Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,820,202 | A→T | 6.6% | L3663Q (CTG→CAG) | pvdL ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,820,202 | 0 | A | T | 6.6% | 180.2 / 3.3 | 61 | L3663Q (CTG→CAG) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (26/31); new base T (2/2); total (28/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.63e-01 |
CGCTTCGAACTGCGCGATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGC > NC_002947/4820057‑4820349 | cgcTTCGAACTGCGCGATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGACTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCAGCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCcagcag < 5:121972/147‑1 (MQ=255) gcTTCGAACTGCGCGATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCcagcagcag > 1:59556/1‑149 (MQ=255) gcTTCGAACTGCGCGATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCcagcagcag < 4:223347/149‑1 (MQ=255) gcTTCGAACTGCGCGATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCcagcagcag < 5:325695/149‑1 (MQ=255) ttCGAACTGCGCGATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGgc > 4:362597/1‑149 (MQ=255) gAACTGCGCGATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGgcgc < 7:157545/148‑1 (MQ=255) gAACTGCGCGATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGgcgc < 2:193524/148‑1 (MQ=255) aaCTGCGCGATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCTGCTGCTGGCGCtg < 3:75349/149‑2 (MQ=255) aaCTGCGCGATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCtt > 3:331567/1‑149 (MQ=255) cTGCGCGATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGa < 5:62328/149‑1 (MQ=255) cgcgATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGaa < 3:136863/147‑1 (MQ=255) cgcgATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAAtt > 4:206889/1‑149 (MQ=255) cgATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCg < 2:184404/149‑1 (MQ=255) gATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCgg > 5:157734/1‑149 (MQ=255) gCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAACCCTTGTACCAGCGCCTGCTGCTGGCGCtg > 3:229984/1‑134 (MQ=255) gCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCTGCTGCTGGCGCtg < 4:229984/135‑2 (MQ=255) tctGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAgg > 5:242594/1‑149 (MQ=255) tGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGACcagcgctac > 4:356407/1‑144 (MQ=255) tCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTc > 8:45843/1‑149 (MQ=255) cAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGa > 5:133659/1‑149 (MQ=255) cAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGGTGCAGGCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCGCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGa < 8:75015/149‑1 (MQ=255) gATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTc < 6:242594/149‑1 (MQ=255) aaaCCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCggg > 1:322578/1‑149 (MQ=255) aCCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCggg > 5:152712/1‑147 (MQ=255) gCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCg < 3:206889/149‑1 (MQ=255) cGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAg < 8:222688/149‑1 (MQ=255) gTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTGACCTCCCCTTCAATACCTTGTAACAGCGCCAGCAGCAGGCGGTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTGGGAGTAGCGCt > 8:140204/1‑149 (MQ=255) ttGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTTGGGTAGTCGAAGTAGCGCTg < 8:360711/149‑1 (MQ=255) tcctccAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGaa < 4:371464/149‑1 (MQ=255) ctccAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAAc < 8:113153/148‑1 (MQ=255) cagcagGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACa < 7:45843/149‑1 (MQ=255) cagGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGt > 7:299283/1‑149 (MQ=255) gAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGt < 2:58544/146‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGt > 1:58544/1‑146 (MQ=255) cTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGcc > 2:370495/1‑148 (MQ=255) cTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTCGTCGAACGACAGGTGCAGGcc > 5:90364/1‑148 (MQ=255) ttGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGcc > 3:120514/1‑147 (MQ=255) gCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAg < 2:59556/148‑1 (MQ=255) cTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAgg < 3:231590/148‑1 (MQ=255) tCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGt > 6:9640/1‑148 (MQ=255) gggCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGtcatca < 8:299283/149‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTGCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGtcatca < 3:87054/148‑1 (MQ=255) cTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCgg < 2:322578/149‑1 (MQ=255) cTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCgg < 1:370495/149‑1 (MQ=255) cTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCg < 2:88763/148‑1 (MQ=255) cTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCg > 1:88763/1‑148 (MQ=255) cagcagCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGCCGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCggg > 6:59913/1‑148 (MQ=255) cagcagCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCggg > 5:80309/1‑148 (MQ=255) gcagcGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTaa < 5:268544/149‑1 (MQ=255) gTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACAcc < 7:140204/149‑1 (MQ=255) gTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACAcc > 6:169927/1‑149 (MQ=255) tggctcACCTCCCCTTCAACACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAgg < 8:166422/115‑1 (MQ=255) tcACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGc > 5:307800/1‑149 (MQ=255) tCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGATTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCggg > 8:360394/1‑147 (MQ=255) cTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTg < 4:286898/149‑1 (MQ=255) cTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTg > 7:297137/1‑149 (MQ=255) cTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTg < 6:80309/149‑1 (MQ=255) cAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCTGTCAGCGGGAAGTTGgt < 5:9640/148‑1 (MQ=255) cAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTgg < 6:152712/147‑1 (MQ=255) cAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGgt < 7:360394/148‑1 (MQ=255) aaaCCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGtcat < 6:330065/109‑1 (MQ=255) aaCCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTgg < 6:90364/149‑1 (MQ=255) cTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTa > 3:196694/1‑149 (MQ=255) ttGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTAc > 7:2053/1‑149 (MQ=255) aaGCGCCTGCTGCTGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGccc > 7:63026/2‑148 (MQ=255) agcagcagGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGa < 4:196694/149‑1 (MQ=255) cagcagGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGccc < 7:78960/139‑1 (MQ=255) cagcagGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGccc > 8:78960/1‑139 (MQ=255) cagcagGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGc > 8:219875/1‑149 (MQ=255) | CGCTTCGAACTGCGCGATGTAGCTCTGCTCCAGCGGATAAACCCGCTCGGTCCGGTTGCAGTCCTCCAGCAGGAAGCCTTGCTCCTGGGCGCTCAGCAGCGGTAGCTCGCTCACCTCCCCTTCAAAACCTTGTACCAGCGCCAGCAGCAGGCGCTTGAATTCGGCCAGCAGGCGCTCGACGGTCGGGTAGTCGAAGTAGCGCTGGTCGAACGACAGGTGCAGGCCCAGGTCATCACCCGGGTAACACACCGCCGTCAGCGGGAAGTTGGTGTGGGTACGGCCCGAGTCGGAGC > NC_002947/4820057‑4820349 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |