‑149 (MQ=39) gAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGtg > 2:109351/1‑149 (MQ=39) aaTATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAgg < 1:253344/125‑1 (MQ=40) aaTATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAgg > 2:253344/1‑125 (MQ=40) aaTATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGtgc < 8:329955/149‑1 (MQ=39) aaTATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGtgc > 7:248270/1‑149 (MQ=39) atatCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGtgct < 7:146953/149‑1 (MQ=39) atCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGtgctgc > 5:77725/1‑149 (MQ=39) aCAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGGTCtg > 6:244864/1‑149 (MQ=255) aCAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCtg > 4:298359/1‑149 (MQ=39) cAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCtgt < 5:29013/149‑1 (MQ=39) aGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCtgtg > 8:68567/1‑149 (MQ=39) aGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCtgtg > 1:353445/1‑149 (MQ=39) aGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCtgtg < 6:240865/149‑1 (MQ=39) ccGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCt > 4:112112/1‑149 (MQ=40) cGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCtt < 2:353445/149‑1 (MQ=40) cATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCAt < 5:244864/148‑1 (MQ=255) cACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGtt < 4:139332/149‑1 (MQ=255) cACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGt < 3:112112/148‑1 (MQ=255) cACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGt < 3:298359/148‑1 (MQ=255) aCCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAGACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGtt > 1:277283/1‑148 (MQ=255) aCCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGtt > 8:179914/1‑148 (MQ=255) ccGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTTTTCa < 4:50507/149‑1 (MQ=255) ccGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCa > 7:48612/1‑149 (MQ=255) cGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCa > 5:307783/1‑148 (MQ=255) aaGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCAGTTCATa > 6:246102/1‑148 (MQ=255) aGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACa < 1:366948/149‑1 (MQ=255) gAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGAGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAggg > 1:141050/1‑149 (MQ=255) aaCAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGcggcaagtgctgcgcaccgcgacccccaacagca < 8:175972‑M1/85‑35 (MQ=255) aaCAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGcggcaagtgctgcgcaccgcgacccccaacagca > 7:175972‑M1/1‑51 (MQ=255) aaCAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGgt > 2:231127/1‑149 (MQ=255) cAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCTTAGAGGgtgt > 6:20195/1‑149 (MQ=255) gTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGAt < 7:104205/149‑1 (MQ=255) aaaCCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCaaa < 6:77725/149‑1 (MQ=255) tGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCAtt > 4:311402/1‑149 (MQ=255) gTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCAtt < 3:311402/147‑1 (MQ=255) cAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGATGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAg < 4:286714/149‑1 (MQ=255) agcgcgcGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGc < 6:168959/146‑1 (MQ=37) cgcgGTCCATGCTGTTGGTGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTAGGAGGCATACAGGGCGATGCTGTCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGAc < 5:246102/148‑1 (MQ=14) cgcgGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGAc < 5:356848/148‑1 (MQ=40) cgcgGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACa > 3:253444/1‑149 (MQ=255) cATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCAtt > 2:8342/1‑132 (MQ=40) cATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCAtt < 1:8342/132‑1 (MQ=40) tGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccccaacagcatggaccgcgcactgcaccagggtttgcggctgaccttgtt > 7:175972‑M2/1‑34 (MQ=255) tGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccccaacagcatggaccgcgcactgcaccagggtttgcggctgaccttgtt < 8:175972‑M2/85‑52 (MQ=255) cTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCt < 1:231127/149‑1 (MQ=255) tGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccccaacagcatggaccgcgcactgcaccagggtttgcggctgaccttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctgagtgaagctgcacgtagcgggcagcccat < 6:130000‑M2/148‑118 (MQ=255) tGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccccaacagcatggaccgcgcactgcaccagggtttgcggctgaccttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctgagtgaagctgcacgtagcgggcagcccat < 3:245667‑M2/148‑118 (MQ=255) tGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGccccaacagcatggaccgcgcactgcaccagggtttgcggctgaccttgttcgcttcggtgcatgaaacggctgtcgatattcgcctgagtgaagctgcacgtagcgggcagcccat < 4:228923‑M2/148‑118 (MQ=255) ttGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTgg < 7:68567/148‑1 (MQ=255) ggggTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAg < 2:141050/149‑1 (MQ=255) | TTGATACCTGGCCTGCGCTGCGTTGTGGGTTGATGGGCTGCCCGCTACGTGCAGCTTCACTCAGGCGAATATCGACAGCCGTTTCATGCACCGAAGCGAACAAGGTCAGCCGCAAACCCTGGTGCAGTGCGCGGTCCATGCTGTTGGGGGTCGCGGTGCGCAGCACTTGCCGCCCCAACGCGACGTACCAGGCATACAGGCCGATGCTGGCCGTGCTGCTCTGTGCTTGCATCTGTTCATACAGGGTGTTGATGCGCCCAAAGGCATTGGCAGCGACATGGGCTTGCCTGGCAAG > NC_002947/2361959‑2362253 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |