Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 917,209 | T→A | 6.1% | N120Y (AAT→TAT) | PP_0798 ← | GGDEF domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 917,209 | 0 | T | A | 6.1% | 198.3 / 2.7 | 65 | N120Y (AAT→TAT) | PP_0798 | GGDEF domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/35); new base A (2/2); total (28/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.06e-01 |
ATACACCAGTCCAGGTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACTTCCGGCAGTTCCTTGCGGCCAACCGCCCAGATCAAGCCTTGCAGGGATTGGTCG > NC_002947/917061‑917354 | aTACACCAGTCCAGGTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATAtt < 4:355773/149‑1 (MQ=255) aTACACCAGTCCAGGTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATAtt < 4:350090/149‑1 (MQ=255) cacCAGTCCAGGTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGc < 2:26431/148‑1 (MQ=255) acCAGTCCAGGTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCct > 5:13171/1‑149 (MQ=255) acCAGTCCAGGTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCct > 6:115517/1‑149 (MQ=255) acCAGTCCAGGTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCct > 3:184879/1‑149 (MQ=255) acCAGTCCAGGTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCct > 7:330111/1‑149 (MQ=255) acCAGTCCAGGTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATAGCct > 3:200939/1‑149 (MQ=255) acCAGTCCAGGTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATAGCct > 3:195697/1‑149 (MQ=255) gTCCAGGTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCcttgct < 4:327001/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGt > 3:79472/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTAGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTAGCCAACGATATTGCCTTGCTTGt > 4:120850/1‑149 (MQ=255) ggTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTcc < 8:71178/149‑1 (MQ=255) gTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCcttgctt < 2:72161/144‑1 (MQ=255) gTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCcttgctt > 1:72161/1‑144 (MQ=255) gCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGc > 4:164624/1‑148 (MQ=255) gCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGc < 1:368345/148‑1 (MQ=255) ccAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCca < 2:287810/149‑1 (MQ=255) ccAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCca > 4:204450/1‑149 (MQ=255) cAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCca > 6:50365/1‑148 (MQ=255) ggCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGTCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCTCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCAc < 7:265871/147‑1 (MQ=255) ggCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCAc < 6:22070/147‑1 (MQ=255) cTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGAGGGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTc > 1:29945/1‑148 (MQ=255) aaGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCgcgc < 2:47572/149‑1 (MQ=255) aGGGGGGCCCACCAGCAAGACGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCACGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCGACTGGTGGAGTCGCCCACGATATTGCCTTGATTGTCCAGCCAAAGCACGTCAACGCGCt > 8:186151/1‑149 (MQ=255) gggggCCCACCAGCAAGCCGA‑TGTTGGCATTGTTCTGGTGTGCCGTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAAAGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTg < 7:186151/149‑1 (MQ=255) gggggCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTg > 8:237524/1‑149 (MQ=255) ggggCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGc < 7:307323/149‑1 (MQ=255) ccaccaGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTc > 3:70706/1‑148 (MQ=255) caccaGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACCCCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCACCGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTcga > 8:65956/1‑149 (MQ=255) caGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTcgacg > 2:199896/1‑148 (MQ=255) cAAGCCGA‑GGGTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAgg < 3:204450/149‑1 (MQ=255) aGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCt > 4:104207/1‑149 (MQ=255) cGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCa < 4:184879/149‑1 (MQ=255) cGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCa < 2:335467/149‑1 (MQ=255) cGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCa < 3:265466/149‑1 (MQ=255) gTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGa < 7:51742/149‑1 (MQ=255) gTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGa < 4:79472/149‑1 (MQ=255) gCATTGTGCTGGTTGGCCTTGAACACCCCTGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGGACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCTCCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGaaaa < 6:2031/148‑1 (MQ=255) ttGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAg < 6:298266/149‑1 (MQ=255) gtggGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTgg < 1:388198/148‑1 (MQ=255) cTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTCTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCg < 7:178227/149‑1 (MQ=255) gAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCggg < 4:70706/148‑1 (MQ=255) acacCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGGAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGcc < 5:50365/148‑1 (MQ=255) cccGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCAt > 1:20613/1‑116 (MQ=255) cccGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCAt < 2:20613/116‑1 (MQ=255) ccGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGAc > 6:381393/1‑149 (MQ=255) cGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACt > 2:217536/1‑149 (MQ=255) gTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACTTc < 1:199896/149‑1 (MQ=255) gTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATAGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACTTc < 4:200939/149‑1 (MQ=255) gTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATAGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACTTc < 4:195697/149‑1 (MQ=255) cGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGGCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACTTCCgg < 5:115517/148‑1 (MQ=255) cGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCggg < 6:195974/136‑1 (MQ=255) cGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGAGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCggg > 5:195974/1‑136 (MQ=255) ccTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGCGCCGGGGACTTCCGGCAGTTCCTTGCgg < 1:217536/149‑1 (MQ=255) cACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACTTCCGGCAGTTCCTTGCGGCCAACGGccc < 8:330111/149‑1 (MQ=255) gCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACTTCCGGCAGTTCCTTGCGGCCAACCGcc > 2:348172/1‑145 (MQ=255) cTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACTTCCGGCAGTTCCTTGCGGCCAACCGCCCAGATCaa < 3:164624/149‑1 (MQ=255) gAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGCAATTCCGGCAGTTCCTTGCGGCCAACCCCCCAGAACAAGCCTTg > 1:324966/1‑149 (MQ=255) gTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACTTCCGGCAGTTCCTTGCGGCCAACCGCCCAGATCAAGCCTTGCa < 6:13171/149‑1 (MQ=255) gCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACTTCCGGCAGTTCCTTGCGGCCAACCGCCCAGATCAAGCCTTGCAgg > 4:27597/1‑148 (MQ=255) ccAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACTTCCGGCAGTTCCTTGCGGCCAACCGCCCAGATCAAGCCTTGCAGGGa > 2:387458/1‑149 (MQ=255) cGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGTGCCGGGGACTTCCGGCAGTTCCTTGCGGCCAACCGCCCAGATCAAGCCTTGCAGGGATTgg < 3:120850/149‑1 (MQ=255) atatTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACTTCCGGCAGTTCCTTGCGGCCAACCGCCCAGATCAAGCCTTGCAGGGATTGGTc < 3:225394/149‑1 (MQ=255) tatTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACTTCCGGCAGTTCCTTGCGGCCAACCGCCCAGATCAAGCCTTGCAGGGATTGGTCg < 3:104207/149‑1 (MQ=255) atTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACTTCCGGCAGTTCCTTGCGGCCAACCGCCCAGATCAAGCCTTGCAgg > 6:140333/1‑139 (MQ=255) atTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACTTCCGGCAGTTCCTTGCGGCCAACCGCCCAGATCAAGCCTTGCAgg < 5:140333/139‑1 (MQ=255) | ATACACCAGTCCAGGTCGCCAAGCTTGGCCTTGAAAGGGGGGCCCACCAGCAAGCCGA‑GGTTGGCATTGTGCTGGTGGGCCTTGAACACCCCGGTTTCGCCGAAGTTGGCCTTGCGCGGCACGCTACTGGTGGAGTCGCCAACGATATTGCCTTGCTTGTCCAGCCACAGCACGTCACCGCGCTTGCGGTCGACGAAGGCTTCATTGAAAAGCAGGCGCTGGCGTATCGGGCCGGGGACTTCCGGCAGTTCCTTGCGGCCAACCGCCCAGATCAAGCCTTGCAGGGATTGGTCG > NC_002947/917061‑917354 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |