| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 138,596 | G→T | 5.8% | L499L (CTG→CTT) | PP_0131 → | membrane‑anchored phosphodiesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 138,596 | 0 | G | T | 5.8% | 223.5 / 3.7 | 69 | L499L (CTG→CTT) | PP_0131 | membrane‑anchored phosphodiesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/30); new base T (2/2); total (37/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.55e-01 | |||||||||||
TGAAAATCGACAAGGCATTCATCGACGCTCTGGGCCACGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGT > NC_002947/138454‑138741 | tGAAAATCGACAAGGCATTCATCGACGCTCTGGGCCACGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGaa > 6:195516/1‑148 (MQ=255)tGAAAATCGACAAGGCATTCATCGACGCTCTGGGCCACGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGaa > 4:70725/1‑148 (MQ=255) aaaaTCGACAAGGCATTCATCGACGCTCTGGGCCACGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACa < 5:326232/148‑1 (MQ=255) aaGGCATTCATCGACGCTCTGGGCCACGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCGTGACTTGCACCTGCGGGTAGTTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGt > 8:243933/1‑149 (MQ=255) aTTCATCGACGCTCTGGGCCACGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATTGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCTAGTTCGAGGAACAGGCGGTGCTGCTGAAAAGCGAGGGCGTCAAt > 2:228212/1‑148 (MQ=255) aTTCATCGACGCTCTGGGCCACGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCatt > 4:91417/1‑146 (MQ=255) aTTCATCGACGCTCTGGGCCACGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAAtt < 1:329085/149‑1 (MQ=255) aTCGACGCTCTGGGCCACGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATgg > 3:310199/1‑149 (MQ=255) aTCGACGCTCTGGGCCACGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCAAGGGGGTCAATTATgg < 3:278222/149‑1 (MQ=255) tCGACGCTCTGGGCCACGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGc > 3:367967/1‑149 (MQ=255) gCTCTGGGCCACGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAggg > 1:223410/1‑149 (MQ=255) ggCCACGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTgg < 4:50402/147‑1 (MQ=255) ggCCACGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTg < 3:70725/146‑1 (MQ=255) cGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTTCTGAACAGCGAgggg < 3:326812/121‑1 (MQ=255) cGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTTCTGAACAGCGAgggg < 3:321290/121‑1 (MQ=255) cGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTTCTGAACAGCGAgggg > 4:321290/1‑121 (MQ=255) cGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTTCTGAACAGCGAgggg > 4:326812/1‑121 (MQ=255) gccgccAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCg > 7:284251/1‑149 (MQ=255) cAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGc < 4:336759/149‑1 (MQ=255) aGTAGCGGTGTGGCCACGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATCATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCt < 2:336807/149‑1 (MQ=255) ggggTGTGGGCTCGGTTATCATCCTCATGTCCCATGACTTGCACATGGGGGTAATTGCCGAAGGTATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCGAGGGCTGGTTGTTTGCCGGGCCGCTGaa < 1:228212/146‑1 (MQ=255) gCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGc < 4:367967/148‑1 (MQ=255) ccGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGtt > 7:156523/1‑149 (MQ=255) cGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGttt < 2:223410/149‑1 (MQ=255) gCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTg < 5:195516/149‑1 (MQ=255) gCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTg > 8:326940/1‑149 (MQ=255) atcCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGtt < 5:42890/149‑1 (MQ=255) tcCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCAGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTg > 4:273848/1‑149 (MQ=255) cGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTgg < 1:30196/148‑1 (MQ=255) gCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGt > 2:125595/1‑148 (MQ=255) cATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGcc < 4:140934/95‑1 (MQ=255) cATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGcc > 3:140934/1‑95 (MQ=255) cATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGcc < 1:216930/139‑1 (MQ=255) cATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGcc > 2:216930/1‑139 (MQ=255) cATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGa < 1:125595/149‑1 (MQ=255) tGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACt > 6:38505/1‑149 (MQ=255) gCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCg > 3:299863/1‑149 (MQ=255) cccATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAgggg < 1:114066/77‑1 (MQ=255) cccATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAgggg > 2:114066/1‑77 (MQ=255) ccATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTg > 3:69312/1‑149 (MQ=255) ccATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTg > 3:74430/1‑149 (MQ=255) cATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTgg < 3:328020/149‑1 (MQ=255) aTGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTggg > 8:176023/1‑149 (MQ=255) aTGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTggg > 5:91721/1‑149 (MQ=255) ttGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCt > 8:22246/1‑149 (MQ=255) gCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATGGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCGGAACGCCCGGGAGGTTGCGGAGGTGGTGGGGCGTGGGCACCGGc > 2:350072/1‑149 (MQ=255) cGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAg < 1:241060/111‑1 (MQ=255) cGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAg > 2:241060/1‑111 (MQ=255) gggTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGcggcgg < 3:222276/149‑1 (MQ=255) ggTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCggg < 5:235088/149‑1 (MQ=255) ggTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCggg < 5:38505/149‑1 (MQ=255) aTTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGgtgt < 4:299863/148‑1 (MQ=255) gAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGcgcg > 8:144071/1‑149 (MQ=255) aaGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGt < 6:91721/149‑1 (MQ=255) aGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTc < 4:310199/149‑1 (MQ=255) gAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTgg < 3:137125/65‑1 (MQ=255) gAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTgg > 4:137125/1‑65 (MQ=255) aTCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAg < 8:284251/149‑1 (MQ=255) tCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGc > 7:300840/1‑149 (MQ=255) gAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGa > 7:222552/1‑149 (MQ=255) aGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGAt < 7:22246/149‑1 (MQ=255) ttCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGAt > 1:381440/1‑147 (MQ=255) gAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGAAGGCGCGTCGAAGCGATCAGAc < 7:243933/149‑1 (MQ=255) ccAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGc > 4:97954/1‑148 (MQ=255) cAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCaa > 4:318508/1‑149 (MQ=255) ggCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACg > 6:46748/1‑149 (MQ=255) ggCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACg > 6:41406/1‑149 (MQ=255) gTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCAt < 8:156523/149‑1 (MQ=255) gTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGAAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCAt > 5:150400/1‑149 (MQ=255) tgctgcTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATg < 2:163788/149‑1 (MQ=255) ctgctgAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGTTCAGACCGGCAACGCCATGt < 7:326940/148‑1 (MQ=255) | TGAAAATCGACAAGGCATTCATCGACGCTCTGGGCCACGATGCCGCCAGTAGCGGTGTGGCCCCGCATATCATCCGCATGGCCCATGACTTGCACCTGCGGGTAATTGCCGAAGGAATCGAGTTCGAGGACCAGGCGGTGCTGCTGAACAGCGAGGGGGTCAATTATGGCCAGGGCTGGTTGTTTGCCCGGCCGCTGAACGCCCGGCAGTTTGCCGAGTTGGTGACTCGTGGGCACCTGCCGCGGCGGGTGTAGGCGCGTCGAAGCGATCAGACCGGCAACGCCATGT > NC_002947/138454‑138741 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |