| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,307,440 | C→G | 5.1% | G60R (GGC→CGC) | livK ← | branched‑chain amino acids ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,307,440 | 0 | C | G | 5.1% | 253.9 / 3.4 | 79 | G60R (GGC→CGC) | livK | branched‑chain amino acids ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (36/38); new base G (2/2); total (39/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.32e-01 | |||||||||||
GGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTACCCCGGCCAGTACCA > NC_002947/1307302‑1307586 | gggTGGAGCTGGATCACAGGTGTCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGtt < 8:337221/148‑1 (MQ=255) gagctggagcACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATc > 3:51940/1‑149 (MQ=255) gctggagcACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCGGGCGGCGTGGatggcaa < 3:286394/149‑6 (MQ=255) ctggagcACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCtt < 8:231865/149‑1 (MQ=255) ggagcACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGa > 4:109979/1‑149 (MQ=255) gagcACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGa < 4:51940/148‑1 (MQ=255) caGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTAGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGgctt > 8:200484/1‑149 (MQ=255) aGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGgcttg > 2:6148/1‑149 (MQ=255) gCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTgg < 7:224214/149‑1 (MQ=255) cACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGa > 1:148816/1‑149 (MQ=255) aCGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGAt < 2:148816/149‑1 (MQ=255) cTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGTCTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACt < 4:25175/149‑1 (MQ=255) aCGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAt > 6:244823/1‑149 (MQ=255) aCGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAt > 6:239405/1‑149 (MQ=255) gCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑Gt > 8:48518/1‑149 (MQ=255) cgtcgtTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCg < 1:232479/149‑1 (MQ=255) gtcgtTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGGTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGc < 5:85812/149‑1 (MQ=255) tcgtTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGAAGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGcc > 5:205933/1‑149 (MQ=255) gACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTAc < 7:200484/148‑1 (MQ=255) gACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTAc < 5:299855/148‑1 (MQ=255) aCCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTg < 2:9503/149‑1 (MQ=255) ccACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCg < 6:337441/143‑1 (MQ=255) ccACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCg > 5:337441/1‑143 (MQ=255) cTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGt > 2:361204/1‑148 (MQ=255) gttgGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGAGGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑g < 2:59410/148‑1 (MQ=255) gCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGAc < 1:306809/148‑1 (MQ=255) gCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGAc < 1:361204/148‑1 (MQ=255) aCTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGt > 7:268431/1‑149 (MQ=255) tGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTAGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACACCGCACGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGACGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCt > 6:100921/1‑149 (MQ=255) cACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTgg < 7:235884/149‑1 (MQ=255) gCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGAcc > 5:317806/1‑149 (MQ=255) cTGTTTAGGCTCGCAGGCGTCCTCGTATAACTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCCTTGATATACTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAAGTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGACTTGGGTCCgg > 4:278198/1‑149 (MQ=255) tttAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGa > 1:176544/1‑149 (MQ=255) tttAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGa > 7:104426/1‑149 (MQ=255) aGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGc > 2:106581/1‑149 (MQ=255) gggTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGccgcccgc > 8:182443/1‑59 (MQ=255) gggTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGccgcccgc < 7:182443/59‑1 (MQ=255) ggTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCg < 8:268431/149‑1 (MQ=255) tCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGAt > 6:338386/1‑149 (MQ=255) gCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCACC‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATc < 1:243476/149‑1 (MQ=255) gCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATc < 6:317806/148‑1 (MQ=255) cAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCtt > 2:259587/1‑149 (MQ=255) gCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGAt < 7:48518/149‑1 (MQ=255) cgtcgtcgtATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑CTGGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGAt < 1:259587/149‑1 (MQ=255) cgtcgtcgtATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATg < 6:203525/149‑1 (MQ=255) gtcgtcgtATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTTATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCATCGTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATg < 1:106581/149‑1 (MQ=255) gtcgtATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTAc < 4:42782/100‑1 (MQ=255) gtcgtATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTAc > 3:42782/1‑100 (MQ=255) gtcgtATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGTACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTAt < 1:6148/149‑1 (MQ=255) tcgtATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATc > 8:257817/1‑149 (MQ=255) gtATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATc < 7:181210/136‑1 (MQ=255) gtATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATc > 8:181210/1‑136 (MQ=255) tATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATcggc > 8:259418/1‑149 (MQ=255) aTTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATcggcg > 3:296383/1‑149 (MQ=255) ttCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATcggcgg < 3:109979/149‑1 (MQ=255) cTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGAt < 5:259873/135‑1 (MQ=255) cTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGAt > 6:259873/1‑135 (MQ=255) ttGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCaaa > 3:226239/1‑149 (MQ=255) ggCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCaaa < 8:104426/147‑1 (MQ=255) ggCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTCATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCaaa < 5:330829/147‑1 (MQ=255) ttCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAAt < 7:257817/149‑1 (MQ=255) cGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAAt < 7:259418/147‑1 (MQ=255) cGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAAt < 5:239405/147‑1 (MQ=255) cGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAAt < 5:244823/147‑1 (MQ=255) cATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAAtggctgg < 4:226239/149‑1 (MQ=255) cTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTa > 1:129728/1‑149 (MQ=255) ttGCCATCGACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGGTGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTAc > 3:41526/1‑149 (MQ=255) aggataTCAACGCCGCGGGCGGCGTGGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAAtgg > 7:102512/6‑141 (MQ=255) aggataTCAACGCCGCGGGCGGCGTGGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAAtgg < 8:102512/136‑1 (MQ=255) tGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTAcc > 4:11880/1‑149 (MQ=255) gCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAAtgg > 5:67943/1‑139 (MQ=255) gCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAAtgg < 6:67943/139‑1 (MQ=255) gCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTAccc > 5:160879/1‑149 (MQ=255) gCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTAccc > 1:308185/1‑149 (MQ=255) aTCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTACCCCgg > 3:365009/1‑149 (MQ=255) aTCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTACCCCgg > 2:40733/1‑149 (MQ=255) aTCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGAGGGTATCGGCGGCAAACGTATGGCGGGCTACCCCgg > 4:282411/1‑149 (MQ=255) tCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCTTCTTg > 7:127316/1‑90 (MQ=255) cACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTACCCCGGCCa < 2:129728/149‑1 (MQ=255) aaCGCCGCGGGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGAAAACGAATGGCTGGCTACCCCGGc > 2:19638/2‑147 (MQ=255) cgccgcCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTACCCCGGCCAGt < 1:40733/149‑1 (MQ=255) gcccgcGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTACCCCGGCCAGTACCa > 2:356087/1‑149 (MQ=255) | GGGTGGAGCTGGAGCACAGGTGGCCGACCACGAACTTGACGCCGTCGTTGACCACTTTGTTGGCGACTGCCACGGCCTGTTTAGGGTCGCAGGCGTCGTCGTATTCCTTGGCTTCGAGCATCTTGCCATCCACGCCGCCCGCGGCGTTGATATCCTTGATGGCTTGCTTGGCGCCGATGAACTGCAT‑GTCGCCGTACTGGGTCA‑C‑GGGACCCGTCTTGGGACCGGCGATGCCGATCTTGATGGTATCGGCGGCAAACGAATGGCTGGCTACCCCGGCCAGTACCA > NC_002947/1307302‑1307586 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |