| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,666,503 | T→C | 5.0% | M90T (ATG→ACG) | nuoL → | NADH‑quinone oxidoreductase subunit L |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,666,503 | 0 | T | C | 5.0% | 300.8 / 2.6 | 98 | M90T (ATG→ACG) | nuoL | NADH‑quinone oxidoreductase subunit L |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (44/49); new base C (3/2); total (47/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGCCGCCACGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACCTGCT > NC_002947/4666357‑4666650 | ggCCGCCACGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGc > 5:293988/1‑149 (MQ=255) cgccACGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCg > 1:240408/1‑149 (MQ=255) ccACGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGc > 6:334483/1‑149 (MQ=255) aCGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCgt > 3:329551/1‑149 (MQ=255) cGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCgtg < 5:304524/149‑1 (MQ=255) gccgccTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCgtggt < 6:292647/149‑1 (MQ=255) gccgccTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCgtggt < 6:425/149‑1 (MQ=255) cgccTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGTGCGTCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGTCGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCACGCCGAGCATGGTGa < 7:74879/149‑1 (MQ=255) gccTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGAc > 1:271773/1‑149 (MQ=255) gccTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGAc < 6:293988/149‑1 (MQ=255) cTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCg < 7:138344/149‑1 (MQ=255) cTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCg < 4:369518/149‑1 (MQ=255) cTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCg < 4:75336/149‑1 (MQ=255) cGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCGCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGgtg > 3:44948/1‑149 (MQ=255) cGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCGCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGCCGGTCAGCACGCCGAGCATGGTGACCgaca < 6:215315/149‑4 (MQ=255) cGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGgtg < 8:83656/149‑1 (MQ=255) cATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCg > 8:73604/1‑149 (MQ=255) tCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGc > 1:369569/1‑149 (MQ=255) tGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCtt > 7:160443/1‑149 (MQ=255) ggCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTc > 7:75383/1‑149 (MQ=255) aaCGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTc < 3:90008/135‑1 (MQ=255) aaCGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTc > 4:90008/1‑135 (MQ=255) aaCGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATcc < 8:75383/148‑1 (MQ=255) gTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCt < 4:361125/149‑1 (MQ=255) gTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCt < 7:73604/149‑1 (MQ=255) tCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑AGATCCCCCTg > 5:105599/1‑149 (MQ=255) gCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGAGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGtt > 8:39935/1‑149 (MQ=255) ccccGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTc < 5:181257/149‑1 (MQ=255) ccccGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTc < 8:319046/149‑1 (MQ=255) ccGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCg > 2:3190/1‑148 (MQ=255) gggCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCTGCGTGGTGAGCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGt < 7:39935/149‑1 (MQ=255) gggCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGt < 8:160443/149‑1 (MQ=255) ggcggcGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTa < 2:310247/149‑1 (MQ=255) gcggcgCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTAc < 6:102673/149‑1 (MQ=255) gcggcgCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTAc < 5:334483/149‑1 (MQ=255) ggcgCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCgg < 2:283077/116‑1 (MQ=255) ggcgCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCgg > 1:283077/1‑116 (MQ=255) cgTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGt > 1:33647/1‑149 (MQ=255) cgTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGt < 1:250620/149‑1 (MQ=255) tACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTgg < 7:219068/149‑1 (MQ=255) tACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTgg < 2:240408/149‑1 (MQ=255) gccagcTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGaa < 2:341718/149‑1 (MQ=255) ccagcTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAg > 3:47488/1‑149 (MQ=255) ccagcTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAg > 5:102857/1‑149 (MQ=255) cagcTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGc < 3:238142/149‑1 (MQ=255) ctgctgTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCgg < 1:182453/149‑1 (MQ=255) ctgctgTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCgg < 4:47488/149‑1 (MQ=255) ctgctgTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCgg < 4:44948/149‑1 (MQ=255) tgctgTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTgg > 4:56140/1‑139 (MQ=255) tgctgTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTgg < 3:56140/139‑1 (MQ=255) tgctgTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGc > 7:308731/1‑149 (MQ=255) gCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAGCTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTcgc > 7:24163/1‑149 (MQ=255) cAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTcgcg > 8:78555/1‑149 (MQ=255) gTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCAc < 4:114385/103‑1 (MQ=255) gTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTAGGCTTCC‑TGATCCAc > 3:114385/1‑103 (MQ=255) tGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCttcttc < 5:383193/149‑1 (MQ=255) gTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGAATCCGGTGTCGGCTTCCAGGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTCCATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCttcttc > 1:316012/1‑149 (MQ=255) gACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTacac < 4:329551/149‑1 (MQ=255) ggCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACTATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCaa > 8:35146/1‑149 (MQ=255) cTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAAcc > 4:188531/1‑149 (MQ=255) gcCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTc > 6:62637/1‑148 (MQ=255) gcCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCa > 8:6867/1‑149 (MQ=255) cGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATc < 1:3190/149‑1 (MQ=255) aaCTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGc < 7:78555/149‑1 (MQ=255) aCTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGcc < 1:154254/149‑1 (MQ=255) ttCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAg > 3:302856/1‑149 (MQ=255) cACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTg < 7:95542/95‑1 (MQ=255) cACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTg > 8:95542/1‑95 (MQ=255) cACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGc < 5:62637/148‑1 (MQ=255) cACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCa > 5:231732/1‑149 (MQ=255) aCCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCAt > 7:82334/1‑149 (MQ=255) tACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTg < 8:82334/147‑1 (MQ=255) aCCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGATCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCATGGTACAAGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGAGCATCTTCTCGTACACCAACCTGATCAACGCCAGCatgatgat > 4:36211/1‑146 (MQ=255) ccTGGTCGGCCTGTCGTTCACCATGCTCGGCGTTGTGAGCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTc < 3:36211/148‑1 (MQ=255) ccTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTcc < 2:33647/149‑1 (MQ=255) ccTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTcc > 4:264562/1‑149 (MQ=255) cTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCt > 4:134189/1‑149 (MQ=255) cTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCt > 5:41259/1‑149 (MQ=255) cTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCt < 4:302856/149‑1 (MQ=255) gACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGa < 6:231732/148‑1 (MQ=255) aCGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGcttc > 5:91008/1‑104 (MQ=255) aCGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGcttc < 6:91008/104‑1 (MQ=255) gacaccGGTCACCACGCCGAGCATGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTg > 6:47313/6‑149 (MQ=255) cTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTgg < 3:134189/149‑1 (MQ=255) cTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTgg > 6:68965/1‑149 (MQ=255) tGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGc > 5:60312/1‑149 (MQ=255) tCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGa > 2:202147/1‑149 (MQ=255) cGGTCACCACGCCGAGCATGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGa > 8:229215/1‑148 (MQ=255) ggTCACCACGCCGAGCATGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑AGATCCACCTCTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATACTTGGCGAt > 5:7090/1‑148 (MQ=255) gTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCGCGTACACCACCCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATaa > 7:176552/1‑149 (MQ=255) tCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAAc < 2:316012/149‑1 (MQ=255) tCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAAc < 2:271773/149‑1 (MQ=255) ccATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATg < 4:52802/122‑1 (MQ=255) ccATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATg > 3:52802/1‑122 (MQ=255) cATGCTCGTCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCA‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTTGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTAGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCttt < 7:340314/137‑2 (MQ=255) cATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACctgc > 3:167831/1‑149 (MQ=255) cATGCTCGGCGTGGTGAACGGTGTCGGCTTAC‑TGATCCACCTGTTCGCATCATGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTAATCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTCTTAATCGCCAGCAAGCTGTTCCTGATCCTTGGAGAtcgcaaga > 8:340314/1‑142 (MQ=255) aTGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACctgct < 6:60312/149‑1 (MQ=255) | GGCCGCCACGGCCGCCTACGTCATCTGGCAGTTCAACGTCGCCCCGCCTGAGGGCGGCGCGTACAGCCAGCTGCTGTGGCAGTGGATGTCGGTGGACGGCTTCGCGCCGAACTTCACCCTGTACCTGGACGGCCTGTCGGTCACCATGCTCGGCGTGGTGACCGGTGTCGGCTTCC‑TGATCCACCTGTTCGCATCCTGGTACATGCGTGGCGAAGCCGGCTACTCGCGCTTCTTCTCGTACACCAACCTGTTCATCGCCAGCATGCTGTTCCTGATCCTTGGCGATAACCTGCT > NC_002947/4666357‑4666650 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |