Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,064,575 | A→T | 9.1% | intergenic (+16/+18) | ubiA → / ← PP_5319 | 4‑hydroxybenzoate octaprenyltransferase/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,064,575 | 0 | A | T | 9.1% | 205.3 / 9.0 | 77 | intergenic (+16/+18) | ubiA/PP_5319 | 4‑hydroxybenzoate octaprenyltransferase/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/30); new base T (4/3); total (44/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.14e-01 |
CGTGCTTTGCCTGGGAATACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACCGTCGTCACGCGT > NC_002947/6064429‑6064721 | cgTGCTTTGCCTGGGAATCCTGGTCAACGCGCCAGCTGGACCGGGACTCGGGCTTCCAGGCATTTCTGCACACCCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCaga < 5:82149/149‑1 (MQ=255) tGCCTGGGAATACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGcc < 8:164106/148‑1 (MQ=255) ccTGGGAATACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCg > 6:363318/1‑149 (MQ=255) ggAATACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCTCTGCGGccccaaa < 5:212011/147‑4 (MQ=255) ggAATACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCTCTGCGGccccaaa < 5:202483/147‑4 (MQ=255) ggAATACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGc < 6:375519/147‑1 (MQ=255) tACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTAtctc < 2:42107/149‑1 (MQ=255) tGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATg > 5:362843/1‑149 (MQ=255) tGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGAACAACCACTGGGCTGGGATGCTCGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGTGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATg > 8:92266/1‑149 (MQ=255) gTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGc > 3:173689/1‑149 (MQ=255) aaCGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTg > 2:333457/1‑149 (MQ=255) gcgcAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGc > 5:355336/1‑148 (MQ=255) gcgcAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGGGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGc > 3:93865/1‑148 (MQ=255) gcAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAAc < 3:280625/149‑1 (MQ=255) gcAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAAc > 5:30140/1‑149 (MQ=255) cTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGcc < 5:366166/149‑1 (MQ=255) gACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAg > 8:290006/1‑148 (MQ=255) ccGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCTCTGCGGccc > 6:11708/1‑116 (MQ=255) ccGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCTCTGCGGccc < 5:11708/116‑1 (MQ=255) cGGGAATCGTGCTTCTAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGt < 6:362843/149‑1 (MQ=255) cGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGt > 8:258280/1‑149 (MQ=255) ggAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATTGCTTGGCAAAGTGCCAGACGACt > 4:175552/1‑149 (MQ=255) gAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCtt < 6:30140/149‑1 (MQ=255) tCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCa > 5:287887/1‑149 (MQ=255) gTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATg > 2:295017/1‑149 (MQ=255) gTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATg > 2:198304/1‑149 (MQ=255) tGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGc > 1:152050/1‑149 (MQ=255) cTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCCTGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGcc < 6:287887/148‑1 (MQ=255) ttCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGt > 6:17016/1‑137 (MQ=255) ttCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGt < 5:17016/137‑1 (MQ=255) cAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCa > 4:1485/1‑149 (MQ=255) aaGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTAt < 1:62471/107‑1 (MQ=255) aaGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTAt > 2:62471/1‑107 (MQ=255) aaGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCAc < 2:152050/149‑1 (MQ=255) aGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCAcc < 4:173689/149‑1 (MQ=255) ggCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCg < 1:333457/149‑1 (MQ=255) aTTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTc < 8:179649/149‑1 (MQ=255) tCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCAt < 6:355336/148‑1 (MQ=255) acaACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCAcc > 6:34451/1‑149 (MQ=255) caACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCg < 4:359035/149‑1 (MQ=255) cTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCcttc < 7:290006/149‑1 (MQ=255) ggggATGGTGCTGTTTAACGCAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGACGAACAGCGGCCCCTGCTAACTGAAGGCTTGGCAACGTCACAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCAAGTAACAGGCCTTCTTGGcc > 2:167904/1‑149 (MQ=255) ggggATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTATGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTcc > 4:170252/1‑149 (MQ=255) ggggATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTcc < 7:258280/149‑1 (MQ=255) ggggATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTcc < 5:363318/149‑1 (MQ=255) gtgtTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAgg > 4:211730/1‑149 (MQ=255) gtgtTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCATTCATGCCGTCACCGGTCATGTAACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAgg > 2:341399/1‑149 (MQ=255) gtgtTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCGATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAg < 4:93865/148‑1 (MQ=255) gtTTATGGGTGTTGTGGTTGATTACGCGTTGCGGTTAGTTGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGt < 3:175552/148‑1 (MQ=255) tttATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGta > 4:310104/1‑148 (MQ=255) aTCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGtata > 2:227460/1‑147 (MQ=255) tCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAg > 6:137372/1‑149 (MQ=255) ggAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCg < 4:87572/149‑1 (MQ=255) aGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTtga > 7:181317/1‑132 (MQ=255) aGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTtga < 8:181317/132‑1 (MQ=255) ttGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCtt < 3:211730/149‑1 (MQ=255) tgtgCTGGATTATGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCtt < 3:170252/148‑1 (MQ=255) tgCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGc < 1:227460/148‑1 (MQ=255) cTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCcgt > 6:188407/1‑149 (MQ=255) cTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCcgt > 5:276740/1‑149 (MQ=255) ggATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGAAACGTGCCAGACGTCTTTAATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCcgtcg > 1:191638/1‑149 (MQ=255) gcgTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGcc > 1:209522/1‑148 (MQ=255) 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ttGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACcgtc < 5:110698/148‑1 (MQ=255) ccggggCCGCTCTGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACcgtcg > 6:92927/3‑149 (MQ=255) tGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACcgtcgt > 1:37266/1‑149 (MQ=255) ggggCCGCTCTGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACcgtcgt > 4:84463/1‑148 (MQ=255) ggggCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGTATCGAACcgtcgt < 5:34451/148‑1 (MQ=255) gggCCGCTCTGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACCGTCGTCa > 6:216802/1‑149 (MQ=255) gCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACCGTCGTCAcg > 6:241450/1‑149 (MQ=255) gCAGAGCGGCCCCGGGTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCCGACGTGTTTCATGGCGTCACCGGGGGTGTCACCGGCCTTGTTGGGCTTGATGAAGGTATACAGGGGCTTGCCGGCGTAAGCCCCCTGCATCGAACCGGGGTCACGGGt > 6:94891/1‑149 (MQ=255) gCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACCGTCGTCACGCGt > 2:108501/1‑149 (MQ=255) gCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACCGTCGTCACGCGt > 8:317958/1‑149 (MQ=255) cAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACCGTCGTCACGCGt > 4:201745/1‑148 (MQ=255) | CGTGCTTTGCCTGGGAATACTGGTCAACGCGCAAGCTGGACCGGGAATCGTGCTTCAAGGCATTTCTGCACAACCACTGGGCGGGGATGCTGGTGTTTATCGGAGTTGTGCTGGATTACGCGTTGCGCTGAGTAGTTTGGGGCCGCAGAGCGGCCCCGGCTATCTCATGGCTTGGCAACGTGCCAGACGTCTTTCATGCCGTCACCGGTCATGTCACCGGCCTTCTTGTCCTTGATGAAGGTATACAGCGGCTTGCCGTCGTAAGCCCACTGCATCGAACCGTCGTCACGCGT > NC_002947/6064429‑6064721 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |