New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3915087 = | 51 (0.820) | 4 (0.070) | 3/254 | NT | 7.3% | coding (56/1176 nt) | PP_3455 | multidrug RND transporter membrane fusion protein |
? | NC_002947 | 3915136 = | 53 (0.900) | coding (105/1176 nt) | PP_3455 | multidrug RND transporter membrane fusion protein |
TTCACACTTTTTCACACTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCGCGCCACGCACCGCCGAAGT > NC_002947/3914940‑3915234 | ccttcgcggtacacccgcttgagcaccacgcctgcgacccgcgcacgcacttcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtgggtgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGc < 8:244576‑M1/2‑1 (MQ=255) tcACACTTTTTCACACTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGcc > 6:363644/1‑149 (MQ=255) ttcgcggtacacccgcttgagcaccacgcctgcgacccgcgcacgcacttcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGCC‑t < 3:212949‑M1/4‑1 (MQ=255) ttcgcggtacacccgcttgagcaccacgcctgcgacccgcgcacgcacttcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGCC‑t < 7:15599‑M1/4‑1 (MQ=255) cgcggtacacccgcttgagcaccacgcctgcgacccgcgcacgcacttcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGCC‑t > 5:297551‑M1/144‑147 (MQ=255) cTTTTTCACACTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTcc > 1:12900/1‑149 (MQ=255) tttttCACACTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTccc > 4:212949/1‑149 (MQ=255) tttCACACTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCt < 1:183476/148‑1 (MQ=255) cccgcttgagcaccacgcctgcgacccgcgcacgcacttcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGc > 7:360284‑M1/135‑136 (MQ=255) cccgcttgagcaccacgcctgcgacccgcgcacgcacttcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGc < 8:360284‑M1/2‑1 (MQ=255) cacTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCgg < 2:12900/149‑1 (MQ=255) acTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGc > 8:146472/1‑149 (MQ=255) cTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCt < 2:70991/149‑1 (MQ=255) cTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCt < 7:146472/149‑1 (MQ=255) ccTAGAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGc > 2:251653/1‑149 (MQ=255) ccTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGc < 8:157832/149‑1 (MQ=255) tATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAgcgc > 7:257107/1‑149 (MQ=255) aaCAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAg > 3:199814/1‑149 (MQ=255) cgacccgcgcacgcacttcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGc > 8:39353‑M1/114‑149 (MQ=255) aCAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGc < 1:181787/149‑1 (MQ=255) aCAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGc > 6:108372/1‑149 (MQ=255) cAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGcc < 3:293969/149‑1 (MQ=255) cccgcgcacgcacttcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGc > 6:125288‑M1/111‑112 (MQ=255) cccgcgcacgcacttcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGc < 5:125288‑M1/2‑1 (MQ=255) gccCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGc < 8:4550/130‑1 (MQ=255) gccCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGc > 7:4550/1‑130 (MQ=255) gccCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGAc > 8:73538/1‑148 (MQ=255) aGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACa < 1:141896/149‑1 (MQ=255) gcacttcggcggtgcgtggcgcgaggatacggccgctgagttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAgg > 5:297560‑M1/102‑149 (MQ=255) cAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGc < 8:257107/149‑1 (MQ=255) gTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGCTCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGGTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGCCGACCCGGccccc > 4:218495/1‑149 (MQ=255) ttAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTg > 4:112518/1‑100 (MQ=255) ttAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTg < 3:112518/100‑1 (MQ=255) gCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCaa < 4:199814/148‑1 (MQ=255) gCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCaa < 2:183826/148‑1 (MQ=255) acacGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGcgcg > 2:370059/1‑149 (MQ=255) acacGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGcgcg > 2:92170/1‑149 (MQ=255) acGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTa < 8:344825/149‑1 (MQ=255) gTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGa > 6:31572/1‑148 (MQ=255) tcatcaTCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGaaa < 5:91413/149‑1 (MQ=255) atcatcGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAAcc > 8:191167/1‑149 (MQ=255) ggAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCaa > 5:59684/1‑149 (MQ=255) ggAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGATCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCaa > 1:96032/1‑149 (MQ=255) aaGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACt > 1:366232/1‑149 (MQ=255) aGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTg < 5:363644/149‑1 (MQ=255) ttcactgctgatggccagtggctgcagttggagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAgg < 1:35075‑M1/48‑1 (MQ=255) ttcactgctgatggccagtggctgcagttgcagggtttctacgcgcacttgcgcggtggggGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAgg > 2:35075‑M1/62‑109 (MQ=255) aTCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGGC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCa < 7:102685/149‑1 (MQ=255) tGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTg < 1:251653/149‑1 (MQ=255) ccTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTgg < 7:73538/148‑1 (MQ=255) ctactaCCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGcc < 3:108820/149‑1 (MQ=255) cccTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTg < 8:77049/140‑1 (MQ=255) cccTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTg > 7:77049/1‑140 (MQ=255) cccTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATcag > 8:15599/1‑148 (MQ=255) cccTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATca < 1:92170/147‑1 (MQ=255) ccTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCCGTGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCa > 1:85034/1‑133 (MQ=255) ccTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCa < 2:85034/132‑1 (MQ=255) cccGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGaa < 2:366232/148‑1 (MQ=255) cgcCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGcc < 5:108372/148‑1 (MQ=255) gcCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGt < 4:118091/149‑1 (MQ=255) gcTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCgcgc > 7:244576/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCGCGCCACGCa > 5:360058/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCGCGCCACGCa > 5:24226/1‑149 (MQ=255) ccTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCGCGCCACGCAcc > 1:46470/1‑149 (MQ=255) gCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCGCGCCACGCAccgcc > 3:172064/1‑148 (MQ=255) aGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCGCGCCACGCACCGCCGAAgt < 6:59684/149‑1 (MQ=255) | TTCACACTTTTTCACACTCGCCCTACAGGTATTAACAGCCGCCCAGGCAGCGTCTGCCTTAGCATATACACGGTCATCATCGGAAGATCCGCATGCCTACTACCCTCTCCCCGTGCCTGCGCCCGTTGGCGCTCATGGCCTTGCTGAGCC‑TGTCCCTGGCCGGCTGCAGCGACAGCGCCGAGCCAGACGAACAGGCCCCCACCGCGCAAGTGCGCGTAGAAACCCTGCAACTGCAGCCACTGGCCATCAGCAGTGAACTCAGCGGCCGTATCCTCGCGCCACGCACCGCCGAAGT > NC_002947/3914940‑3915234 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |