| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,160,444 | C→G | 5.6% | L86V (CTG→GTG) ‡ | gtsC → | mannose/glucose ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,160,444 | 0 | C | G | 5.6% | 233.4 / 4.1 | 71 | L86V (CTG→GTG) ‡ | gtsC | mannose/glucose ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/35); new base G (2/2); total (34/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.73e-01 | |||||||||||
CTGACCAGCTTCAAGACCCCCGAAGACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCG > NC_002947/1160297‑1160588 | ctgACCAGCTTCAAGACCCCCGAAGACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGc < 4:82263/148‑1 (MQ=255)ctgACCAGCTTCAAGACCCCCGAAGACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCt < 2:382740/149‑1 (MQ=255) aCCAGCTTCAAGACCCCCGAAGACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGTAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTCCCCGCGGTGCTGa > 4:379133/1‑148 (MQ=255) aCCAGCTTCAAGACCCCCGAAGACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGAt < 8:64975/149‑1 (MQ=255) ccAGCTTCAAGACCCCCGAAGACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGCCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGAtc > 8:62708/1‑149 (MQ=255) cccccGAAGACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGGAGATCAGCACcgcgggc < 6:280163/149‑4 (MQ=255) ccccGAAGACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTg < 8:331328/149‑1 (MQ=255) ccGAAGACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGAt > 6:157179/1‑133 (MQ=255) ccGAAGACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGAt < 5:157179/133‑1 (MQ=255) ccGAAGACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGt > 3:80541/1‑149 (MQ=255) cGAAGACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGATCTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTg > 4:274748/1‑149 (MQ=255) cGAAGACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTg < 3:5946/149‑1 (MQ=255) agcagcATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGc < 4:310606/144‑1 (MQ=255) aGACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCAc < 2:358893/149‑1 (MQ=255) gACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGGAGATCAGCACcgcgggc > 8:79051/1‑138 (MQ=255) gACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGGAGATCAGCACcgcgggc < 7:79051/141‑4 (MQ=255) aTCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGaa > 8:108947/1‑149 (MQ=255) aTCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGaa > 5:79641/1‑149 (MQ=255) accaccGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACgg > 6:325976/1‑149 (MQ=255) accaccGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACg < 4:80541/148‑1 (MQ=255) accGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTa > 8:35816/1‑149 (MQ=255) aaCCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCt > 4:360164/1‑149 (MQ=255) aCCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGGCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATATGCTg < 8:357425/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGt > 2:125842/1‑149 (MQ=255) ctgctgAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGt < 6:298946/148‑1 (MQ=255) ctgctgAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGt > 5:298946/1‑148 (MQ=255) tgctgAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCt > 1:144399/1‑138 (MQ=255) tgctgAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCt < 2:144399/138‑1 (MQ=255) tgctgAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTc > 2:213116/1‑148 (MQ=255) gctgAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGGTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGa < 5:219510/149‑1 (MQ=255) aGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGAtgtg < 2:15831/149‑1 (MQ=255) aGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGAtg < 2:217403/147‑1 (MQ=255) tGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGgcg > 5:37235/1‑149 (MQ=255) cTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTc > 8:296831/1‑149 (MQ=255) cAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGa < 1:213116/149‑1 (MQ=255) gTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAgg < 8:259030/149‑1 (MQ=255) gATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGtt > 8:154651/1‑149 (MQ=255) gATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGtt > 5:287727/1‑149 (MQ=255) tACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCg > 5:158467/1‑148 (MQ=255) ccGGCATTGGCGGGGTAATGGCGTGGGGAGCGGTGATCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCaa < 3:379133/149‑1 (MQ=255) aTAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGtt < 1:364009/149‑1 (MQ=255) cTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCg < 3:360164/149‑1 (MQ=255) tCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCctg > 2:309118/1‑149 (MQ=255) aGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCctgctg < 6:79641/149‑1 (MQ=255) aGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCctgctg < 8:224200/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCctgctgc > 2:39087/1‑149 (MQ=255) ggggAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCctgcttgaatgc > 2:141044/1‑142 (MQ=255) gggAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGtt < 7:296831/147‑1 (MQ=255) gggAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTACTTCGGCCTGCTGCTGtt < 7:154651/147‑1 (MQ=255) cgAGCCGTCACCGGTTACTTCTCCAACTCGATCATGATCACCGTGCCCTCGCTGCTCATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTCTCGATGTGCCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGATCTTCGGCCTGCTGCTGTTCgg < 4:83283/148‑1 (MQ=255) gAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGc > 1:39468/1‑149 (MQ=255) gAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGc < 7:108947/149‑1 (MQ=255) ggTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGtt < 2:39468/149‑1 (MQ=255) gTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGttt > 4:250196/1‑149 (MQ=255) tCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTc < 1:309118/149‑1 (MQ=255) tCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCACGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGATGATCGGCTGttta > 6:105060/1‑148 (MQ=255) aGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGAt < 5:272614/92‑1 (MQ=255) aGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGAt > 6:272614/1‑92 (MQ=255) aGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCt < 6:287727/149‑1 (MQ=255) gCGGTTACTTCTGGAACTAGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTg > 2:258315/1‑149 (MQ=255) cTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTc < 7:35816/148‑1 (MQ=255) gATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGtgctg < 5:325976/148‑1 (MQ=255) aTGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGcc < 6:37235/149‑1 (MQ=255) aTGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGcc > 4:188326/1‑149 (MQ=255) cGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGt > 6:365941/1‑149 (MQ=255) cGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCAGATGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGt > 1:316521/1‑149 (MQ=255) caatcgcgGTGGAGATCAGCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTTCCGGCCTCGtt > 4:253943/5‑148 (MQ=255) gCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCa > 3:266049/1‑149 (MQ=255) gCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGGTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCa < 3:274748/149‑1 (MQ=255) cccGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCa < 3:188326/148‑1 (MQ=255) ggTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCg > 4:23633/1‑149 (MQ=255) ggTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCGGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCg < 6:158467/149‑1 (MQ=255) | CTGACCAGCTTCAAGACCCCCGAAGACATCACCACCGGCAACCTGCTGAGCTGGCCTGCAGTGATTACCGGCATAGGCTGGGTCAAGGCCTGGGGAGCGGTCAGCGGTTACTTCTGGAACTCGATCATGATCACCGTGCCCGCGGTGCTGATCTCCACCGCGATTGGTGCACTGAACGGCTATGTGCTGTCGATGTGGCGCTTCCGAGGTTCGCAACTGTTCTTCGGCCTGCTGCTGTTCGGCTGTTTCCTGCCGTTCCAGACCGTGCTGCTGCCGGCCTCGTTCACCCTCG > NC_002947/1160297‑1160588 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |