New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5903771 = | 58 (0.940) | 3 (0.060) | 3/234 | NT | 6.0% | intergenic (+27/+80) | PP_5176/spuH | hypothetical protein/spermidine/putrescine ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 5903831 = | 43 (0.790) | intergenic (+87/+20) | PP_5176/spuH | hypothetical protein/spermidine/putrescine ABC transporter permease |
ATGCGCTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGC > NC_002947/5903623‑5903913 | ggtacttcagccgccaggccgaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacg < 6:357711‑M1/1‑1 (MQ=255) gtacttcagccgccaggccgaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGc > 6:390684‑M1/148‑149 (MQ=255) gtacttcagccgccaggccgaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGc > 8:292941‑M1/148‑149 (MQ=255) tacttcagccgccaggccgaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGcc > 5:283621‑M1/147‑149 (MQ=255) cTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGc < 6:313354/149‑1 (MQ=255) cagccgccaggccgaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGCCCGc > 5:357711‑M1/142‑147 (MQ=255) ccgccaggccgaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCca < 7:291844‑M1/11‑1 (MQ=255) cgccaggccgaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCcac > 3:380339‑M1/138‑149 (MQ=255) aGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCcaca < 7:30307/149‑1 (MQ=255) aGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCca > 3:240662/1‑147 (MQ=255) gAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAgg < 4:325443/149‑1 (MQ=255) caggccgaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAgg > 1:335437‑M1/135‑149 (MQ=255) ccgaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAggg < 2:4359‑M1/16‑1 (MQ=255) ccgaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAggg > 1:4359‑M1/131‑146 (MQ=255) ccgaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAgg > 4:1627‑M1/131‑145 (MQ=255) ccgaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAgg < 3:1627‑M1/15‑1 (MQ=255) agTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTc < 8:45007/149‑1 (MQ=255) gaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAg < 6:180939‑M1/14‑1 (MQ=255) gaagagcgtcgtcgcaaggcgattcagcaggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAg > 5:180939‑M1/129‑142 (MQ=255) tGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCATAAGTATCAGTGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCGCACAGGGCTCACCACAACCCTGa < 2:149306/149‑1 (MQ=255) gTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTg > 4:60739/1‑147 (MQ=255) gTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCCCTCCCACACGGCTCACCAACACCCTg > 3:181845/1‑147 (MQ=255) tAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGaa < 5:126141/148‑1 (MQ=255) tAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAg > 5:281284/1‑149 (MQ=255) cGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCGCATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCtgt < 6:227616/149‑1 (MQ=255) ttgttgCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAAcccg > 2:188352/1‑132 (MQ=255) ttgCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCtg > 1:342790/1‑149 (MQ=255) ttgCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCt < 4:168139/148‑1 (MQ=255) ggcgatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCtgt > 2:196845‑M1/100‑149 (MQ=255) ccAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTgg < 3:60739/149‑1 (MQ=255) ccAATACCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTgg < 6:193296/149‑1 (MQ=255) gatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCtgtg > 5:305516‑M1/97‑147 (MQ=255) gatcgaagagggtgctgcagccaacgcttcgcagccgcaggtcaagcgcccggcgcaggtggctgcgtcggcctgacctggccctttcgcgggcacGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCtgtg < 6:305516‑M1/51‑1 (MQ=255) aaTCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGa < 2:342790/149‑1 (MQ=255) aaTCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGa < 1:69132/149‑1 (MQ=255) tCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGC‑GAGGTCCCTGTGGGAGc < 6:281284/149‑1 (MQ=255) cccTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCtgt‑g < 6:130074/132‑1 (MQ=255) cccTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCtgt‑g > 5:130074/1‑132 (MQ=255) ttGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCtgt > 8:209306/1‑128 (MQ=255) ttGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCtgt < 7:209306/128‑1 (MQ=255) gAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGc < 4:240662/147‑1 (MQ=255) aGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTg < 5:275947/149‑1 (MQ=255) aGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGG‑ACCTCACAGCCTTCAGGGTTGTGGTGAGCCCTGTGGGAGCGGGcat < 2:33184/148‑3 (MQ=17) aGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTACCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGt < 2:111508/148‑1 (MQ=255) gCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTGACCACAACCCTGGAGGCTGT‑GAGGTGCCTGTGGGAGCGGGCGTGccc > 8:238459/1‑149 (MQ=255) gATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgcg > 7:225811/1‑148 (MQ=255) ttGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGaaa < 8:225811/149‑1 (MQ=255) gTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGTTGCGGTTTGGCGTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAgg < 2:101286/148‑1 (MQ=255) tCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATTCCCGCTCCCACAGGGCGCCCCACAACCCAGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGc > 5:221945/1‑149 (MQ=255) tCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATTCCCCCTCCCACACGGCTCACCACAACCCGGAAGGGGGT‑GAGGTCCCAGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGc > 5:296341/1‑149 (MQ=255) tCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGc > 3:290876/1‑149 (MQ=255) aGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCGGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGc > 4:359457/1‑147 (MQ=255) aGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGt < 3:359457/149‑1 (MQ=255) aTCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgc < 5:286690/123‑1 (MQ=255) aTCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCGGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgc > 6:286690/1‑123 (MQ=255) tCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCCCAACCCTGAAGGCGGT‑GAGGTCCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCAAGGGCCCGGTCAGGCCGACGCacc > 4:122810/1‑147 (MQ=38) tCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCGCCCACAGGGCGCACCACCACCCGGAAGGCGGT‑GAGGTGGCGGTGGGGGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCACGGCAGGCCGACGCAGc > 4:85896/1‑149 (MQ=255) ccACTTGGGGATGCGGTATGGCTTTTAATCGGGGCTGGCGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACTGGGCGCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGGGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGGCGCAggt < 6:296341/149‑3 (MQ=38) ccACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAg < 8:352356/147‑1 (MQ=255) ccACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAg > 7:352356/1‑147 (MQ=255) tGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACgccgcccc > 1:206626/1‑138 (MQ=255) tGCGGTATGCCTTTCAACCGGTGCTGGCCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACCGGGCTCACCACAACCCTCACGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCAc < 2:206626/140‑1 (MQ=37) tATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGGTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCt > 5:338459/1‑149 (MQ=255) tGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCGGAAGGCTGT‑GAGGTCCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCCCCTGCGCCGGgcgcgt > 3:11540/1‑146 (MQ=255) cTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGAcc > 3:33094/1‑149 (MQ=255) tCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCGCCCCCCGGGCGCACCACAACCCGGAACGCTGT‑GAGGTGCCGGTGGGCGCGGGCGTGGCCGCGCAAGGGCCCCGTCAGGCCGCCGCCGCCACCTGCGCCGGGCGCGTGACCTGCGGCt > 6:122742/1‑149 (MQ=255) cGGTGCTGGCGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAgg < 3:134997/104‑1 (MQ=255) tGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCGGT‑GAGGTCCCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGc > 6:375415/1‑149 (MQ=255) ccTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACTGGGCGCACCACAACCCTGAAGGCGGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTgg < 6:221945/149‑1 (MQ=255) ccTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTgg < 4:290876/149‑1 (MQ=255) cTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGc > 2:265675/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCt > 8:63275/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTCCCCGCGAAAGCGCCAGGTCCGGCCGCCGCAGCCACATGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGATGCGAAACGTTGGCt > 8:258649/1‑149 (MQ=38) gcgGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTg > 6:190684/1‑147 (MQ=255) gggCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTgcagc < 7:238459/149‑1 (MQ=255) | ATGCGCTGCGGCAGGAAGAGTGTGTGGTTCATGTAGCCCGGTACATTGTTGCCAATCCCTTGAGGGCTGGATTGGTCAGAAGTATCAGGGACTATCCACATTGGGATGCGGTATGGCTTTGAATCGGTGCTGGAGCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGGCTCACCACAACCCTGAAGGCTGT‑GAGGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCAGGTCAGGCCGACGCAGCCACCTGCGCCGGGCGCTTGACCTGCGGCTGCGAAGCGTTGGCTGCAGC > NC_002947/5903623‑5903913 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |