| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4780240 = | 66 (1.060) | 5 (0.090) | 4/252 | NT | 7.4% | coding (7074/7887 nt) | pvdJ | non‑ribosomal peptide synthetase |
| ? | NC_002947 | 4780277 = | 63 (1.070) | coding (7037/7887 nt) | pvdJ | non‑ribosomal peptide synthetase | |||||
AGGTCGCCACTGCGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGTGCACGGAGCTTGCGTCATCACGCACGCGGTACAGCGCCACGTCGTCGGAACACTCCGCCGGGCCGTAGGCGTTGACCAGTTC > NC_002947/4780130‑4780425 | gacgtggcgctgtaccgcgtgcgtgatgacgcaagctccgtgcacctgccgatcggtgccgcgaccgagcacaaccgcctgcatgtgctcaacgacctgctcgaaccgatGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAt > 8:95663‑M1/111‑149 (MQ=255)gacgtggcgctgtaccgcgtgcgtgatgacgcaagctccgtgcacctgccgatcggggccgcgaccgagcacaaccgcctgcatgtgctcaacgacctgctcgaaccgatGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAt > 7:95341‑M1/111‑149 (MQ=255)aGGTCGCCACTGCGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCAt > 6:389139/1‑149 (MQ=255) gCCACTGCGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGtt < 3:116783/149‑1 (MQ=255) gCCACTGCGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGG‑CACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTc > 5:299667/1‑149 (MQ=255) gcgctgtaccgcgtgcgtgatgacgcaagctccgtgcacctgccgatcggtgccgcgaccgagcacaaccgcctgcatgtgctcaacgacctgctcgaacctacGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGtt > 6:41055‑M1/105‑148 (MQ=255) cGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGc < 5:69835/147‑1 (MQ=255) cGGTACAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAg < 8:41548/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGG‑CACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGtt < 6:299667/149‑1 (MQ=255) aGGCGCTCACCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCACACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGGCGtt < 5:392134/149‑1 (MQ=255) aCCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGc > 4:1562/1‑145 (MQ=255) aCCCGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGc < 3:1562/145‑1 (MQ=255) cccGGGCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATg < 6:172598/149‑1 (MQ=255) gggCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGc < 5:42106/141‑1 (MQ=255) gggCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGc > 6:42106/1‑141 (MQ=255) gggCGGCTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAg > 3:113948/1‑149 (MQ=255) gcaagctccgtgcacctgccgatcggtgccgcgaccgagcacaaccgcctgcatgtgctcaacgacctgctcgaaccgatGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCAGCATCGGTTc < 1:245388‑M1/45‑1 (MQ=255) gcaagctccgtgcacctgccgatcggtgccgcgaccgagcacaaccgcctgcatgtgctcaacgacctgctcgaaccgatGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCAGCATCGGTTc > 2:245388‑M1/81‑125 (MQ=255) ggcggcTGGCGAACGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAgg > 5:198605/1‑149 (MQ=255) 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aaCGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTc < 4:207513/149‑1 (MQ=255) aCGGATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGATCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCg < 1:252879/149‑1 (MQ=255) gATCGGGGACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTc < 5:321941/149‑1 (MQ=255) gggACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCgg > 4:196823/1‑148 (MQ=255) gggACAAAGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGc > 2:354782/1‑149 (MQ=255) aaaGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTtgt > 4:6968/1‑131 (MQ=255) aaaGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTtgt < 3:6968/131‑1 (MQ=255) aaaGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGa > 2:340314/1‑149 (MQ=255) aaGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGAt > 6:138792/1‑149 (MQ=255) aGCTCAATGCCGTGCGCACCGGATACCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATc > 8:312512/1‑149 (MQ=255) cTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCgg < 3:196823/149‑1 (MQ=255) cTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCgg > 6:128594/1‑149 (MQ=255) cTCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCgg > 4:213977/1‑149 (MQ=255) tCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGa < 2:195163/144‑1 (MQ=255) tCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGa > 1:195163/1‑144 (MQ=255) tCAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCgg > 2:125132/1‑148 (MQ=255) cAATGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCgg > 4:170521/1‑147 (MQ=255) aaTGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAg < 7:312512/149‑1 (MQ=255) aaTGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAg > 4:294224/1‑149 (MQ=255) tGCCGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTCGAGCAGGTCGTTGAGCACATGCAGGCGGTTGTGCTCGGTCGCGGCACCGATCGGCAGGt > 1:93166/1‑149 (MQ=255) cGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTc < 2:40060/87‑1 (MQ=255) cGTGCGCACCGGATCCCCAAGGTAACCGCGCCCGACACCTACGCCGGCCACATGCAACTCGCCGGTGGCCCGGGCCGGCATCGGTTc > 1:40060/1‑87 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |