Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,241,725 | C→T | 6.1% | Q49Q (CAG→CAA) | hmgC ← | maleylacetoacetate isomerase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,241,725 | 0 | C | T | 6.1% | 296.0 / 5.5 | 97 | Q49Q (CAG→CAA) | hmgC | maleylacetoacetate isomerase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/51); new base T (3/3); total (43/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAGGTGGAACGGTAATAGGTGTACAGCTCCA > NC_002947/5241577‑5241870 | tgGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGccc > 2:132559/1‑149 (MQ=255) ccgccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAGGGCCGCGTAC‑CGGCCTTGc > 7:254779/1‑149 (MQ=255) ccgccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAGGGCCGCGTAC‑CGGCCTTGc < 8:254779/149‑1 (MQ=255) ccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAGGGCCGCGTAC‑CGGCCTTGCgca < 7:176491/149‑3 (MQ=255) ccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAGGGCCGCGTAC‑CGGCCTTGCgca < 8:285685/149‑3 (MQ=255) ccACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCggg < 7:224105/149‑1 (MQ=255) aCCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGtt > 4:148833/1‑149 (MQ=255) ccccccGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTg > 3:122609/1‑149 (MQ=255) cccccGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGa < 4:84902/149‑1 (MQ=255) cccGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACg < 4:94243/149‑1 (MQ=255) cccGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACg > 8:41498/1‑149 (MQ=255) cccGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACg > 2:121186/1‑149 (MQ=255) cccGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGAAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCgggaactcg > 1:332028/1‑143 (MQ=255) aaCCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTa < 3:314173/149‑1 (MQ=255) aCCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTa > 5:39053/1‑148 (MQ=255) ccTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACa > 7:130386/1‑148 (MQ=255) ccGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACAAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCGG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGCCGGCGACATAGccgt > 4:36486/1‑147 (MQ=255) cGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTc > 6:235941/1‑149 (MQ=255) gTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCg < 4:215857/149‑1 (MQ=255) cTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCAc > 7:7080/1‑149 (MQ=255) ggcggTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACgc < 4:194444/148‑1 (MQ=255) gcggTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACgctg < 2:184785/149‑1 (MQ=255) gcggTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACgctg < 2:21057/149‑1 (MQ=255) gcggTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACgctg < 8:127522/149‑1 (MQ=255) cggTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACgctgc < 6:39053/149‑1 (MQ=255) ggTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACgctgct > 2:289783/1‑149 (MQ=255) cGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑t > 8:214594/1‑149 (MQ=255) caACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑Tgcag > 4:36654/1‑147 (MQ=255) aCGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAgg < 1:132559/149‑1 (MQ=255) aCGCAGGCTGTGGATAAAACTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCAGGCGACTGCACCAGAACCTCACAACCGTCGGTGCGCAAGACCG‑CTACGCGGCCCACAGGGATAACGCCTACATAGCCATCGCCACGCTGCTAA‑CCC‑‑‑TGAACCAgg > 7:194567/1‑149 (MQ=255) tgGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGc < 5:318724/148‑1 (MQ=255) gATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAgg < 8:130386/149‑1 (MQ=255) gATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAgg > 7:219555/1‑149 (MQ=255) gATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAgg < 5:200538/149‑1 (MQ=255) gATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAgg > 5:170942/1‑149 (MQ=255) aTAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAgg > 1:21151/1‑148 (MQ=255) tAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGa > 6:135843/1‑149 (MQ=255) aaaCCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGAc < 3:36654/149‑1 (MQ=255) aaCCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGAc < 4:300889/148‑1 (MQ=255) ccTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTgg > 4:367233/1‑149 (MQ=255) tctTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGTGACTGGt > 1:326234/1‑148 (MQ=255) ccAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTaa < 7:214594/146‑1 (MQ=255) ccAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTaa < 1:177727/146‑1 (MQ=255) ccAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACAACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTAA‑CCC‑‑‑TGAAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAagc > 8:264276/1‑148 (MQ=255) cAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAagcc < 3:4721/148‑1 (MQ=255) gTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAagccagcc < 1:370708/149‑1 (MQ=255) gTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAagccagcc > 2:209404/1‑149 (MQ=255) aCTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTg > 7:195943/1‑122 (MQ=255) aCTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTg < 8:195943/122‑1 (MQ=255) gatgatCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCtt < 4:179996/147‑1 (MQ=255) gatgatCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCtt > 4:310021/1‑147 (MQ=255) gatgatCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTc < 5:235941/148‑1 (MQ=255) gatgatCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTc < 4:122609/148‑1 (MQ=255) gatgatCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCa < 5:135843/149‑1 (MQ=255) gatgatCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCa < 1:289783/149‑1 (MQ=255) atCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCCGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGc < 7:155370/149‑1 (MQ=255) tCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGcc < 3:36486/149‑1 (MQ=255) gCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAg < 1:207690/149‑1 (MQ=255) ccGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGc > 6:210103/1‑145 (MQ=255) ccGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGc < 5:210103/145‑1 (MQ=255) ccGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAgg > 5:52285/1‑149 (MQ=255) cGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCACCCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAgg < 1:102283/149‑1 (MQ=255) gCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGc > 1:70402/1‑148 (MQ=255) 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caccacCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGAc < 7:176540/149‑1 (MQ=255) accaccGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGcc > 2:181443/1‑124 (MQ=255) accaccGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGcc < 1:181443/124‑1 (MQ=255) ccaccGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCCTCTTACAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGa < 1:121186/149‑1 (MQ=255) caccGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTAGATAGCCCTCGCCACGCTTCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGGCATCCCCTTGAGTGCCAGGGCAATGCGCACGCGGTAGGACGAg < 8:194567/149‑1 (MQ=255) caccGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAg < 3:310021/149‑1 (MQ=255) ccGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCGCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAGGt < 4:116616/149‑1 (MQ=255) cGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAGGTg < 2:332028/149‑1 (MQ=255) gTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAGGTgg < 2:70402/149‑1 (MQ=255) ggTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAGGTGGaa < 2:298554/148‑1 (MQ=255) 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gcgcTGCGGGTTGACGGCTACATTGCCCTCTCCTCGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGTACTGGTAAGCCAGCCCCTTCTGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAGGTGGAACGGTAATAGGTGTACAGCTCCa < 5:223285/146‑1 (MQ=255) | TGGCCGCCACCCCCCGAACCCTGGCCCGTGCCTCGGCGGTGGCCGGCAGCAACGCAGGCTGTGGATAAACCTCTTCCAGGTACTCGATGATCGCCGGCGACTGCACCAGCACCTCACCACCGTCGGTGCGCAAGGCCG‑GTACGCGGCCCTGCGGGTTGACGGCTACATAGCCCTCGCCACGCTGCTCA‑CCC‑‑‑TGCAGCAGGTTGACCGGCAGGGACTGGTAAGCCAGCCCCTTCAGTGCCAGGGCAATGCGCACCCGGTAGGACGAGGTGGAACGGTAATAGGTGTACAGCTCCA > NC_002947/5241577‑5241870 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |