New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1733570 = | 67 (1.080) | 5 (0.090) | 5/250 | NT | 7.9% | coding (300/2592 nt) | PP_1526 | beta‑(1‑3)‑glucosyl transferase |
? | NC_002947 | 1733609 = | 53 (0.910) | coding (261/2592 nt) | PP_1526 | beta‑(1‑3)‑glucosyl transferase |
CACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGCGGAACGGCGAATACGAAAAGCCAGAGATCTGTT > NC_002947/1733462‑1733757 | cgaaagcccacagaagggtcagtaccccactgacgacgaaatgcgccaggacctggagcaactgagcaaactgaccgacagcatccgtatctataccgtggaaggcaccCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTgg > 4:109180‑M1/110‑149 (MQ=255) caccaccCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTggg > 7:134492/1‑149 (MQ=255) gaaagcccacagaagggtcagtaccccactgacgacgaaatgcgccaggacctggagcaactgagcaaactgaccgacagcatccgtatctataccgtggaaggcaccCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTggg > 3:228868‑M1/109‑149 (MQ=255) accaccCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGt < 2:31315/149‑1 (MQ=255) caccCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑TCGTCGGCCTGGGTg > 6:266691/1‑148 (MQ=255) cccGCCCCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCt < 8:323797/149‑1 (MQ=255) accacGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCCATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGCGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCAc < 6:281152/149‑1 (MQ=255) ccacGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACg < 1:255814/149‑1 (MQ=255) ccacGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACg > 6:84911/1‑149 (MQ=255) cacGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACgg > 2:113882/1‑149 (MQ=255) cacGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACgg < 3:208580/149‑1 (MQ=255) cacGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACgg < 8:134492/149‑1 (MQ=255) cGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGta < 3:173409/149‑1 (MQ=255) cTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCACCCCTCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGtat < 1:301240/149‑1 (MQ=255) tgtTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATg < 2:197632/149‑1 (MQ=255) gtTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGc > 2:252359/1‑149 (MQ=255) gCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGt < 1:382456/148‑1 (MQ=255) gCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGt < 5:277127/148‑1 (MQ=255) aGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGt > 2:381023/1‑149 (MQ=255) cTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCa < 1:367704/149‑1 (MQ=255) aTGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGttt < 7:197519/149‑1 (MQ=255) aTGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGttt < 5:49329/149‑1 (MQ=255) gTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAg > 8:101883/1‑149 (MQ=255) gCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTg < 8:298840/149‑1 (MQ=255) cAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGc < 5:244209/149‑1 (MQ=255) aaTTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGt < 8:230021/136‑1 (MQ=255) aaTTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGt > 7:230021/1‑136 (MQ=255) tcgcTCGTTGCGCTCCACGTGCGGGGTGATCCATATAACCAGCGTCT‑CCCGCAGCCCGAACACCTCGGCGAGTCGCGGGGTTACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTcc < 1:310125/147‑1 (MQ=255) gcTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGa > 4:197822/1‑114 (MQ=255) gcTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTAGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTcc < 3:17862/149‑1 (MQ=255) tCGTTGAGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCATGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTg > 3:208426/1‑149 (MQ=255) gTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGgc > 6:138820/1‑149 (MQ=255) gTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGGCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGgc < 1:113882/149‑1 (MQ=255) ccGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTcgtcgt > 5:131216/1‑147 (MQ=255) cGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCa < 6:126862/148‑1 (MQ=255) aTCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTa > 6:223221/1‑149 (MQ=255) tCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTAc > 1:338968/1‑149 (MQ=255) atatCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACg > 6:47325/1‑71 (MQ=255) atatCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACg < 5:47325/71‑1 (MQ=255) tCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGAccc < 6:131216/149‑1 (MQ=255) ccccAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTg < 2:351526/117‑1 (MQ=255) ccccAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTg > 1:351526/1‑117 (MQ=255) cccAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCtt > 5:360675/1‑149 (MQ=255) cccAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCtt < 5:84911/149‑1 (MQ=255) ccAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTGCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTc > 6:378361/1‑149 (MQ=255) ccAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTc > 3:55654/1‑149 (MQ=255) cAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCt > 4:32170/1‑149 (MQ=255) ccGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTgg < 4:112628/125‑1 (MQ=255) ccGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTgg > 3:112628/1‑125 (MQ=255) ccGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCttt > 8:137226/1‑149 (MQ=255) ccGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCttt > 7:17750/1‑149 (MQ=255) cGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTc < 4:146641/149‑1 (MQ=255) CAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGc < 5:58642‑M1/149‑1 (MQ=255) cccaggccgacgtcccgcgcctggccgaggagttcggcctgGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTc > 3:228868‑M2/42‑149 (MQ=255) ccaggccgacgtcccgcgcctggccgaggagttcggcctgGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCg > 4:109180‑M2/41‑149 (MQ=255) GCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCa > 8:17750‑M1/1‑149 (MQ=255) GCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCa > 2:338968‑M1/1‑149 (MQ=255) aggccgacgtcccgcgcctggccgaggagttcggcctgGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTggg < 3:166878‑M2/103‑1 (MQ=255) aggccgacgtcccgcgcctggccgaggagttcggcctgGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTggg > 4:166878‑M2/39‑141 (MQ=255) ggccgacgtcccgcgcctggccgaggagttcggcctgGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGcc > 7:366200‑M2/38‑148 (MQ=255) GAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGc > 1:381023‑M1/1‑149 (MQ=255) GAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCAGTCGGTCAGGTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCAGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGc < 1:290703‑M1/149‑1 (MQ=255) tcctcGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGCGGaa > 6:109786/1‑149 (MQ=255) tcGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGAGACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTACAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGCGGAACgg > 4:319097/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGCGGAACGGCGaa < 5:223221/149‑1 (MQ=255) aGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGCGGAACGGCGAATa < 5:109786/149‑1 (MQ=255) gcgGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTGCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGCGGAACGGCGAATACGaa < 5:266691/149‑1 (MQ=255) ggg‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGCGGAACGGCGAATACGaaaa < 3:32170/149‑1 (MQ=255) cgtcgtCATTGGTGCCTTCCACGGTATAGATAGGGTTGCTGTCGTTCAGTTTGCTCTGTTGCTCCAGGTCCTGGAGAATTTCGTCGTCAGTTTGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCTCGCAGGCGGAACTGCGAATACGAAAAGCCa < 4:208426/149‑1 (MQ=255) ggTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGCGGAACGGCGAATACGAAAAGCCAGAGATCTGtt < 5:138820/149‑1 (MQ=255) | CACCACCCGCACCACGCTGCGCGACGTGTTGGCCAGCTGGATGGCCGTGGCAATTTCGCGCTCGTTGCGCTCCAGGTCCGGGCTGATCCATATCCCCAGCGTCA‑CCCGCAGGCCGAACTCCTCGGCCAGGCGCGGG‑‑‑ACGTCGGCCTGGGTGCCTTCCACGGTATAGATACGGATGCTGTCGGTCAGTTTGCTCAGTTGCTCCAGGTCCTGGCGCATTTCGTCGTCAGTGGGGTACTGACCCTTCTGTGGGCTTTCGCCCAGGCGGAACGGCGAATACGAAAAGCCAGAGATCTGTT > NC_002947/1733462‑1733757 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |