Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 840,650 | T→A | 5.8% | I18F (ATC→TTC) | ispE ← | 4‑diphosphocytidyl‑2C‑methyl‑D‑erythritol kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 840,650 | 0 | T | A | 5.8% | 201.1 / 2.4 | 69 | I18F (ATC→TTC) | ispE | 4‑diphosphocytidyl‑2C‑methyl‑D‑erythritol kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/35); new base A (2/2); total (32/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.06e-01 |
AGGTTGCTGTCGTGGGGGACGGCCTCGATCTCGGTGTGCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGTGCAGCTTCAGGCGCTCGGGCAACC > NC_002947/840502‑840794 | aGGTTGCTGTCGTGGGGGACGGCCTCGATCTCGGTGTGCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCgatgat < 8:32192/149‑1 (MQ=255) ggTTGCTGTCGTGGGGGACGGCCTCGATCTCGGTGTGCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCACTAAGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGatgatg > 4:259629/1‑149 (MQ=255) cTGTCGTGGGGGACGGCCTCGATCTCGGTGTGCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCa < 4:294580/148‑1 (MQ=255) tCGTGGGGGACGGCCTCGATCTCGGTGTGCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGcc < 3:259629/148‑1 (MQ=255) tCGTGGGGGACGGCCTCGATCTCGGTGTGCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCca > 2:215102/1‑149 (MQ=255) cGGCCTCGATCTCGGTGTGCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGc < 3:378546/149‑1 (MQ=255) cTCGATCTCGGTGTGCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTgg > 8:77475/1‑149 (MQ=255) cTCGATCTCGGTGTGCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTgg > 4:170634/1‑149 (MQ=255) cTCGATCTCGGTGTGCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTgg > 1:65106/1‑149 (MQ=255) cTCGATCTCGGTGTGCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGATTg > 1:348968/1‑148 (MQ=255) cTCGATCTCGGTGTGCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCAAAGGTTGAGCTTgg > 3:99354/1‑149 (MQ=255) ggTGTGCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCggg < 2:65106/145‑1 (MQ=255) tgtgCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGAtgtg < 4:306387/118‑1 (MQ=255) tgtgCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGAtgtg > 3:306387/1‑118 (MQ=255) gCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGAAGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAgg > 5:90805/1‑149 (MQ=255) gCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGAAGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAgg > 5:96227/1‑149 (MQ=255) cAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAgg < 2:149450/148‑1 (MQ=255) cAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAgg < 3:170634/148‑1 (MQ=255) aaGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGt > 6:324847/1‑149 (MQ=255) cGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAg < 1:212039/149‑1 (MQ=255) gATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCt > 8:29425/1‑149 (MQ=255) aTCACGCCATCGTCACGCCGGGCAAAACTCAGGTCGTCGCCATGGTCTAGACACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGc < 6:202185/147‑1 (MQ=255) aCGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTg > 3:352721/1‑149 (MQ=255) gCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCa < 5:324847/149‑1 (MQ=255) ccATCGTCCCGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGGTGTAGCCGTCGGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCAt < 3:28534/149‑1 (MQ=255) aTCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGc < 5:28532/149‑1 (MQ=255) gTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGAt > 5:119642/1‑149 (MQ=255) cACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATc > 8:79273/1‑148 (MQ=255) cGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGAAGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAAt < 6:96227/149‑1 (MQ=255) cGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGAAGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAAt < 6:90805/149‑1 (MQ=255) gCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATg > 2:68440/1‑149 (MQ=255) gtcAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGATTCCAGTTCGTGGAAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATCTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAACTTTTGCATGCGATCAATGccc > 5:304896/3‑148 (MQ=255) cAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCGATGCCCCAg > 2:297469/1‑149 (MQ=255) aaCTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTg > 6:248690/1‑149 (MQ=255) tCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGgcg > 8:233779/1‑149 (MQ=255) gtcgCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGc < 2:189465/149‑1 (MQ=255) cgCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCa < 1:215102/149‑1 (MQ=255) gCCATGGTCTAGAAACTGTAAGACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCTTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGTGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCa < 6:304896/148‑1 (MQ=255) aTGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTcc < 7:79273/149‑1 (MQ=255) aTGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCAACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTcc > 5:379576/1‑149 (MQ=255) tCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGa < 4:372192/149‑1 (MQ=255) tAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGac > 6:80990/1‑148 (MQ=255) aaaCTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGaccac > 7:229262/1‑148 (MQ=255) aaCTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGAccacca < 4:99354/149‑1 (MQ=255) cTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAg‑g < 5:137473/149‑1 (MQ=255) tGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAg‑gg > 4:30763/1‑149 (MQ=255) tGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAg‑gg > 1:4659/1‑149 (MQ=255) tGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAg‑gg > 1:60602/1‑149 (MQ=255) acCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGt > 4:33541/1‑149 (MQ=255) cGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTc > 3:195463/1‑148 (MQ=255) gtatCCCGTTCGTGGTAGCCGGCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCACCCACAGGGTCCGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCa < 8:169772/146‑1 (MQ=255) tttCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAg < 5:248690/149‑1 (MQ=255) tttCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAg < 7:77475/149‑1 (MQ=255) tttCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGAATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAg > 2:64559/1‑149 (MQ=255) cAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTcc < 5:80990/149‑1 (MQ=255) gTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGc > 7:68314/1‑114 (MQ=255) gTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGc < 8:68314/114‑1 (MQ=255) ttCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTg < 6:119642/149‑1 (MQ=255) gTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGc < 3:370950/110‑1 (MQ=255) gTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGc > 4:370950/1‑110 (MQ=255) gTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAg < 2:115726/139‑1 (MQ=255) gTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAg > 1:115726/1‑139 (MQ=255) tGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGt < 7:210127/149‑1 (MQ=255) tGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGt > 7:330883/1‑149 (MQ=255) gTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCTATGATGGGCATCCACAGGTTGAGCTTGGTCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGTGc < 2:348968/149‑1 (MQ=255) gTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGTGc < 2:4659/149‑1 (MQ=255) tAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGTGCa < 4:83374/149‑1 (MQ=255) ccGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGTGCAGCt > 6:76165/1‑149 (MQ=255) cGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAGAGGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGTGCAGCt < 1:226506/149‑1 (MQ=255) gtctcggcggcgGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGTGCAGCTTc < 2:328833/143‑1 (MQ=255) cgcgGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGTGCAGCTTCAGgc < 7:29425/148‑1 (MQ=255) cggcCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGCGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGTGCAGCTTCAGGCGCTCgg < 3:30763/149‑1 (MQ=255) cggcCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGTGCAGCTTCAGGCGCTCgg < 8:229262/149‑1 (MQ=255) gatgatGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGTGCa < 1:85451/129‑1 (MQ=255) gatgatGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGTGCa > 2:85451/1‑129 (MQ=255) gatgatGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGTGCAGCTTCAGGCGCTCGGGCAAc > 4:200779/1‑149 (MQ=255) atgatgTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGTGCAGCTTCAGGCGCTCGGGCAAcc < 4:352721/149‑1 (MQ=255) | AGGTTGCTGTCGTGGGGGACGGCCTCGATCTCGGTGTGCAAGCGGATCACGCCATCGTCACGCAGGGCAAAACTCAGTTCGTCGCCATGGTCTAGAAACTGAAACACCGTTTCCAGTTCGTGGTAGCCGTCTGCGCGGCGGCCGATGATGTGCAGCCACAGGTTGAGCTTGGCCGGGGCGGGCAGGGTGAGCTTTTGCATGCGATCAATGCCCCAGCTGGCGCGGCTGCCAGTCCTTGACCACCAG‑GGTCACGTCCAGGTCCTTGCCGTGCAGCTTCAGGCGCTCGGGCAACC > NC_002947/840502‑840794 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |