| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,580,599 | C→A | 6.1% | Q943H (CAG→CAT) ‡ | treSB ← | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,580,599 | 0 | C | A | 6.1% | 213.2 / 3.7 | 66 | Q943H (CAG→CAT) ‡ | treSB | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/32); new base A (2/2); total (32/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.88e-01 | |||||||||||
CTTGTAAGGGCTGTGTTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGCTGATC > NC_002947/4580452‑4580740 | cTTGTAAGGGCTGTGTTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCt > 5:346903/1‑149 (MQ=255) gTAAGGGCTGTGTTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCtg < 2:290714/147‑1 (MQ=255) aaGGGCTGTGTTTTGCGCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCACTCTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCtgct‑t > 1:286625/1‑149 (MQ=255) gggCTGTGTTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCtgct‑tgct > 1:216093/1‑149 (MQ=255) gCTGTGTTTTGCGCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCa < 2:286625/149‑1 (MQ=255) cTGTGTTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAg < 1:169229/149‑1 (MQ=255) tgtgGTTTGCCCGACGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAgg < 2:287551/149‑1 (MQ=255) ttgtTTTGCCCGGCTCTCTTCAAGGGGACGGTCGGGTTCAC‑CTTCAAAATCGATTAGGTAGGCATCACCCTGCACAACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCTCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCAAGCA‑GGCTCAgg < 4:87981/147‑1 (MQ=255) tgtTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGgt < 1:63691/149‑1 (MQ=255) tgtTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCAAGCA‑GGCTCAggg < 3:309710/148‑1 (MQ=255) ggtTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGTGCCGGGCGGGTTCAC‑CTTCAATATCGTTGAGGTAGGCATCACCCTGCACGACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTAGACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGgt < 4:91626/148‑1 (MQ=255) cccGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGAtg > 5:12591/1‑149 (MQ=255) cGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCACAGGGTGTCGAtgtg > 7:344993/1‑149 (MQ=255) ggCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGc < 3:177977/149‑1 (MQ=255) ttCAAGGGGCCGGGCGGGTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGc < 2:329276/147‑1 (MQ=255) cAAGGGGCCGGGCGGGTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGcc < 2:234490/146‑1 (MQ=255) cAAGGGGCCGGGCGGGTTCAA‑CTTCAAAATCGATGAGGTAAGAATCACCCTGAACCACCAGCACCTGTCCCAGGTGAAGGTCCCCGAGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTCAGCCTCCT‑TGCTCAGGATGTCGATGTGCTGGGCCAgg > 6:150518/1‑149 (MQ=255) gTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCTATGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTtg < 1:271056/149‑1 (MQ=255) gTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTtgc > 8:230378/1‑149 (MQ=255) cTTCATAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCAGCGTGAGCCTGCT‑TGCTGAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGTCCGTCACGCTGTTGCTGCAgg < 5:150518/149‑1 (MQ=255) aaaTCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGgtcgtc > 4:261509/1‑149 (MQ=255) aaaTCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGgtcgtc < 6:12591/149‑1 (MQ=255) aaTCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGgtcgtc > 3:54541/1‑148 (MQ=255) gATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGAcc < 2:216093/148‑1 (MQ=255) tGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAg < 7:230378/149‑1 (MQ=255) tAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTg < 7:279479/149‑1 (MQ=255) aGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTgg > 6:68870/1‑149 (MQ=255) cATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTa > 6:188476/1‑149 (MQ=255) aTCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTAt > 5:376930/1‑149 (MQ=255) aTCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGAGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTAt > 1:340696/1‑149 (MQ=255) tCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCTAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATc < 6:346903/149‑1 (MQ=255) ccTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCg > 1:290203/1‑146 (MQ=255) ccTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCg < 2:290203/146‑1 (MQ=255) accacGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAgg < 1:65816/117‑1 (MQ=255) accacGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAgg > 2:65816/1‑117 (MQ=255) cacGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAg < 1:241720/127‑1 (MQ=255) cacGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAg > 2:241720/1‑127 (MQ=255) ctgCACCTGGGCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAgtgtgt > 3:376997/3‑149 (MQ=255) cACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTcgc < 5:68870/149‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACAGGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAgt < 5:278458/139‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGAt > 4:10593/1‑149 (MQ=255) cTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGAt > 2:323330/1‑149 (MQ=255) cTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTAACGCTGTTGCTGAAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCTgt > 6:278458/1‑139 (MQ=255) ccAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTgg > 4:241088/1‑149 (MQ=255) ccAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTgg < 4:232844/149‑1 (MQ=255) ccAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGGGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGCCCAAGGCCTGGCTAGCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTgg > 4:249145/1‑149 (MQ=255) gCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCcag > 8:103796/1‑148 (MQ=255) cAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCcagca < 3:350118/149‑1 (MQ=255) aGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCcagcag < 4:99604/149‑1 (MQ=255) ccGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAg > 4:102726/1‑149 (MQ=255) ccGTCTACACGCATAAGCAGGCCACCCTCAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAg > 6:338350/1‑149 (MQ=255) cacGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTgg < 4:54541/149‑1 (MQ=255) cacGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTgg < 4:376997/149‑1 (MQ=255) cacGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTgg > 7:341305/1‑149 (MQ=255) cacGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTgg < 3:10593/149‑1 (MQ=255) acGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTggg < 7:103796/149‑1 (MQ=255) cGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGt < 6:376930/149‑1 (MQ=255) gCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTg < 6:5551/124‑1 (MQ=255) gCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGt > 8:32967/1‑148 (MQ=255) aTAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGtcag > 3:18156/1‑149 (MQ=255) aaGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGAGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGtcagtt < 2:340696/149‑1 (MQ=255) cAGGCCACCGTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGtcagttcag < 5:338350/149‑1 (MQ=255) ggCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTg > 2:107499/1‑149 (MQ=255) gCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGc > 4:100268/1‑149 (MQ=255) acACCCTGAGCAAGCA‑GGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGCt > 8:90332/2‑149 (MQ=255) ccTGAGCAAGCA‑GGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGCTGATc > 3:72975/1‑149 (MQ=255) | CTTGTAAGGGCTGTGTTTTGCCCGGCGCTCTTCAAGGGGCCGGGCGGGTTCAC‑CTTCAAAATCGATGAGGTAGGCATCACCCTGCACCACGAGCACCTGGCCCAGGTGCAGGTCGCCGTGTACACGCATAAGCAGGCCACCCTGAGCCTGCT‑TGCTCAGGGTGTCGATGTGCTGGGCCAGGCCGTCACGCTGTTGCTGCAGGTCGTCGACCAAGGACTGGCTATCGCTGTCCAGTGTGTCGCGATGCTGGGCCAGCAGGTCGAGGGCGTGGGTCAGTTCAGTGCTGATC > NC_002947/4580452‑4580740 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |