Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,173,519 | T→C | 6.4% | N374D (AAT→GAT) | glmU ← | bifunctional N‑acetyl glucosamine‑1‑phosphate uridyltransferase/glucosamine‑1‑phosphate acetyl transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,173,519 | 0 | T | C | 6.4% | 274.6 / 6.5 | 93 | N374D (AAT→GAT) | glmU | bifunctional N‑acetyl glucosamine‑1‑phosphate uridyltransferase/glucosamine‑1‑phosphate acetyl transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/46); new base C (3/3); total (44/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.26e-01 |
TCGAGCCGGCTGCGGTGGTCGCGCCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGCGAGCAAAC > NC_002947/6173372‑6173664 | tCGAGCCGGCTGCGGTGGTCGCGCCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTg < 1:19394/149‑1 (MQ=255) tCGAGCCGGCTGCGGTGGTCGCGCCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTg < 3:211205/149‑1 (MQ=255) tCGAGCCGGCTGCGGTGGTCGCGCCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTg > 6:232704/1‑149 (MQ=255) tCGAGCCGGCTGCGGTGGTCGCGCCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTg < 6:357410/149‑1 (MQ=255) cGAGCCGGCTGCGGTGGTCGCGCCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTgg > 5:8953/1‑149 (MQ=255) gAGCCGGCTGCGGTGGTCGCGCCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGt < 4:88122/149‑1 (MQ=255) gAGCCGGCTGCGGTGGTCGCGCCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGt < 7:298303/149‑1 (MQ=255) gAGCCGGCTGCGGTGGTCGCGCCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGt < 6:385590/149‑1 (MQ=255) aGCCGGCTGCGGTGGTCGCGCCAGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTg > 7:125457/1‑149 (MQ=255) tCGCGCCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCg > 4:147591/1‑149 (MQ=255) tCGCGCCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAAAACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGAGCGCACCGATTTCg > 6:301526/1‑149 (MQ=255) tCGCGCAGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCg > 6:234182/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGAAATCGGTGCGCGCACCAATATCGGc < 1:335359/149‑1 (MQ=255) cgcCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCCCCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGAGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCa < 1:278087/149‑1 (MQ=255) cgcCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGc > 8:321386/1‑148 (MQ=255) gcCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCAt > 5:273217/1‑149 (MQ=255) cGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGGCTTCACCCATCACGGTCTTGCACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATcc < 4:69712/149‑1 (MQ=255) gCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATcccc < 6:8953/149‑1 (MQ=255) cTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATcccc > 6:18413/1‑147 (MQ=255) ttGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCag > 5:343058/1‑149 (MQ=255) gATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCagg > 5:116776/1‑148 (MQ=255) aTTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCaggta < 1:149077/149‑1 (MQ=255) aTTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCaggt < 3:96472/148‑1 (MQ=255) tttCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCaggtag < 5:232704/149‑1 (MQ=255) tttCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCaggta < 7:275744/148‑1 (MQ=255) ttCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCaggtagg > 5:301669/1‑149 (MQ=255) ttCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCaggtagg > 7:15883/1‑149 (MQ=255) cacaGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTc < 5:18413/148‑1 (MQ=255) cgcCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGAc < 2:248127/149‑1 (MQ=255) gcCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGAcc < 7:332464/149‑1 (MQ=255) caGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCGATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCTGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCt > 8:99190/1‑149 (MQ=255) caGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAgg < 1:15358/139‑1 (MQ=255) caGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAgg > 2:15358/1‑139 (MQ=255) caGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCt < 6:301669/149‑1 (MQ=255) aGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGAc > 1:145529/1‑142 (MQ=255) aGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGAc < 2:145529/142‑1 (MQ=255) ttgttCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGcccc < 1:23244/149‑1 (MQ=255) gttCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCtt > 1:231344/1‑149 (MQ=255) ttCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATCGGTGCGCGCACCAATATc > 6:24103/1‑107 (MQ=255) ttCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATCGGTGCGCGCACCAATATc < 5:24103/107‑1 (MQ=255) cGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCGCGCACCAATATCGGCGCCGGCAccatcac > 6:114367/1‑99 (MQ=25) cGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCGCGCACCAATATCGGCGCCGGCAccatcac < 5:114367/104‑6 (MQ=25) gAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCAcc > 1:212339/1‑149 (MQ=255) aaCCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCAccc < 5:673/149‑1 (MQ=255) tGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCTCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTgg < 6:116776/149‑1 (MQ=255) tGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTgg < 8:15883/149‑1 (MQ=255) gAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTggg > 8:211585/1‑149 (MQ=255) cacGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGt > 8:302699/1‑149 (MQ=255) cacGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGAGCCGATATTGGTGCGCGCCACGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGt > 3:224768/1‑149 (MQ=255) acGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGtt > 7:168261/1‑149 (MQ=255) acGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGtt > 8:268991/1‑149 (MQ=255) cGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGttt < 3:358339/149‑1 (MQ=255) gTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGtttt > 5:246168/1‑149 (MQ=255) gTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGtttt > 3:114258/1‑149 (MQ=255) tCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGttttt < 5:234182/149‑1 (MQ=255) tCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGttttt < 5:301526/149‑1 (MQ=255) ttCACCCATCACTGTCTTTAACTTGTAGGCGCCATAGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGAGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCa < 4:224768/149‑1 (MQ=255) aCCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGc < 1:206169/120‑1 (MQ=255) aCCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGc > 2:206169/1‑120 (MQ=255) cATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCaa > 6:136761/1‑149 (MQ=255) aCGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGaa < 7:268991/149‑1 (MQ=255) aCGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGaa < 3:147591/149‑1 (MQ=255) ggTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGt > 4:324231/1‑149 (MQ=255) ctcatGAACTTGTTGCCGCCATCGTACTTGCAGTTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCTCACCGATTTCGGCATCCCCCATGTAGGGCAGGTGACCAGCCTTGTCCCCTTCACCCAGGTGGTCGTTTTTCAGTTCAACGAAGtt < 1:273685/145‑1 (MQ=255) tCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGttttt > 5:354650/1‑133 (MQ=255) tCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGttttt < 6:354650/133‑1 (MQ=255) tGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAg > 4:22528/1‑118 (MQ=255) tGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAg < 3:22528/118‑1 (MQ=255) tGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTAcc > 6:226379/1‑148 (MQ=255) aaCTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCca > 6:29542/1‑148 (MQ=255) cTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACAt < 2:231344/149‑1 (MQ=255) gttgGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATgg < 8:125457/148‑1 (MQ=255) gttgGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATgg < 7:321386/148‑1 (MQ=255) gttgGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATgg < 6:246168/148‑1 (MQ=255) cgcCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTg < 5:136761/149‑1 (MQ=255) cgcCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTg < 2:222604/149‑1 (MQ=255) tCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTc < 6:273217/149‑1 (MQ=255) tGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACg > 7:90530/1‑149 (MQ=255) aGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTg > 5:105681/1‑149 (MQ=255) aGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTg > 4:33525/1‑149 (MQ=255) ggTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTc < 8:266352/138‑1 (MQ=255) ggTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTc > 7:266352/1‑138 (MQ=255) gATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCa > 1:370077/1‑101 (MQ=255) gATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCa < 2:370077/101‑1 (MQ=255) ggTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGgc > 2:191134/1‑149 (MQ=255) gTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCTTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGgcg > 5:8848/1‑149 (MQ=255) gTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGgc < 5:29542/148‑1 (MQ=255) gTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGgc < 4:114258/148‑1 (MQ=255) atgcCGAAATCGGTGCGCGCACCAATATCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGCg > 3:357060/3‑149 (MQ=255) cgcCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGCGa < 6:343058/149‑1 (MQ=255) cgcCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGGTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGCGa < 2:212339/149‑1 (MQ=255) gATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGCGAGCa > 5:42503/1‑148 (MQ=255) tatTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGCGAGCAAAc > 1:343568/1‑149 (MQ=255) | TCGAGCCGGCTGCGGTGGTCGCGCCGGCCTTGATTTCCACAGGCGCCACCAGCGAGTTGTTCGAACCGATGAACACGTCTTCACCCATCACGGTCTTGAACTTGTTGGCGCCATCGTAGTTGCAGGTGATGGTGCCGGCGCCGATATTGGTGCGCGCACCGATTTCGGCATCCCCCAGGTAGGTCAGGTGACCAGCCTTGGCCCCTTCACCCAGGTGGGCGTTTTTCAGTTCAACGAAGTTACCCACATGGGCCTTGGCGTCCAGTACGCTGCCCGGGCGCAGGCGAGCAAAC > NC_002947/6173372‑6173664 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |