Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,716,648 | G→C | 6.0% | V627L (GTG→CTG) | PP_4173 → | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,716,648 | 0 | G | C | 6.0% | 248.4 / 4.4 | 79 | V627L (GTG→CTG) | PP_4173 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/39); new base C (3/2); total (38/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
GACGCATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGTGCGCT > NC_002947/4716502‑4716793 | gACGCATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGtg < 3:259127/149‑1 (MQ=255) gCATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGtgctg > 3:142382/1‑149 (MQ=255) aTCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCCCCGAATTGCAGCAGGtgctg > 4:108399/1‑147 (MQ=255) aTCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGtgctg > 2:209752/1‑147 (MQ=255) aTCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGtgctg > 4:25296/1‑147 (MQ=255) aTCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCa > 1:375406/1‑149 (MQ=255) ccGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCAAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCATTGCGCCGAACCGAATTGCAGCAGCTGCTGCAgc > 6:271221/1‑149 (MQ=255) cGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGtgct < 1:207672/143‑1 (MQ=255) cGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGtgct > 2:207672/1‑143 (MQ=255) gCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAgcgc < 4:3251/149‑1 (MQ=255) cAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTg < 4:232456/149‑1 (MQ=255) cAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTg < 2:187146/149‑1 (MQ=255) cAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTg < 4:85333/149‑1 (MQ=255) cAGTTCCCCACCGGCGCCGGGCTACCTATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTg < 7:341844/149‑1 (MQ=255) aGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTgg < 5:326045/149‑1 (MQ=255) gTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGt < 1:8106/149‑1 (MQ=255) cAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCTGTTTGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCg < 5:271221/149‑1 (MQ=255) cAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCg < 7:99355/149‑1 (MQ=255) gcgcCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAg < 3:40715/149‑1 (MQ=255) gCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACcg > 1:165145/1‑149 (MQ=255) cTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCACCTGCTGCaat < 4:59088/124‑3 (MQ=255) cTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCACCTGCTGCaat > 3:59088/1‑122 (MQ=255) tcGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGa > 6:86344/1‑148 (MQ=255) cccTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATaaa > 2:209425/1‑149 (MQ=255) ccTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAAACAACCGCGACTGGCGATAAAt < 4:104636/149‑1 (MQ=255) tGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGc > 7:180890/1‑149 (MQ=255) aCCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCt < 8:180890/148‑1 (MQ=255) aCCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCACCTGCTGCaattcg < 8:250066/109‑6 (MQ=255) aCCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGAACCGAATTGCAGCACCTGCTGCaattcg > 7:250066/1‑104 (MQ=255) ccGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTa > 4:255884/1‑148 (MQ=255) cGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTaaa > 3:94889/1‑149 (MQ=255) cGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTa > 5:276300/1‑147 (MQ=255) ccAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGt > 4:119338/1‑149 (MQ=255) cAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTg > 8:63216/1‑149 (MQ=255) cAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTg > 1:334706/1‑149 (MQ=255) aCGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCg < 1:209425/149‑1 (MQ=255) gTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAg < 2:375406/149‑1 (MQ=255) cAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCt < 2:334706/148‑1 (MQ=255) ggCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTaaa < 3:108399/149‑1 (MQ=255) ccGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTg < 8:13091/149‑1 (MQ=255) gcgAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTgg > 2:325012/1‑148 (MQ=255) gAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGa > 2:364515/1‑147 (MQ=255) gAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACa < 2:99798/149‑1 (MQ=255) gTTGCATGGCCGCCGGTATGGAGGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGAc > 7:59507/1‑149 (MQ=255) ccgGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGAcc < 1:209752/149‑1 (MQ=255) tATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGGAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGCCAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGa > 1:281476/1‑148 (MQ=255) gACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGaaaa > 4:36861/1‑147 (MQ=255) aCGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGGACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGCCCTTCATCGGACCTGaaaa > 1:218836/1‑146 (MQ=255) aCGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGaaaa > 6:297581/1‑146 (MQ=255) cGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGa < 5:86344/149‑1 (MQ=255) gATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCTGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGAc > 6:109433/1‑149 (MQ=255) cTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCa < 4:311318/149‑1 (MQ=255) cTGAGCAAACCATTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGttt > 1:167314/1‑147 (MQ=255) aGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTg < 1:364515/149‑1 (MQ=255) aGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTg < 6:357935/149‑1 (MQ=255) cAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGca > 5:27947/1‑149 (MQ=255) aaaCCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGca > 6:376414/1‑148 (MQ=255) aaCCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGcaca > 6:85134/1‑149 (MQ=255) aCCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGNACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCacac < 1:222563/149‑1 (MQ=255) aCCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCacac < 6:27947/149‑1 (MQ=255) aCCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCacac < 4:142382/149‑1 (MQ=255) ccTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCt > 4:30447/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGt < 3:25296/147‑1 (MQ=255) ccgcACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGAcc < 8:228695/115‑1 (MQ=255) cgcACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCg < 7:141306/110‑1 (MQ=255) cgcACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCg > 8:141306/1‑110 (MQ=255) cgcACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTActtct > 7:104349/1‑149 (MQ=255) cgcACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTActt < 7:212949/147‑1 (MQ=255) cgcACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTActt > 8:212949/1‑147 (MQ=255) aCCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTc < 2:165145/149‑1 (MQ=255) cGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCAGACCTGTACTTCTTTCg > 5:115718/1‑148 (MQ=255) gAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGcc < 3:255884/149‑1 (MQ=255) aaTTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCgg < 2:205012/104‑1 (MQ=255) aaTTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCgg > 1:205012/1‑104 (MQ=255) actGCAGCACGCGCCGCAGCGCTGGCTACCCCGCCACACAACCCCGACTCCCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGCTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAg < 8:59507/147‑1 (MQ=255) aTTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAg < 7:63216/149‑1 (MQ=255) gcagcaGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGTg > 2:15914/1‑149 (MQ=255) cagcagGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGTg < 3:119338/148‑1 (MQ=255) cagGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGTGCGCt < 6:276300/149‑1 (MQ=255) | GACGCATCCGCCAGTTGCCCAACGGCGCCGGGCTACCGATCATCGCCCTGACCGCCAACGCGTTGCAGGGCGACCGCGAACGTTGCATGGCCGCCGGTATGGACGATTACCTGAGCAAACCCTTGCGCCGCACCGAATTGCAGCAGGTGCTGCAGCGCTGGTTACCCGGTCAGACAACCGCGACTGGCGATAAATGCTAAAGTGCGGCAGTCTTAAACACTGGACAGGACCTTCATCGGACCTGAAAATAGACGTTTCAGTGCACACCTGTACTTCTTTCGCCAGGTGCGCT > NC_002947/4716502‑4716793 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |