New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5943452 = | 65 (1.050) | 4 (0.070) | 4/252 | NT | 6.4% | coding (838/978 nt) | PP_5210 | alcohol dehydrogenase |
? | NC_002947 | 5943500 = | 55 (0.940) | coding (886/978 nt) | PP_5210 | alcohol dehydrogenase |
CTGGCGGCCAACCTGGTGCTGCTCAAGGGCGCGGCGGTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTT > NC_002947/5943353‑5943648 | cTGGCGGCCAACCTGGTGCTGCTCAAGGGCGCGGCGGTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTc < 5:287513/149‑1 (MQ=255) ccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagtctgcgaCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCg < 7:44324‑M1/51‑1 (MQ=255) ccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagtctgcgaCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCg > 8:44324‑M1/96‑146 (MQ=255) ccAACCTGGTGCTGCTCAAGGGCGCGGCGGTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACt < 1:64346/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTGCTGCTCAAGGGCGCGGCGGTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCa < 2:191862/142‑1 (MQ=255) aCCTGGTGCTGCTCAAGGGCGCGGCGGTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCa > 1:191862/1‑142 (MQ=255) aCCTGGTGCTGCTCAAGGGCGCGGCGGTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACatat > 7:81330/1‑149 (MQ=255) tgctgcTCAAGGGCGCGGCGGTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTg < 2:245440/149‑1 (MQ=255) ctgctCAAGGGCGCGGCGGTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGc < 5:210801/149‑1 (MQ=255) ctCAAGGGCGCGGCGGTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAg > 1:312405/1‑148 (MQ=255) ctCAAGGGCGCGGCGGTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTATCGCAGACTTATCCACTGGCAg < 2:96920/148‑1 (MQ=255) tCAAGGGCGCGGCGGTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAg > 7:42070/1‑147 (MQ=255) aaGGGCGCGGCGGTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGaa < 2:32944/147‑1 (MQ=255) ggCGCGGCGGTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCg < 7:88029/148‑1 (MQ=255) ggCGCGGCGGTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCg > 8:88029/1‑148 (MQ=255) gcggcgGTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGt < 3:169761/149‑1 (MQ=255) ggcggTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTg < 5:301881/149‑1 (MQ=255) ggcggTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTg < 4:220840/149‑1 (MQ=255) tACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCGCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATc > 5:129314/1‑149 (MQ=255) tACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGGGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATc < 6:10920/149‑1 (MQ=255) ggCTTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCTCCAGCCGGAGGACATCGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGTGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGTGGTTGCTATCgag < 8:81330/147‑1 (MQ=255) ggCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGtt < 6:10740/138‑1 (MQ=255) ggCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGtt > 5:10740/1‑138 (MQ=255) ggCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCgaga < 3:98171/148‑1 (MQ=255) ggCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCgag > 8:78286/1‑147 (MQ=255) gtgtgtTCTGCGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACCCGGCCAACTTCCACCAGCTGAATGCCTGGC‑AAGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATACACTGGCAGAAGCCGGGCTTGCTAACgag > 4:81317/3‑146 (MQ=255) gCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAg > 5:151156/1‑149 (MQ=255) gtgtTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAACTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCt > 1:307284/1‑149 (MQ=255) tCTGGGGGGCATTTGCCGAGCGCCAGGCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCACCCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGCTGGCTAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAACCTggg < 7:343832/148‑1 (MQ=255) tCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTggg < 3:81317/148‑1 (MQ=255) tGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGc > 7:43389/1‑148 (MQ=255) gggggCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCaa < 4:365800/148‑1 (MQ=255) aggggCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCTGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAAc < 8:15564/148‑1 (MQ=255) gggCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACgg > 6:38266/1‑149 (MQ=255) cATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAg < 8:42070/149‑1 (MQ=255) cccAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCtgt < 5:250551/148‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACAGCAGGCTGTgg > 2:287501/1‑149 (MQ=255) aaccccggcttctgccagtggataagtctgcgaCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGgtgt > 7:237682‑M1/34‑82 (MQ=255) aaccccggcttctgccagtggataagtctgcgaCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGgtgt < 8:237682‑M1/49‑1 (MQ=255) gccatgcGGAGGACAACGCGGCGAACTTCCACCATCTGTTTGCCTGGC‑ATGCAGATGGGAATTTGAAGCGGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGGCGGGGTTGCTATCGTGAAGCTGTGGCAACGGCAGGCTTTGGGTaa < 7:195964/142‑1 (MQ=255) gcCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAg > 5:196199/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGGAGGAAAACGAGGCCAACTTCCACCAGATGTTTGCCTGGC‑ATGCATAGCGCAACTAGAAGCCTCTGGTGTCGAAGACTTATACACTGTCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGTTCAACTGCAGGCTGTGGGaaata > 8:195964/1‑147 (MQ=255) aggaCAACCCGGCCACCTTCCACCCGCTGTCAGCCTGCC‑CTGCCGAGGGCAAGGTGACGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGCAGCCGGGGTTGCTATCGACAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGgcggtg < 6:129314/149‑1 (MQ=255) gaCAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCt > 5:132429/1‑149 (MQ=255) aaCGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTGGGTGGTGCTGGc > 6:207003/1‑149 (MQ=255) aCGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGc > 7:123398/1‑148 (MQ=255) ggCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAgg > 3:145199/1‑148 (MQ=255) cAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGCGATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGt > 1:203266/1‑147 (MQ=255) ttCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGc < 8:97323/86‑1 (MQ=255) ttCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGc > 7:97323/1‑86 (MQ=255) ttCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAg > 6:12629/1‑149 (MQ=255) cgacaccagcggcttcaacttgccctcggcatgccaggcaaacagctggtgTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAgg < 7:44324‑M2/95‑1 (MQ=255) cgacaccagcggcttcaacttgccctcggcatgccaggcaaacagctggtgTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAgg > 8:44324‑M2/52‑146 (MQ=255) acaccagcggcttcaacttgccctcggcatgccaggcaaacagctggtgTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGtt > 7:237682‑M2/50‑82 (MQ=255) acaccagcggcttcaacttgccctcggcatgccaggcaaacagctggtgTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGtt < 8:237682‑M2/33‑1 (MQ=255) CACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTa > 4:145199‑M1/1‑148 (MQ=255) ACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGc > 7:78286‑M1/1‑149 (MQ=255) ACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGc < 4:38949‑M1/149‑1 (MQ=255) CCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCg > 5:29031‑M1/1‑149 (MQ=255) ccTGGC‑ATGCCGATGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTcgc < 2:203266/148‑1 (MQ=255) ccTGGC‑ATGCCGAGGGCTAGTTGAAGCGGCGGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTcgc < 2:307284/148‑1 (MQ=255) ccTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTcgc < 2:312405/148‑1 (MQ=255) cTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCgg < 6:132429/149‑1 (MQ=255) cTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCgg < 5:12629/149‑1 (MQ=255) aTGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTaaa > 3:221839/1‑149 (MQ=255) ccGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAAccc > 4:67120/1‑149 (MQ=255) ccGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAAccc > 7:168366/1‑149 (MQ=255) gAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc < 2:315360/149‑1 (MQ=255) ggCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTcc > 4:61527/1‑149 (MQ=255) gAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGc < 8:123398/148‑1 (MQ=255) tCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGtt < 5:38266/149‑1 (MQ=255) | CTGGCGGCCAACCTGGTGCTGCTCAAGGGCGCGGCGGTACTGGGCGTGTTCTGGGGGGCATTTGCCCAGCGCCAGCCGGAGGACAACGCGGCCAACTTCCACCAGCTGTTTGCCTGGC‑ATGCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTT > NC_002947/5943353‑5943648 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |