| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,710,722 | T→C | 6.8% | N274D (AAC→GAC) | gpsA ← | glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,710,722 | 0 | T | C | 6.8% | 212.1 / 4.7 | 73 | N274D (AAC→GAC) | gpsA | glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/30); new base C (2/3); total (40/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.11e-01 | |||||||||||
GGTGCTCGATCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTGGCTGACGGCG > NC_002947/4710575‑4710867 | ggTGCTCGATCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGtt > 1:200847/1‑148 (MQ=255)ggTGCTCGATCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTg > 6:98342/1‑149 (MQ=255) gATCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCATCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCct > 7:56337/1‑149 (MQ=255) aTCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCctc > 5:385152/1‑149 (MQ=255) aTCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCctc < 2:200847/149‑1 (MQ=255) tCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTCAACCGCctgg < 5:107801/149‑3 (MQ=255) tCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTCAACCGCctgg < 5:7376/149‑3 (MQ=255) cTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTc > 8:203122/1‑147 (MQ=255) cTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCa < 6:367317/149‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTcc > 2:92434/1‑142 (MQ=255) cAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTcc < 1:92434/142‑1 (MQ=255) aGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTg < 2:100981/149‑1 (MQ=255) cGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGc > 1:368332/1‑149 (MQ=255) cccTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGcc > 1:193734/1‑149 (MQ=255) gAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTGCCACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGAcc > 1:275887/1‑119 (MQ=255) aaCAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGc < 6:385152/149‑1 (MQ=255) gATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGAcc > 8:63123/1‑112 (MQ=255) gATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGc > 8:46477/1‑149 (MQ=255) gATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGc > 1:283635/1‑149 (MQ=255) tGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCt > 8:30808/1‑148 (MQ=255) cAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGCGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGa < 7:203122/148‑1 (MQ=255) cAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGa < 7:30808/148‑1 (MQ=255) aGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGa > 3:224474/1‑147 (MQ=255) aGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATa < 4:313315/149‑1 (MQ=255) gccagccaCCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGt > 1:200396/1‑149 (MQ=255) cagccaCCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTg < 1:244143/149‑1 (MQ=255) gccaCCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCg < 2:368332/149‑1 (MQ=255) gccaCCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCg < 3:365504/149‑1 (MQ=255) ccacccGCGGCAGGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGGCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCgg < 4:312241/149‑1 (MQ=255) aGCGTCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGAAAGTTGCGGCTCtt < 8:56337/149‑1 (MQ=255) gCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTg > 5:88343/1‑149 (MQ=255) cacCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGTCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGc < 6:251561/149‑1 (MQ=255) cacCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCgaggag > 5:123154/1‑148 (MQ=255) acCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTcc > 2:259062/1‑87 (MQ=255) acCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTcc < 1:259062/87‑1 (MQ=255) acCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCgaggag > 7:16935/1‑147 (MQ=255) ccTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAg < 6:66231/149‑1 (MQ=255) ccTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAg > 3:109859/1‑149 (MQ=255) cTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAgg > 6:349691/1‑149 (MQ=255) cACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGt < 6:88343/147‑1 (MQ=255) cTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTT‑CAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGa < 5:98342/149‑1 (MQ=255) cTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATc < 6:52880/148‑1 (MQ=255) cTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATc < 7:102908/148‑1 (MQ=255) gggCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAgg > 3:27840/1‑149 (MQ=255) ggCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCATTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGAt > 6:282078/1‑144 (MQ=255) ggCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCTGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGAt < 5:282078/144‑1 (MQ=255) ccTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCa > 3:211280/1‑149 (MQ=255) ttGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCAcc > 5:141304/1‑149 (MQ=255) ggTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCAcc < 7:46477/147‑1 (MQ=255) ggTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGa > 6:216030/1‑149 (MQ=255) gTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGa > 8:130446/1‑148 (MQ=255) gAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGacac < 6:123154/146‑1 (MQ=255) gCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGc > 6:49710/1‑148 (MQ=255) gCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTAGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGcc < 2:283635/149‑1 (MQ=255) ttGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGcc > 6:381432/1‑149 (MQ=255) gACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTc < 6:141304/148‑1 (MQ=255) gACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCa > 6:73064/1‑149 (MQ=255) ccccTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATgg > 5:337164/1‑149 (MQ=255) ccccTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATgg > 6:63794/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATgggg > 3:337669/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATgggg > 1:387599/1‑149 (MQ=255) ccTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATgggg > 6:329039/1‑149 (MQ=255) ggCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTg < 2:387599/148‑1 (MQ=255) gCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGc > 7:203699/1‑122 (MQ=255) gCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGc < 8:203699/122‑1 (MQ=255) ctggaagaGGCGGTCAACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGcc < 3:344100/140‑1 (MQ=255) tggaagaGGCGGTCAACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTg > 6:44906/7‑149 (MQ=255) gCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTgg < 2:193734/148‑1 (MQ=255) gCCCAGGCGGGTGACCGCCTCTTCCAGGCTGTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCGCTTGGGCGAGTAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTgg < 4:224474/148‑1 (MQ=255) ggCGGTCAACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCGCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTGGCTGACg > 3:142470/1‑149 (MQ=255) gCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTGGCTGACgg < 4:27840/149‑1 (MQ=255) ggTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTGGCTGACGGc > 2:110124/1‑148 (MQ=255) gTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTGGCTGACGGCg > 6:148944/1‑148 (MQ=255) gTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTGGCTGACGGCg > 3:381112/1‑148 (MQ=255) | GGTGCTCGATCACCTGGTTCAGCGTGCGCCCTTCGAACAGGATGGCATGCAGGCCAGCCACCAGCGGCATGTACACCTG‑CACTTGCTGGGCCTTGGTCTTGAGCACCTTGAGCGTGTTGACCCCCTCGGCCACTTCGCCCAGGCGGTTGACCGCCTCTTCCAGGCTTTGGCCCTGCCCCAGTGCGTAGCCAACCTGATAGTTGCGGCTCTTGGGCGAGGAGCAGGTGACGATCAGGTCACCGACACCGGCCAGGCCGAGGAACGTCATGGGGTTGGCGCCCTGGCTGACGGCG > NC_002947/4710575‑4710867 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |