New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2711961 = | 57 (0.920) | 3 (0.050) | 3/254 | NT | 5.7% | coding (3143/3708 nt) | metH | cobalamin‑dependent methionine synthase |
? | NC_002947 | 2712007 = | 44 (0.740) | coding (3097/3708 nt) | metH | cobalamin‑dependent methionine synthase |
CTGGTAAGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCTTCTCATCGATCAGCTTGTCGAGCAT > NC_002947/2711861‑2712145 | cTGGTAAGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGgcgc < 4:324785/148‑1 (MQ=255) cTGGTAAGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGgcg > 3:198800/1‑147 (MQ=255) gcgcggtattcggcttctggccggccaaccaggtggacgatgacgacatcgaagtctacggcgaagacggccaggcactggccaccctgcatcacctgcGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCa > 2:234435‑M1/100‑148 (MQ=255) tAAGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTg < 7:149870/149‑1 (MQ=255) aGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGAt > 1:208593/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCTGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCACAGGTGATGc < 6:393218/149‑1 (MQ=255) ttGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAg > 2:115910/1‑149 (MQ=255) cggcttctggccggccaagcaggtggacgatgacgacatcgaagtctacggcgaagacggccaggcactggccaccctgcatcacctgcGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAg < 8:152647‑M1/50‑1 (MQ=255) cggcttctggccggccaaccaggtggacgatgacgacatcgaagtctacggcgaagacggccaggcactggccaccctgcatcacctgcGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAg > 7:152647‑M1/90‑139 (MQ=255) gCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGt < 1:115910/149‑1 (MQ=255) cTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGACACCACCTACGTCGTCGGTAACGCCACTGGCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCGTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGt < 4:108082/148‑1 (MQ=255) cTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTg > 4:115099/1‑149 (MQ=255) tCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGt > 6:257335/1‑147 (MQ=255) tCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGt < 5:257335/147‑1 (MQ=255) gATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGt > 4:40648/1‑149 (MQ=255) tGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCt < 3:40648/149‑1 (MQ=255) ccGGCGGTGGTGATGAAACCAGGTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTACTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCtt < 4:282630/148‑1 (MQ=255) cggcggTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCg < 2:208593/149‑1 (MQ=255) cggcggTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATCCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCg < 1:217261/149‑1 (MQ=255) gcggTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGcc > 4:29880/1‑149 (MQ=255) gtggtcATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTa < 8:314745/149‑1 (MQ=255) tggtgATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACAGTCTTTCGGAGCGAAGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGACTCCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCg > 7:94969/1‑146 (MQ=255) gatgaAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACtt > 1:47314/1‑149 (MQ=255) aaCCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATg > 5:215731/1‑149 (MQ=255) accaccTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATgt > 4:226719/1‑149 (MQ=255) ccaccTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATgtc < 5:287836/149‑1 (MQ=255) cGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATc < 3:322929/148‑1 (MQ=255) tCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCAc > 3:114644/1‑149 (MQ=255) aaCGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGAt > 4:338698/1‑129 (MQ=255) gCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTgg > 2:182402/1‑149 (MQ=255) gCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGACCGTCTTCGCCATAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTgg > 1:130007/1‑149 (MQ=255) aCTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTggccg < 6:215731/149‑1 (MQ=255) aCTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTggccg < 2:47314/149‑1 (MQ=255) tCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTggccggc < 6:183170/147‑1 (MQ=255) tCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTggccggc < 3:115099/147‑1 (MQ=255) gacgaAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTa < 5:367316/99‑1 (MQ=255) gacgaAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTa > 6:367316/1‑99 (MQ=255) acgaAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCCGCTTGATCGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTACGATGTCCTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGCCCAGAAGCTGatcag > 8:26908/1‑145 (MQ=255) aGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATCGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACcgcg > 3:313116/1‑149 (MQ=255) ctgcgccagcagaccatcaagccggacggcaagcccaactggtcgctggcGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCg > 7:152647‑M2/51‑139 (MQ=255) ctgcgccagcagaccatcaagccggacggcaagcccaactggtcgctggcGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGCTTGGCCGGCCAGAAGCCg < 8:152647‑M2/89‑1 (MQ=255) tgcgccagcagaccatcaagccggacggcaagcccaactggtcgctggcGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACcgcgc > 2:234435‑M2/50‑148 (MQ=255) GCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAgc > 3:226719‑M1/1‑149 (MQ=255) CCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAgcg < 2:33292‑M1/149‑1 (MQ=255) GCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTg < 2:256986‑M1/149‑1 (MQ=255) ccAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGAt > 4:233029/1‑147 (MQ=255) ttGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCtt > 4:328730/1‑149 (MQ=255) cTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCTTCTCAt > 5:201418/1‑149 (MQ=255) cTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCATAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCTGATCAGCGCTCGCGCGGTATTCGGCTtctggc < 2:130007/149‑4 (MQ=37) ggCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCTTCTCATCGATCAGCtt > 7:5798/1‑149 (MQ=255) gCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCTTCTCATCGATCAGCTTg > 2:50444/1‑149 (MQ=255) ttGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCTTCTCATCGATCAGCTTGTc > 7:151764/1‑149 (MQ=255) ttGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCTTCTCATCGATCAGCTTGTc < 8:151764/149‑1 (MQ=255) gATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCTTCTCATCGATCAGCTTGTCg < 6:35114/148‑1 (MQ=255) tGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACGTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGGTCAGCTTCTCATCGATCAGCTTGTCGAGc < 1:256986/149‑1 (MQ=255) gTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGCTCAGCTTCTCATCGATCAGCTTGTCGAGCAt > 8:106393/1‑149 (MQ=255) gcAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTggccggc < 6:18675/80‑1 (MQ=255) gcAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTggccggc > 5:18675/1‑80 (MQ=255) | CTGGTAAGCCTTGGCCACTTCCTCGGCACCGATGCCGGCGGTGGTGATGAAACCACCTACGTAGTCGGTAACGCCACTGTCTTTCGGTGCGACGAAGTCGGCCAGCGACCAGTTGGGCTTGCCGTCCGGCTTGATGGTCTGCTGGCGCAGGTGATGCAGGGTGGCCAGTGCCTGGCCGTCTTCGCCGTAGACTTCGATGTCGTCATCGTCCACCTGGTTGGCCGGCCAGAAGCCGAATACCGCGCGAGCGCTGATCAGCTTCTCATCGATCAGCTTGTCGAGCAT > NC_002947/2711861‑2712145 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |