| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,465,212 | T→C | 5.6% | T60A (ACC→GCC) | PP_4802 ← | lipoate regulatory protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,465,212 | 0 | T | C | 5.6% | 207.1 / 2.6 | 72 | T60A (ACC→GCC) | PP_4802 | lipoate regulatory protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/41); new base C (2/2); total (29/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.79e-01 | |||||||||||
CGGTTCATAGGGCTGCAGGCCAAGCTCGCGAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGACAACGGTGTCACCAATGACCTTGATCGGGTAATCGTCGCAAGGG > NC_002947/5465064‑5465351 | cGGTTCATAGGGCTGCAGGCCAAGCTCGCGAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACggtggt < 7:9512/149‑1 (MQ=255) gTTCATAGGGCTGCAGGCCAAGCTCGCGAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGgtgt < 4:342475/149‑1 (MQ=255) aTAGGGCTGCAGGCCAAGCTCGCGAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCAATTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGTCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CTACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTAAtt > 4:239173/1‑149 (MQ=255) aGGGCTGCAGGCCAAGCTCGCGAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGc > 7:3077/1‑149 (MQ=255) aGGGCTGCAGGCCAAGCTCGCGAAAACCGAGGCAGGCGGACAGCAAAGCACCATTATCACGATGCCTGTAGCGCGCAGTGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGGGTACTTGc > 5:275265/1‑149 (MQ=255) gCTGCAGGCCAAGCTCGCGAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGcctt > 8:266032/1‑149 (MQ=255) cTGCAGGCCAAGCTCGCGAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGGAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGccttc < 6:238583/149‑1 (MQ=255) cAGGCCAAGCTCGCGAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGccttcctt < 3:291870/149‑1 (MQ=255) gCCAAGCTCGCGAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGct > 1:346548/1‑149 (MQ=255) aaGCTCGCGAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTg < 2:389552/149‑1 (MQ=255) aGCTCGCGAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCTCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑TAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTgg < 2:353982/149‑1 (MQ=255) gCTCGCGAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGc < 5:28865/149‑1 (MQ=255) tCGCGAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGt > 8:222731/1‑149 (MQ=255) tCGCGAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGt > 3:145420/1‑149 (MQ=255) gcgAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTc > 6:151748/1‑149 (MQ=255) cgAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCg < 1:273757/149‑1 (MQ=255) cgAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCg > 3:278588/1‑149 (MQ=255) aCCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGct > 5:20844/1‑134 (MQ=255) aCCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGct < 6:20844/134‑1 (MQ=255) gcaggcGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGa < 4:231994/149‑1 (MQ=255) aggcGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGa > 1:9426/1‑147 (MQ=255) cGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGt < 4:99482/149‑1 (MQ=255) ggACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGGTCGGCCAGGGTGGAAAGGTc < 8:106463/149‑1 (MQ=255) gACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAg < 1:171224/145‑1 (MQ=255) gACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAg > 2:171224/1‑145 (MQ=255) aCATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGa < 3:230058/149‑1 (MQ=255) cATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGAc < 2:366753/149‑1 (MQ=255) aTCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACt > 3:173766/1‑149 (MQ=255) cAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACttt > 1:390400/1‑149 (MQ=255) cAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGCGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACttt > 5:160283/1‑149 (MQ=255) cAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGCGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACttt > 5:166155/1‑149 (MQ=255) aacgCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTg > 7:246539/4‑149 (MQ=255) aaaGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTg > 1:227121/1‑149 (MQ=255) aaaGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTg > 7:264120/1‑149 (MQ=255) aaGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTgg > 6:110666/1‑149 (MQ=255) aGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGc < 4:145420/149‑1 (MQ=255) aGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGc < 7:129482/149‑1 (MQ=255) aGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGc < 1:213596/149‑1 (MQ=255) cACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGt < 2:346548/149‑1 (MQ=255) ttttCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGGGACAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCGTTCATTGATCTGCCGTTCGGCCAGGTTGGAAAGGTCGAGTTTGGCGtgct > 1:116318/1‑149 (MQ=255) ttttCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGtgcttg < 2:227121/149‑1 (MQ=255) tgaCGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGtgcttgct < 8:3077/146‑1 (MQ=255) cACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTg < 8:108634/148‑1 (MQ=255) aCGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGa < 5:151748/148‑1 (MQ=255) cGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGc < 2:188929/149‑1 (MQ=255) aTGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATAGCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCAc < 8:272243/149‑1 (MQ=255) gCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGGAATTGCACGGTTGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCAcc < 3:239173/148‑1 (MQ=255) ccGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTc < 2:85695/149‑1 (MQ=255) ccGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGCGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTc < 6:166155/149‑1 (MQ=255) ccGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGCGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTc < 6:160283/149‑1 (MQ=255) cGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTc > 4:79008/1‑148 (MQ=255) cGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTc > 2:233572/1‑148 (MQ=255) gcgcgcAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGAc < 1:233572/149‑1 (MQ=255) cgcgcAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGAcc < 2:390400/149‑1 (MQ=255) cgcgcAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGATTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGAcc < 4:366004/149‑1 (MQ=255) cAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGt < 4:173766/149‑1 (MQ=255) gcgcTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCtt < 5:228984/149‑1 (MQ=255) gcgcTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCtt < 7:266032/149‑1 (MQ=255) tGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGaaa > 3:26272/1‑149 (MQ=255) atatCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGa > 8:102080/1‑148 (MQ=255) gTGCAGCTGGTTCGCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGACAACg < 2:116318/148‑1 (MQ=255) tGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGACAACGgt > 2:191213/1‑149 (MQ=255) aGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGACAACGGTGTc < 2:9426/149‑1 (MQ=255) gCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGACAACGGTGTCACCAATGACCt < 3:79008/149‑1 (MQ=255) cTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCGGGGTGGAAAGGTCGACTTTTGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGACAACGGTGTCACCAATGACCtt < 6:275265/149‑1 (MQ=255) cTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGACAACGGTGTCACCAATGACCtt > 3:198038/1‑149 (MQ=255) g‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGACAACGGTGTCACCAATGACCTTGATCgg > 4:178299/1‑149 (MQ=255) cAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGACAACGGTGTCACCAATGACCTTGATCggg < 4:26272/149‑1 (MQ=255) tgCAATATCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGGCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGACAACGGTGTCACCAATGACCTTGATCGGGTAAtcgtc < 1:383687/149‑1 (MQ=255) gCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGACAACGGTGTCACCAATGACCTTGATCGGGTAAtcgtc < 5:110666/148‑1 (MQ=255) cAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGACAACGGTGTCACCAATGACCTTGATCGGGTAATCGTCGc < 7:102080/149‑1 (MQ=255) ttGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGACAACGGTGTCACCAATGACCTTGATCGGGTAATCGTCGCAAg < 7:222731/149‑1 (MQ=255) gCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGACAACGGTGTCACCAATGACCTTGATCGGGTAATCGTCGCAAgg < 1:191213/148‑1 (MQ=255) cACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGACAACGGTGTCACCAATGACCTTGATCGGGTAATCGTCGCAAggg > 8:278135/1‑148 (MQ=255) | CGGTTCATAGGGCTGCAGGCCAAGCTCGCGAAAACCGAGGCAGGCGGACATCAAAGCACCATTTTCACGATGCCGGTAGCGCGCAGGGCGCTGTTGATATCGTGCAGCTGGTTCTCGCTTTCGG‑‑CAACGATGTGCAATTGCACGGTGGTGTACTTGCCTTCCTTGCTCTGGCGTTCGGCCAGGGTGGAAAGGTCGACTTTGGCGTGCTTGCTGAGCACCTCGATGACCATGTCCTTGAAACCGACAACGGTGTCACCAATGACCTTGATCGGGTAATCGTCGCAAGGG > NC_002947/5465064‑5465351 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |