| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 660,940 | G→T | 10.3% | intergenic (+72/‑95) | speA → / → PP_0568 | biosynthetic arginine decarboxylase/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 660,940 | 0 | G | T | 10.3% | 180.8 / 10.2 | 66 | intergenic (+72/‑95) | speA/PP_0568 | biosynthetic arginine decarboxylase/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/31); new base T (4/3); total (32/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.88e-01 | |||||||||||
ACTGCGCGTGAGCGGACCCAGTATCTGGATGCCTTGCGCCTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGTTTACGTGGCGGTCGAGTGTCTGAATCCGG > NC_002947/660794‑661087 | aCTGCGCGTGAGCGGACCCAGTATCTGGATTCCTTGCGCCTGTGGTTGAGCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGAGGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGaa < 6:131142/149‑1 (MQ=255)aCTGCGCGTGAGCGGACCCAGTATCTGGATGCCTTGCGCCTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGa < 1:115402/148‑1 (MQ=255) cTGCGCGTGAGCGGACCCAGTATCTGGATGCCTTGCGCCTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAg < 7:30445/149‑1 (MQ=255) gcgTGAGCGGACCCAGTATCTGGATGCCTTGCGCCTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCt > 6:97007/1‑149 (MQ=255) aGCGGACCCAGTATCTGGATGCCTTGCGCCTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCAc > 6:150847/1‑147 (MQ=255) gACCCAGTATCTGGATGCCTTGCGCCTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGt > 2:102329/1‑149 (MQ=255) cccAGTATCTGGATGCCTTGCGCCTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTca < 7:170042/149‑1 (MQ=255) ccAGTATCTGGATGCCTTGCGCCTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTcc > 7:56936/1‑147 (MQ=255) gTATCTGGATGCCTTGCGCCTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAAc < 5:169068/149‑1 (MQ=255) gTATCTGGATGCCTTGCGCCTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGAGTCAAAAc > 8:364197/1‑149 (MQ=255) aTGCCTTGCGCCTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAAATGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTaaa > 1:84604/1‑148 (MQ=255) cTTGCGCCTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCTGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATcc > 1:341364/1‑149 (MQ=255) cTTGCGCCTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATcc < 7:156681/149‑1 (MQ=255) cgcCTGGGCTTTACCCGGTCTTTTTACCTGTCTTCTTTATTTACGGGGCCTCTCCTGCAATACCCCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCg < 1:125642/148‑1 (MQ=255) cgcCTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGcc < 1:102329/149‑1 (MQ=255) gcCTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGccc < 4:358777/149‑1 (MQ=255) cTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTg < 5:341750/149‑1 (MQ=255) cTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTg > 7:334431/1‑149 (MQ=255) cTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTg > 7:54662/1‑149 (MQ=255) ggCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGt < 1:358971/148‑1 (MQ=255) cccGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCa < 6:314035/149‑1 (MQ=255) cccGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCa > 4:141905/1‑149 (MQ=255) cccGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCa > 6:117637/1‑149 (MQ=255) ccGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCAc < 6:18095/149‑1 (MQ=255) tCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAAt < 8:334431/149‑1 (MQ=255) cGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGcc < 2:341364/148‑1 (MQ=255) cGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGcc < 5:97007/148‑1 (MQ=255) gTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGc > 7:87587/1‑149 (MQ=255) ccTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGTGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTAc < 4:58538/149‑1 (MQ=255) ccTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTAc < 1:149953/149‑1 (MQ=255) tGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCt > 6:169135/1‑149 (MQ=255) gtcgtcGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCtt > 7:345180/1‑149 (MQ=255) gtcgtcGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCtt > 7:104727/1‑149 (MQ=255) tAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGc < 7:167579/149‑1 (MQ=255) gggCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTTCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCa > 1:48713/1‑148 (MQ=255) ggCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTTCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCaaa < 2:48713/149‑1 (MQ=255) ggCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCCCCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCa > 1:309694/1‑147 (MQ=255) ggCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCaaa < 8:54662/149‑1 (MQ=255) gCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGa > 4:267664/1‑148 (MQ=255) cAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGata > 3:150106/1‑149 (MQ=255) aaaa‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGatat > 2:386049/1‑149 (MQ=255) gtgCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTc > 6:138123/1‑149 (MQ=255) tgctgcCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTcc < 3:267664/149‑1 (MQ=255) ccTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAgg < 8:345180/147‑1 (MQ=255) tgtgGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCa < 5:138123/148‑1 (MQ=255) tgGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCg > 8:148423/1‑149 (MQ=255) ggAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGtt < 1:377414/149‑1 (MQ=255) tcgCGGCATTGCGTCGCGATATGATGGCTAAGCCATCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGttt < 3:194601/147‑1 (MQ=255) gCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTTGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGTTTAc < 7:364197/149‑1 (MQ=255) cTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGTTTACGTGGc > 2:47673/1‑149 (MQ=255) ttGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCTGCCCTGGTCCATCACAACAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTACCAACGATTACGTcgcg > 5:270928/1‑149 (MQ=255) gTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGTTTACGTGGCGGTc > 2:248915/1‑148 (MQ=255) gctggtGAGGGCTTCGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGTTTACGTGGCGGTCGAgtg > 2:298670/6‑149 (MQ=255) tggtGAGGGCTTCGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCTCCGTCCAGGCGCCCATCGTTTACGTGGCGGTCGAGTGTc > 6:306136/4‑149 (MQ=255) tggtGAGGGCTTCGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGTTTAAGTGGCGGTCTAgtt > 6:311360/4‑146 (MQ=255) tGAGGGCTTCGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCaa > 3:229191/1‑108 (MQ=255) tGAGGGCTTCGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCaa < 4:229191/108‑1 (MQ=255) tGAGGGCTTCGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGTTTACGTGGCGGTCGAGTGTCTGa < 1:298670/149‑1 (MQ=255) tGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGTTTACGTGGCGGTCGAGTGTCTGa < 3:141905/149‑1 (MQ=255) gAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGTTTACGTGGCGGTCGAGTGTCTGaa > 8:55980/1‑149 (MQ=255) aGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGTTTACGTGGCGGTCGAGTGTCTGAAt > 2:266235/1‑149 (MQ=255) aGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGTTTACGTGGCGGTCGAGTGTCTGAAt < 1:386049/149‑1 (MQ=255) ggCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGTTTACGTGGCGGTCGAGTGTCTGAATcc > 4:326784/1‑149 (MQ=255) gCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGTTTACGTGGCGGTCGAGTGTCTGAATCCg < 7:55980/149‑1 (MQ=255) gCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGTTTACGTGGCGGTCGAGTGTCTGAATCCg < 8:87587/149‑1 (MQ=255) cGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCACACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGTTTACGTGGCGGTCGAGTGTCTGAATCCgg < 4:254471/149‑1 (MQ=255) | ACTGCGCGTGAGCGGACCCAGTATCTGGATGCCTTGCGCCTGGGCTTGACCCGGTCTTCGTACCTGTCGTCGTAATTGACGGGGCCGCTCCTGCAAAA‑‑GCCTGTGCTGCCTTTTGTGGGAGCGGCCTTGCGTCGCGATATGAGGGCGAAGCCCTCACCAGCGTCACAACCGGTAAATATCCGGCCCTGGTCCATCGCACCAATGCCGCTACCTTTGAATGCAATGTTCAAAGGAGGACGATATGCAACGTCCAGGCTCCCATCGTTTACGTGGCGGTCGAGTGTCTGAATCCGG > NC_002947/660794‑661087 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |