| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 726,621 | C→T | 6.0% | E45K (GAA→AAA) | PP_0620 ← | GntR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 726,621 | 0 | C | T | 6.0% | 255.4 / 3.8 | 83 | E45K (GAA→AAA) | PP_0620 | GntR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/39); new base T (3/2); total (42/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.30e-01 | |||||||||||
AAGTGCAGGTAGTTGCGCAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGAGCATTTCGC > NC_002947/726473‑726758 | aaGTGCAGGTAGTTGCGCAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTc < 3:330211/149‑1 (MQ=255) tGCAGGTAGTTGCGCAGTGCGCTGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCTTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCCAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGaa < 8:273775/149‑1 (MQ=255) tGCAGGTAGTTGCGCAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGaa < 5:287462/149‑1 (MQ=255) gCAGGTAGTTGCGCAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGaaa > 8:328106/1‑149 (MQ=255) cAGGTAGTTGCGCAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGaaa < 8:281428/148‑1 (MQ=255) gTAGTTGCGCAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTTCGAATGCt > 7:298666/1‑149 (MQ=255) gTAGTTGCGCAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCt < 3:109621/149‑1 (MQ=255) ttGCGCAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTTCGAATGCTCCaa < 8:298666/149‑2 (MQ=255) cgcAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGGCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCTTTGA‑‑GGGCTTCGCGGTCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCa < 1:92074/148‑1 (MQ=255) gcAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGc > 2:27933/1‑149 (MQ=255) cgGCTGGCGTGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTTGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTc < 4:61473/149‑1 (MQ=255) gctggctgGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCgg < 3:185636/149‑1 (MQ=255) ggctggTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCAt > 1:151398/1‑132 (MQ=255) ggctggTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCAt < 2:151398/132‑1 (MQ=255) ctggTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTagg > 1:266650/1‑148 (MQ=255) ggTTCGGTGCCCACTTCGTTCGGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTaggcag > 8:23831/1‑149 (MQ=255) ttCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTaggcaggc > 4:292850/1‑149 (MQ=255) cGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCgg > 1:225835/1‑149 (MQ=255) gTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTc > 4:202708/1‑149 (MQ=255) ccACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAACTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCg > 4:172041/1‑149 (MQ=255) cACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCgg > 7:230364/1‑149 (MQ=255) cACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCgg > 5:347757/1‑149 (MQ=255) aCTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCggg < 1:48071/149‑1 (MQ=255) aCTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCggg < 1:27933/149‑1 (MQ=255) gTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCa < 2:55328/149‑1 (MQ=255) ttCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAg > 3:183794/1‑149 (MQ=255) tCAGGTAGGCGCCACCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCCCCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTTA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGATCCATCAGCTCACGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGTGTGCAgc > 8:277911/1‑149 (MQ=255) gTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCtt > 5:319446/1‑149 (MQ=255) gTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCtt > 3:295200/1‑149 (MQ=255) ggCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCg < 7:23831/148‑1 (MQ=255) ggCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCg < 7:83646/148‑1 (MQ=255) gcgcCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCgg < 8:230364/148‑1 (MQ=255) cgcCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTg < 3:480/149‑1 (MQ=255) gcCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGGTCCATCAGCTCCCGCGCGGGAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTgg > 8:282162/1‑148 (MQ=255) ccccGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGAGGGGGATTCGCGGGCGGTGCCCTTGGCGCATTCGAAATGGGCCAACAGCTCCCGGTCGGTAGGCAGGCGGTCGGCGGGGTGCAGCGCTTCGGtca > 1:106224/1‑147 (MQ=255) ccccGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGAc > 2:341732/1‑148 (MQ=255) cccGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGa > 3:88532/1‑149 (MQ=255) cccGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGa > 3:369620/1‑149 (MQ=255) cGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATc > 3:314215/1‑149 (MQ=255) gTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGa < 6:319446/149‑1 (MQ=255) ggCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAgcgc > 2:289070/1‑149 (MQ=255) ggCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAgcgc > 5:89207/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCt < 7:328106/149‑1 (MQ=255) ccGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCtt > 4:46576/1‑149 (MQ=255) ggTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGa < 7:235845/149‑1 (MQ=255) ggTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGa < 3:202708/149‑1 (MQ=255) ggTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCCAGCGCTTGa < 3:46576/149‑1 (MQ=255) gTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGAc < 4:88532/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGAtt > 7:160614/1‑149 (MQ=255) ggTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGAtt < 6:89207/149‑1 (MQ=255) tGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTc > 1:321143/1‑148 (MQ=255) cTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTcga < 4:295200/148‑1 (MQ=255) cTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTcga < 3:141117/148‑1 (MQ=255) 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ttCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTgg < 4:220757/149‑1 (MQ=255) gcgggcggTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATc > 1:61108/1‑120 (MQ=255) gcgggcggTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATc < 2:61108/120‑1 (MQ=255) gcgggcggTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGt < 4:183794/148‑1 (MQ=255) gggcggTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTg < 2:225835/149‑1 (MQ=255) ggcggTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGa < 1:10013/149‑1 (MQ=255) tGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGAGCAtt > 5:85743/1‑149 (MQ=255) ccTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGAtt > 6:253279/1‑96 (MQ=255) ccTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGAtt < 5:253279/96‑1 (MQ=255) ccTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGAGCATTTCg > 2:366144/1‑149 (MQ=255) gatGGAGCATTTCGAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGGGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGAGCATTTCGc > 1:280712/3‑149 (MQ=255) ttGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCCCATCGGACAGCTTCTGGCGCTTga > 2:283147/1‑126 (MQ=255) ttGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGc > 2:277938/1‑127 (MQ=255) ttGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGc < 1:277938/127‑1 (MQ=255) tGGAGCATTTCGAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGt < 6:129905/128‑1 (MQ=255) tGGAGCATTTCGAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGt > 5:129905/1‑128 (MQ=255) | AAGTGCAGGTAGTTGCGCAGTGCGCGGCTGGCTGGTTCGGTGCCCACTTCGTTCAGGTAGGCGCCCCCGGTCGGGCCGGTGCGGGTGCTCACCAGGCCTTCGACTTCGAGCGCCTTGA‑‑GGGCTTCGCGGGCGGTGCCCTTGGAGCATTCGAAATGCTCCATCAGCTCCCGCTCGGTAGGCAGGCGGTCGCCGGGGTGCAGCGCTTCGGTGACGATCGAGCGCTTGACTGATTCGACGATCACATCGGACAGCTTCTGGCGCTTGCGTTTGGGTTTGAGCATTTCGC > NC_002947/726473‑726758 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |