| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,158,927 | G→C | 6.2% | D354H (GAC→CAC) ‡ | gtsA → | mannose/glucose ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,158,927 | 0 | G | C | 6.2% | 259.1 / 5.6 | 81 | D354H (GAC→CAC) ‡ | gtsA | mannose/glucose ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/37); new base C (3/2); total (42/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.23e-01 | |||||||||||
ATCGACTCGTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGTTCTTCGATGTG > NC_002947/1158780‑1159070 | aTCGACTCGTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCg > 7:64634/1‑148 (MQ=255) tCGACTCGTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGa > 7:256700/1‑148 (MQ=255) tggtgTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGAAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTGTTCAGCATCAACAAGGGGTCGATCCCGGTACGCAACGCCTTGCTTGCCGACATGGGCAAGTAt > 2:351186/1‑149 (MQ=255) ttCAAGCATAACAACGCTGCCACCTCTGCTGGTCAGAAGTAAATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTTAGGAATTCCAGACGGTCTTCAGCATCAACAAGGTTACGATCCCGGTACGCAACGACATACTTGCCCATGTCGGCAAGCATgtcg < 1:286846/148‑4 (MQ=255) ttCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTTGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGATGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATTGGCAAGTATGGttt < 2:290868/149‑1 (MQ=255) ttCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGttt > 7:309325/1‑149 (MQ=255) ttCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGttt < 3:191775/149‑1 (MQ=255) ttCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATACTTGCCCATGTCGGCAAGCATgtcg < 5:353435/148‑4 (MQ=255) ttCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAACGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGCGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGCGCAAGTATCGttt > 8:195817/1‑149 (MQ=255) cAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGGTGGGTTAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCGCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTc < 7:195817/148‑1 (MQ=255) gCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATg > 8:59811/1‑149 (MQ=255) cAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGc < 1:206953/149‑1 (MQ=255) gAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCt < 8:64634/149‑1 (MQ=255) acaacGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCtgt < 6:122602/149‑1 (MQ=255) caacGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCg > 7:247703/1‑119 (MQ=255) caacGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCg < 8:247703/119‑1 (MQ=255) aacGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGc < 3:132435/149‑1 (MQ=255) aacGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGc > 8:213902/1‑149 (MQ=255) cTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCaa < 7:305407/149‑1 (MQ=255) gCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCaaa < 8:256700/147‑1 (MQ=255) aCCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGCCATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTc > 2:167287/1‑149 (MQ=255) ccactgctgGTGAGCAGCACATCGCCCCCAAGGTGGTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACTAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATTGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTcc < 8:361255/146‑1 (MQ=255) ccTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTcc < 8:212050/149‑1 (MQ=255) tgGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAg > 2:347648/1‑148 (MQ=255) gTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGAc > 7:151891/1‑149 (MQ=255) gTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGAc > 2:381504/1‑149 (MQ=255) cagcagGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACtt > 2:85874/1‑149 (MQ=255) agcagGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTc < 6:329128/149‑1 (MQ=255) agGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTg < 8:309325/149‑1 (MQ=255) agGACATCGCCAGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTg < 3:282896/149‑1 (MQ=255) tCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGAc > 8:311236/1‑149 (MQ=255) tCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGAc > 5:392591/1‑149 (MQ=255) ccGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCGCAAACCACCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGcc > 7:55853/1‑148 (MQ=255) gggTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGggcggc < 5:214792/148‑1 (MQ=255) gggTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGcc > 8:383/1‑149 (MQ=255) ggTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCt > 3:185216/1‑149 (MQ=255) ggTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCAAAAACGGGCGGCCt < 8:151891/149‑1 (MQ=255) gAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAA‑GGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCaa < 5:196560/149‑1 (MQ=255) ggACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAAc > 1:233114/1‑149 (MQ=255) cTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAAc < 5:104545/132‑1 (MQ=255) cTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAAc > 6:104545/1‑132 (MQ=255) cTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAAcc > 1:115957/1‑147 (MQ=255) cTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGa < 2:115957/149‑1 (MQ=255) ttCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAg > 6:332358/1‑149 (MQ=255) ccAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCa > 8:246452/1‑149 (MQ=255) gAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATgg < 1:347648/149‑1 (MQ=255) ggTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGgcg > 5:375056/1‑148 (MQ=255) tCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTgg > 6:154159/1‑108 (MQ=255) tCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTgg < 5:154159/108‑1 (MQ=255) tCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGca > 3:84092/1‑148 (MQ=255) cTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGTCCTGCAACCGAGCATGGCGcaca < 7:59811/149‑1 (MQ=255) ttCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCacaa > 6:104693/1‑149 (MQ=255) gCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATg > 1:92097/1‑149 (MQ=255) aTCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGACTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGc > 6:294125/1‑149 (MQ=255) tCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGcc < 2:233114/149‑1 (MQ=255) tCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGcc < 5:104693/149‑1 (MQ=255) tCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGc > 3:138006/1‑148 (MQ=255) gcaaGGGTGCGATCCCGGTAGGCAGCGACATGCTTGCCGACATGGGGATGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTGAGACCTCCGCCAGGGAGTTCCTGGCTGACGCCAAGCCGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGGACAACATGGccac > 4:54518/2‑148 (MQ=255) acaaGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGccacc > 7:252544/1‑149 (MQ=255) acaaGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGccac > 8:213903/1‑148 (MQ=255) aaGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCcaccac > 3:337423/1‑149 (MQ=255) ggTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCt > 2:111149/1‑149 (MQ=255) cGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGc < 7:213902/148‑1 (MQ=255) gATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGcc < 8:252544/148‑1 (MQ=255) gATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGcc < 6:375056/148‑1 (MQ=255) aTCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGt < 7:383/149‑1 (MQ=255) ccGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCa < 2:92097/149‑1 (MQ=255) ccGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCa < 4:185216/149‑1 (MQ=255) cGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAg > 2:181441/1‑149 (MQ=255) cGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAg > 4:10139/1‑149 (MQ=255) tACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGgc < 5:332358/149‑1 (MQ=255) gCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGcgcg < 7:213903/149‑1 (MQ=255) 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cATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGTTCTTCg < 1:381504/149‑1 (MQ=255) cATACTTGCCCATGTCGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACACCATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGttcttc > 7:265859/1‑148 (MQ=255) cATACTTGCCCATGTCGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGttcttc > 7:270883/1‑148 (MQ=255) tGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGTTCTTCGAt < 7:311236/149‑1 (MQ=255) tGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGACTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGTTCTTCGAt < 5:294125/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGTTCTTCGAtg > 3:140723/1‑149 (MQ=255) gCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTTCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGTTCTTCGAtgtg < 7:150424/147‑1 (MQ=255) | ATCGACTCGTTGGTGGTGTTCAAGCAGAACAACGCTGGCACCTCTGCTGGTCAGCAGGACATCGCCCGCAAGGTGTTGGGTGAGGACTTCCAGAAGGTCTTCAGCATCAACAAGGGTTCGATCCCGGTACGCAACGACATGCTTGCCGACATGGGCAAGTATGGTTTCGATGCCTGTGCTCAAACCTCCGCCAAGGACTTCCTGGCTGACGCCAAAACGGGCGGCCTGCAACCGAGCATGGCGCACAACATGGCCACCACGCTGGCCGTGCAGGGCGCGTTCTTCGATGTG > NC_002947/1158780‑1159070 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |