| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,651,374 | 0 | T | G | 10.9% | 275.4 / 24.1 | 101 | intergenic (‑182/+31) | PP_4959/fba | diguanylate cyclase/fructose‑bisphosphate aldolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/45); new base G (7/4); total (52/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.84e-01 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CGGTTGGATCCATTAGTACTCTAGACCTGAGGCTGCAACACGCAATGCAATCAGAACGCTATCAATGATCAAACTGTACGGTAGCCGACTAACGGTCGGTCTGCCGGAATTATGTACAGGTTTCCATCTCCCATAAAAAAACCCGCATCGCTGCGGGTTTTTCAGGGTTACCTGTCGATCAGTTGACCTTGGCGGCCAGTTCACCTTTCAGGTAGCGCTGGTACATGCCTTCCAGAGAGATCGGCTTGATCTTCGAGGCATTGCCCGCGGTGCCGAAGGCTTCGTAACGCGCGATG > NC_002947/5651227‑5651522 | cGGTTGGATCCATTAGTACTCTAGACCTGAGGCTGCAACACGCAATGCAATCAGAACGCTATCAATGATCAAACTGTACGGTAGCCGACTAACGGTCGGTCTGCCGGAATTATGTACAGGTTTCCATCTCCCATAAAAAAACCCGCAt < 2:289429/148‑1 (MQ=255) gTTGGATCCATTAGTACTCTAGACCTGAGGATGCAACACGCAATGCAATCAGAACGCTATCAATGATAAAACTGTACGGTAGCCGACTAACTGAAGGTCTGCCGGAATTATGTACAGGTTTCCATCTCCCATAAAAAAACACGCATCGc > 5:391939/1‑149 (MQ=255) aTCCATTAGTACTCTAGACCTGAGGCTGCAACACGCAATGCAATCAGAACGCTATCAATGATCAAACTGTACGGTAGCCGACTAACGGTCGGTCTGCCGGAATTATGTACAGGTTTCCATCTCCCATAAAAAAACCCGCATCGCTGCgg > 7:103547/1‑149 (MQ=255) 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aTAAAAAAACCCGCATCGCTGCGGGTTTTTCAGGGTTACCTGTCGATCAGTTGACCTTGGCGGCCAGTTCACCTTTCAGGTAGCGCTGGTACATGCCTTCCAGAGAGATCGGCTTGATCTTCGAGGCATTGCCCGCGGTGCCGAAGGCt > 3:249938/1‑149 (MQ=255) aTAAAAAAACCCGCATCGCTGCGGGTTTTTCAGGGTTACCTGTCGATCAGTTGACCTTGGCGGCCAGTTCACCTTTCAGGTAGCGCTGGTACATGCCTTCCAGAGAGATCGGCTAGATCTTCGAGGCATTGCCCGCGGTGCCGAAGGCt > 4:226168/1‑149 (MQ=255) aTAAAAAAACCCGCATCGCTGCGGGTTTTTCAGGGTTACCTGTCGATCAGATGACCTTGGCGGCCAGTTCACCTTGCAGGTAGCGCTGGTACATGCCTTCCAGAGAGATCGGCTTGATCTACGCGGCATTGACCGCGGTGACGAAGGCt > 7:69553/1‑149 (MQ=255) tgaaaaaCCCGCAGCGATGCGGGTTTTTCAGGGTTACCTGTCGATCAGTTGACCTTGGCGGCCAGTTCAGCTTTCAGGTAGCGCTGGTACATGCCTTCCAGAGAGATCGGCTTGATCTTCGTGGCATTGCAGGCGGTGCGGAAggatgc > 4:229060/3‑145 (MQ=255) tgaaaaaCCCGCAGCGATGCGGGTTTTTCAGGGTTACCTGTCGATCAGTTGACCTTGGCGGCCAGTTCACCTTTCAGGTAGCGATGGTACATGCAAACCAGAGAGATCGGCTTGATCTTCGAGGCATTGCCCGCGGTGCCGAAGGc > 1:320834/3‑146 (MQ=255) 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2:242091/1‑131 (MQ=255) tCGCTGCGGGTTTTTCAGGGTTACCTGTCGATCAGTTGACCTTGGCGGCCAGTTCACCTTTCAGGTAGCGCTGGTACATGCCTTCCAGAGAGATCGGCTTGATCTTCGAGGCATTGCCCGCGGTGCCGAAGGCTTCGTAACGCGCGATg < 3:368149/149‑1 (MQ=255) | CGGTTGGATCCATTAGTACTCTAGACCTGAGGCTGCAACACGCAATGCAATCAGAACGCTATCAATGATCAAACTGTACGGTAGCCGACTAACGGTCGGTCTGCCGGAATTATGTACAGGTTTCCATCTCCCATAAAAAAACCCGCATCGCTGCGGGTTTTTCAGGGTTACCTGTCGATCAGTTGACCTTGGCGGCCAGTTCACCTTTCAGGTAGCGCTGGTACATGCCTTCCAGAGAGATCGGCTTGATCTTCGAGGCATTGCCCGCGGTGCCGAAGGCTTCGTAACGCGCGATG > NC_002947/5651227‑5651522 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |