New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 3902382 | 77 (1.240) | 5 (0.080) | 5/254 | NT | 6.1% | coding (556/1209 nt) | PP_3445 | hypothetical protein |
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GGTGGCGCCGGCGATGGCAACGACAGACGCGAACAGCAGCGCCTGCTGTCACTGCTGCTGACCTGGATTGAAACCAGCGGACTCAACCTTTACGCCACCCACCTGAAGAAAGACCTGACCACACAGTTTGCCGAGTTGCGCAGCGTGGCCAGCCGCTATCCGCTGCTGGAGCGGGTGCCCGCCAGCAACTACCTGGAAACCCGCCTGGACATGAAGCACATGATGATGCTCAAGTCCCGCCTGCGCGAAGCCTCTGTGTTCGGCAACCACCGCCGCCACGGTCTGCT > NC_002947/3902244‑3902530 | ggTGGAGCCGGCGATGGGAAAGACAGACGCGAACAGCAGCGCCTGCTGTCACTGCTGCTGACCTGGATTGAAACCAGCGGGCTCGACGTTTACGGGACCCACGTGAAGAAAGCGGTGCCCAGACAGTTTGCCGAGTTGCtggcgggcac > 6:332797‑M1/1‑139 (MQ=255) tGGCGCCGGCGATGGCAACGACAGACGCGAACAGCAGCGCCTGCTGTCACTGCTGCTGACCTGGATTGAAACCAGCGGACTCAACCTTTACGCCACCCACCTGAAGAAAGACCTGACCACACAGTTTGCCGAGTTGCGCAGCGTGGCCa < 5:40679/149‑1 (MQ=255) cGATGGCAACGACAGACGCGAACAGCAGCGCCTGCTGTCACTGCTGCTGACCTGGATTGAAACCAGCGGACTCAACCTTTACGCCACCCACCTGAAGAAAGACCTGACCACACAGTTTGCCGAGTTGCGCAGCGTGGCCAGCCGCTATc < 2:52397/149‑1 (MQ=255) gATGGCAACGACAGACGCGAACAGCAGCGCCTGCTGTCACTGCTGCTGACCTGGATTGAAACCAGCGGACTCAACCTTTACGCCACCCACCTGAAGAAAGACCTGACCACACAGTTTGCCGAGTTGCGCAGCGTGGCCAGCCGCTATcc > 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acactGTTTGCCGAGTTGCGCAGCGTGGCCAGCCGCTATCCGCTGCTGGAGCGGGTGCCCGCCAGCAACTAGCTGGAAAGCCGCCTGGACATGAAGCACATGATGATGCTCAAGTCCCGCCTGCGCGAAGCCTCtgt < 3:347334/137‑1 (MQ=255) acacaGTTTGCCGAGTTGCGCAGCGTGGCCAGCCGCTATCCGCTGCAGGAGCGGGTGCCCGCCAGCAACTACCTGGAAGCCCGCCTGGACATGAAGCACATGATGATGCTGAAGTCCCGCCTCCGCGCACGCTCtgt > 4:347334/1‑137 (MQ=255) acaGTTTGCCGAGTTGCGCAGCGTGGCCAGCCGCTATCCGCTGCTGGAGCGGGTGCCCGCCAGCAACTACCTGGAAACCCGCCTGGACATGAAGCACATGATGATGCTCAAGTCCCGCCTGCGCGAAGCCTCTGTGTTCGGCAaccacc > 8:297944/1‑149 (MQ=255) aGTTTGCCGAGTTGCGCAGCGTGGCCAGCCGCTATCCGCTGCTGGAGCGGGTGCCCGCCAGCAACTACCTGGAAACCCGCCTGGACATGAAGCACATGATGATGCTCAAGTCCCGCCTGCGCGAAGCCTCTGTGTTCGGCAACCAccgc > 6:252787/1‑149 (MQ=255) cGAGTTGCGCAGCGTGGCCAGCCGCTATCCGCTGCTGGAGCGGGTGCCCGCCAgcaactcggcaaactgtgtggtcaggtctttcttcaggtgggtggcgtaaaggttgagtccgctggtttcaatccaggtcagcagcagtgacag < 5:332797‑M2/147‑95 (MQ=255) cGAGTTGCGCAGCGTGGCCAGCCGCTATCCGCTGCTGGAGCGGGTGCCCGCCAGCAACTACCTGGAAACCCGCCTGGACATGAAGCACATGATGATGCTCAAGTCCCGCCTGCGCGAAGCCTCTGTGTTCGGCAACCACCGCCGCCACg > 5:232561/1‑149 (MQ=255) gAGTTGCGCAGCGTGGCCAGCCGCTATCCGCTGCTGGAGCGGGTGCCCGCCAGCAACTACCTGGAAACCCGCCTGGACATGAAGCACATGATGATGCTCAAGTCCCGCCTGCGCGAAGCCTCTGTGTTCGGCAACCACCGCCGCCACgg < 2:78120/149‑1 (MQ=255) ttGCtggcgggcacccgctccagcagcggatagcggctggccacgctgcgcaactcggcaaactgtgtggtcaggtctttcttcaggtgggtggcgtaaaggttgagtccgatggtttcaatccaggtcagcagcagtgacagcaggcg < 2:75323‑M1/149‑146 (MQ=255) gcgcAGCGTGGCCAGCCGCTATCCGCTGCTGGAGCGGGTGCCCGCCAgcaactcggcaaactgtgtggtcaggtctttcttcaggtgggtggcgtaaaggttgagtccgctggtttcaatccaggtcagcagcagtgac > 4:11382‑M2/1‑47 (MQ=255) gcgcAGCGTGGCCAGCCGCTATCCGCTGCTGGAGCGGGTGCCCGCCAgcaactcggcaaactgtgtggtcaggtctttcttcaggtgggtggcgtaaaggttgagtccgctggtttcaatccaggtcagcagcagtgac < 3:11382‑M2/139‑93 (MQ=255) gcgcAGCGTGGCCAGCCGCTATCCGCTGCTGGAGCGGGTGCCCGCCAGCAACTACCTGGAAACCCGCCTGGACATGAAGCACATGATGATGCTCAAGTCCCGCCTGCGCGAAGCctct < 5:156070/118‑1 (MQ=255) gcgcAGCGTGGCCAGCCGCTATCCGCTGCTGGAGCGGGTGCCCGCCAGCAACTACCTGGAAACCCGCCTGGACATGAAGCACATGATGATGCTCAAGTCCCGCCTGCGCGAAGCctct > 6:156070/1‑118 (MQ=255) cgcAGCGTGGCCAGCCGCTATCCGCTGCTGGAGCGGGTGCCCGCCAgcaactcggcaaactgtgtggtcaggtctttcttcaggtgggtggcgtaaaggttgagtccgctggtttcaatccaggtcagcagcagtgacagcaggcgctg < 5:45476‑M2/149‑104 (MQ=255) cgcAGCGTGGCCAGCCGCTATCCGCTGCTGGAGCGGGTGCCCGCCAGCAACTACCTGGAAACCCGCCTGGACATGAAGCACATGATGATGCTCAAGTCCCGCCTGCTCGAAGCCTCTGTGTTCGGCAACCACCGCCGCCACGGTctgc < 2:74739/148‑1 (MQ=255) | GGTGGCGCCGGCGATGGCAACGACAGACGCGAACAGCAGCGCCTGCTGTCACTGCTGCTGACCTGGATTGAAACCAGCGGACTCAACCTTTACGCCACCCACCTGAAGAAAGACCTGACCACACAGTTTGCCGAGTTGCGCAGCGTGGCCAGCCGCTATCCGCTGCTGGAGCGGGTGCCCGCCAGCAACTACCTGGAAACCCGCCTGGACATGAAGCACATGATGATGCTCAAGTCCCGCCTGCGCGAAGCCTCTGTGTTCGGCAACCACCGCCGCCACGGTCTGCT > NC_002947/3902244‑3902530 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |