| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,830,690 | T→A | 5.4% | D167V (GAC→GTC) | pvdL ← | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,830,690 | 0 | T | A | 5.4% | 280.5 / 4.7 | 93 | D167V (GAC→GTC) | pvdL | non‑ribosomal peptide synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (47/41); new base A (3/2); total (50/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.38e-01 | |||||||||||
GCTGACGATCACATCGTCGGGGTTGAGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCTGTCGCGCAGCGCCGCCACGGTCAGCAGCAGTC > NC_002947/4830548‑4830837 | gCTGACGATCACATCGTCGGGGTTGAGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGc > 2:119703/1‑149 (MQ=255) cGATCACATCGTCGGGGTTGAGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCtt < 7:237640/148‑1 (MQ=255) gATCACATCGTCGGGGTTGAGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAGGGCGATGACATCGccttcct < 4:239330/149‑6 (MQ=255) gATCACATCGTCGGGGTTGAGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGa < 7:65260/149‑1 (MQ=255) aTCACATCGTCGGGGTTGAGGTCTATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAg > 2:87110/1‑149 (MQ=255) acaTCGTCGGGGTTGAGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCAc < 4:95748/149‑1 (MQ=255) aTCGTCGGGGTTGAGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGa > 7:136689/1‑143 (MQ=255) aTCGTCGGGGTTGAGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGa < 8:136689/143‑1 (MQ=255) aTCGTCGGGGTTGAGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACgg > 3:368984/1‑149 (MQ=255) aTCGTCGGGGTTGAGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACgg > 2:353767/1‑149 (MQ=255) aTCGTCGGGGTTGAGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACgg < 6:164076/149‑1 (MQ=255) aTCGTCGGGGTTGAGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACgg < 3:321104/149‑1 (MQ=255) gtcgGGGTTGAGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGtt < 3:89282/149‑1 (MQ=255) gtcgGGGTTGAGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTAGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGtt > 3:197318/1‑149 (MQ=255) ttGAGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCa < 1:277299/149‑1 (MQ=255) aGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCAc < 1:204392/142‑1 (MQ=255) aGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCAc > 2:204392/1‑142 (MQ=255) aGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGtt > 2:43436/1‑149 (MQ=255) gTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCg > 2:173395/1‑149 (MQ=255) cGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCg > 4:252456/1‑147 (MQ=255) gATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAg > 6:110863/1‑149 (MQ=255) gATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCGTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAg > 7:147087/1‑149 (MQ=255) cAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGa > 6:247371/1‑120 (MQ=255) cAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGa < 5:247371/120‑1 (MQ=255) cAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAgg > 6:3159/1‑149 (MQ=255) cAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAgg > 6:332383/1‑149 (MQ=255) cAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAgg > 8:222054/1‑149 (MQ=255) ccTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCgg < 3:99536/149‑1 (MQ=255) cTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGACATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCggg > 7:21513/1‑149 (MQ=255) ggCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTc > 1:54416/1‑148 (MQ=255) cGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCaa < 1:212912/149‑1 (MQ=255) cGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGCGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCaa < 4:368984/149‑1 (MQ=255) ggctCAGTGGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGCCCTGCACGCCCTGGGGCCGCCCGGTGGAACCGGAGGGGTACTGCAGGCAGGCGATGTCATCGGCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCacg > 6:274361/4‑147 (MQ=255) tCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCaa < 2:240693/145‑1 (MQ=255) tCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCaa > 1:240693/1‑145 (MQ=255) tCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCa > 5:228660/1‑149 (MQ=255) aGTTGCTCGTTGGCCCCCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCGTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCGTc > 8:171965/1‑149 (MQ=255) aGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATc < 5:247025/149‑1 (MQ=255) gTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCACGCCATcc > 4:85806/1‑149 (MQ=255) gTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATcc < 4:290972/149‑1 (MQ=255) gTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATc > 8:245070/1‑148 (MQ=255) cTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGa > 6:63882/1‑98 (MQ=255) cTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGa < 5:63882/98‑1 (MQ=255) tCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGc > 7:104797/1‑149 (MQ=255) tCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGATGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGGACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGc > 3:27956/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGc < 1:353767/147‑1 (MQ=255) gTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGc < 2:204151/147‑1 (MQ=255) accaGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTg > 6:80007/1‑149 (MQ=255) accaGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTg > 2:306465/1‑149 (MQ=255) caGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGGGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTggg < 4:96282/149‑1 (MQ=255) ggTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCACGCCATCCACTGCCAGCAGTTggggg > 7:233264/1‑149 (MQ=255) gCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCg < 1:374999/148‑1 (MQ=255) gCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCg < 6:288337/148‑1 (MQ=255) ccATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGtt < 1:119703/149‑1 (MQ=255) ccATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGACATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGtt < 8:21513/149‑1 (MQ=255) cATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTg < 1:87110/149‑1 (MQ=255) cATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTg > 3:266876/1‑149 (MQ=255) tGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTc < 2:54416/149‑1 (MQ=255) gCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCCTCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTccg > 1:68164/1‑149 (MQ=255) cTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTccgc < 3:252456/149‑1 (MQ=255) cTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCa < 4:266876/149‑1 (MQ=255) gCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAgg > 3:134289/1‑149 (MQ=255) cACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGTAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAgg < 4:27956/148‑1 (MQ=255) cACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAg < 7:222054/147‑1 (MQ=255) cACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAg < 5:3159/147‑1 (MQ=255) aCGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGc < 2:68164/149‑1 (MQ=255) aCGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGCAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGc < 5:332383/149‑1 (MQ=255) gCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCtt > 8:156941/1‑149 (MQ=255) gCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGCAGGAGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGCGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGcgt > 2:126685/1‑147 (MQ=255) cccTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTc < 5:80007/149‑1 (MQ=255) cTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTc > 5:326291/1‑147 (MQ=255) ttGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAg > 3:65587/1‑149 (MQ=255) gcgcGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGc < 5:110863/149‑1 (MQ=255) cgcgGGGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCa < 4:197318/149‑1 (MQ=255) gcgGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAg < 2:15697/149‑1 (MQ=255) gTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCt > 4:277647/1‑149 (MQ=255) ggAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCTGt > 1:54129/1‑149 (MQ=255) gtgtACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGtt > 4:381994/1‑104 (MQ=255) gtgtACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGtt < 3:381994/104‑1 (MQ=255) gtACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCTGTCGCGCAGcgccg < 7:171965/149‑1 (MQ=255) gtACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCTGTCGCGCAGcgccg > 5:85426/1‑149 (MQ=255) cTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCTGTCGCGCAGCGCCGCCa < 1:173395/149‑1 (MQ=255) cAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCTGTCGCGCAGCGCCGCCACgg > 5:163853/1‑149 (MQ=255) caagggCGATGACATCGCCTTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCTGTCGCGCAGCGCCGCCACGGt > 7:102789/5‑148 (MQ=255) caagggCGATGACATCGCCTTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCTGTCGCGCAGCGCCGCCACGGt > 7:42131/5‑148 (MQ=255) gAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCTGTCGCGCAGCGCCGCCACGGTca > 7:345385/1‑149 (MQ=255) ggCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCTGTCGCGCAGCGCCGCCACGGTcagca < 6:228660/149‑1 (MQ=255) gCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCTGTCGCGCAGCGCCGCCACGGTcagcag < 7:156941/149‑1 (MQ=255) gCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCTGTCGCGCAGCGCCGCCACGGTcagcag > 6:44882/1‑149 (MQ=255) gATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCTGTCGCGCAGCGCCGCCACGGTcagcag > 5:128016/1‑147 (MQ=255) gATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCTGTCGCGCAGCGCCGCCACGGTcagcag > 7:91457/1‑147 (MQ=255) gATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCACTGCAGGCTGTCGCGCAGCGCCGCCACGGTcagcag > 5:21565/1‑147 (MQ=255) gTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCTGTCGCGCAGCGCCGCCACGGTCAGCAGCAGTc > 1:52273/1‑149 (MQ=255) | GCTGACGATCACATCGTCGGGGTTGAGGTCGATGCCAAAGCCTTGGCGGATCAGTTGCTCGTTGGCCACCAGGTTGCCATGGCTGACCTGCACGCCCTTGGGCAGCGCGGTGGAACCGGAGGTGTACTGCAGGAAGGCGATGTCATCGCCCTTGAGCACGGGTTCACGCCAGTTCGCAGCCAGGGCCGGGTCCAAGCCATCCACTGCCAGCAGTTGGGGGGCGTTGTCCGCCGCCAGGGCTTCCAGGCCCTGCAGGCTGTCGCGCAGCGCCGCCACGGTCAGCAGCAGTC > NC_002947/4830548‑4830837 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |