New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1064080 | 53 (0.850) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 5.3% | coding (129/303 nt) | PP_0921 | ArsR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 1064124 | 57 (0.970) | coding (85/303 nt) | PP_0921 | ArsR family transcriptional regulator |
GCCAATCTTCTGGCTGCTGATCAGCCCGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCGGTATATCGCGATAGGGCGAAATATAATTCGCTGAATTCCGAT > NC_002947/1063978‑1064271 | gCCAATCTTCTGGCTGCTGATCAGCCCGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTtg < 8:359666‑M2/149‑3 (MQ=255) gCCAATCTTCTGGCTGCTGATCAGCCCGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTtg < 3:1029‑M2/149‑3 (MQ=255) gCCAATCTTCTGGCTGCTGATCAGCCCGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTt > 2:174181‑M2/1‑147 (MQ=255) cAATCTTCTGGCTGCTGATCAGCCCGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCCCACACACCGGTATCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTtgcc < 8:337698‑M2/149‑5 (MQ=255) cAATCTTCTGGCTGCTGATCAGCCCGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAAACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTtgcc < 7:272290‑M2/149‑5 (MQ=255) aTCTTCTGGCTGCTGATCAGCCCGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTtgccgg > 4:101729‑M2/1‑143 (MQ=255) gctgctGATCAGCCCGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCa < 5:213153/149‑1 (MQ=255) gctgctGATCAGCCCGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCa < 8:21632/149‑1 (MQ=255) tgctgATCAGCCCGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGc > 1:189819/1‑149 (MQ=255) aTCAGCCCGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACt > 2:250294/1‑149 (MQ=255) tCAGCCCGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACt > 3:221231/1‑148 (MQ=255) aGCCCGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGATGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCAG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACt > 3:239225/1‑146 (MQ=255) cccGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGCCGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGaa > 6:314030/1‑149 (MQ=255) cccGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGaa > 6:79346/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAAt < 5:111179/149‑1 (MQ=255) cGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAAtt > 8:104705/1‑149 (MQ=255) cgcgcTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTtct < 5:79346/149‑1 (MQ=255) cAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTg < 2:189819/148‑1 (MQ=255) ggCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGt > 3:197350/1‑149 (MQ=255) gCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGt < 8:292977/148‑1 (MQ=255) gTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCa < 4:221231/149‑1 (MQ=255) agagACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCtt < 4:1029/149‑1 (MQ=255) gaCGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTa > 7:233416/1‑149 (MQ=255) aCGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTAt < 5:314030/149‑1 (MQ=255) tCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGAtt > 8:142071/1‑149 (MQ=255) tGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTtcgtc > 6:53007/1‑149 (MQ=255) gACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCGCAGTAGATGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTtcgtc > 1:121529/1‑148 (MQ=255) gACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTtcgtc > 5:371337/1‑146 (MQ=255) gACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTtcgtc > 2:101820/1‑146 (MQ=255) gCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTg < 6:355695/149‑1 (MQ=255) gCGGTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTGTTCGGTGCTGTGATACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCa < 8:179600/149‑1 (MQ=255) gTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATg < 7:337698/149‑1 (MQ=255) gTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGttt > 6:255974/1‑149 (MQ=255) gATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGa < 7:359666/148‑1 (MQ=255) aTTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAg < 4:335275/148‑1 (MQ=255) aTTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAg > 3:335275/1‑148 (MQ=255) ttGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCt > 1:20295/1‑149 (MQ=255) tGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCt < 8:238691/148‑1 (MQ=255) gCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTtgccgggcaaatcgaccaacgctgcggcctgtcgcagtcgaccgtctctgcccacctggccacgttgcagcgcgccgggctgatcagcagcc > 6:332416‑M2/1‑52 (MQ=255) gCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTtgccgggcaaatcgaccaacgctgcggcctgtcgcagtcgaccgtctctgcccacctggccacgttgcagcgcgccgggctgatcagcagcc < 5:332416‑M2/144‑93 (MQ=255) gCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCg > 2:15647/1‑149 (MQ=255) cccGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGt > 4:56468/1‑149 (MQ=255) cccGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGt > 5:139684/1‑149 (MQ=255) ccGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTtgccgggcaaatcgaccaacgctgcggcctgtcgcagtcgaccgtctctgcccacctggccacgttgcagcgcgccgggctgatcagcagccagaagat < 5:59729‑M2/149‑100 (MQ=255) ccGGCACACACACCGGTTTCGGTGATGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGtt < 4:239225/149‑1 (MQ=255) cacacacCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCg < 8:272290/149‑1 (MQ=255) cacacacCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCg < 6:139684/149‑1 (MQ=255) acacacCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGTCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCgg < 2:27858/149‑1 (MQ=255) acacacCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCgg > 1:14683/1‑149 (MQ=255) acacacCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCgg > 1:120642/1‑149 (MQ=255) acacacCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCg < 3:295768/148‑1 (MQ=255) acacacCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCg > 4:295768/1‑148 (MQ=255) acCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCGGtata > 6:311887/1‑149 (MQ=255) ccGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTg < 4:338791/128‑1 (MQ=255) ccGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTg > 3:338791/1‑128 (MQ=255) ccGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCGGTatat < 3:56468/149‑1 (MQ=255) cGGTGCTGTGGTACTGGGCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCAAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCGGTATATCGCGAt < 4:282618/148‑1 (MQ=255) ggTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCGGTATATCGCGATa < 1:250294/148‑1 (MQ=255) gTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCGGTATATCGCGATAgg > 1:137263/1‑149 (MQ=255) gtgGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCGGTATATCGCGATAGGGCGa > 2:334262/1‑148 (MQ=255) tGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTtcgtc < 2:134567/86‑1 (MQ=255) tGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTtcgtc > 1:134567/1‑86 (MQ=255) tGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCGGTATATCGCGATAGGGCGAAATATAAt < 7:142071/149‑1 (MQ=255) ccG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCGGTATATCGCGATAGGGCGAAATATAATTCGc < 4:197350/149‑1 (MQ=255) aaaCTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCGGTATATCGCGATAGGGCTAAATATAATTCg < 6:322119/144‑1 (MQ=255) aaaCTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCGGTATATCGCGATAGGGCGAAATATAATTCg > 5:322119/1‑144 (MQ=255) gTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGTGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCGGTATATCGCGATAGGGCGAAATATAATTCGCTGAATTCCGat < 2:120642/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCGGTATATCGCGATAGGGCGAAATATAATTCGCTGAATTCCGat < 2:137263/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCGGTATATCGCGATAGGGCGAAATATAATTCGCTGAATTCCGat < 2:14683/149‑1 (MQ=255) | GCCAATCTTCTGGCTGCTGATCAGCCCGGCGCGCTGCAACGTGGCCAGGTGGGCAGAGACGGTCGACTGCGACAGGCCGCAGCGTTGGTCGATTTGCCCGGCACACACACCGTTTTCGGTGCTGTGGTACTGGTCCG‑‑GAAACTGGGTTGCCGGGTCTTTCAGCCAACTGAGAATTTCTCGCCTGACCGGGTGGGCCAGTGCTTTTATGATTTCGTCGAGATCGAGTGGCATGGTTTGAGGCTCGTTGTAGCGGTATATCGCGATAGGGCGAAATATAATTCGCTGAATTCCGAT > NC_002947/1063978‑1064271 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |