| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,435,815 | A→T | 6.8% | L50Q (CTG→CAG) | PP_1256 ← | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,435,815 | 0 | A | T | 6.8% | 211.3 / 5.1 | 74 | L50Q (CTG→CAG) | PP_1256 | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/35); new base T (3/2); total (37/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.57e-01 | |||||||||||
AATGCGCGCCTTGGGCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCA > NC_002947/1435667‑1435962 | aaTGCGCGCCTTGGGCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCa < 7:240677/149‑1 (MQ=255)aaTGCGCGCCTTGGGCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCa < 7:235239/149‑1 (MQ=255) gcCTTGGGCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAgcgcg > 5:192667/1‑147 (MQ=255) gcCTTGGGCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCa < 6:192667/149‑1 (MQ=255) ggCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTg > 8:135607/1‑149 (MQ=255) gCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTgg < 3:130668/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCTGCGCGCTGGCCTggg < 3:180590/149‑1 (MQ=255) cGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACg > 2:175149/1‑149 (MQ=255) ggTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGCACATACTCCCGAATCCCTAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTgg < 1:126704/149‑1 (MQ=255) tCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCTGCGCGCTGGCCTgg < 8:48282/138‑1 (MQ=255) tCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCTGCGCGCTGGCCTgg > 7:48282/1‑138 (MQ=255) tCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGtt < 4:235328/148‑1 (MQ=255) aCGGCTCTGTCGATCAGGGACGCGCCGAGCTCCTCGTTCTGTGTGGCGTT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TGATGTAACACTGCTCGTTTGTCGAGCTATGTTTCGCTGTAGCCATCGATTTCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGTCCTGGGCCACGTGTTCGCCtgt < 4:283020/149‑1 (MQ=255) aCGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCtg < 8:143693/148‑1 (MQ=255) ggCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCCCGTGTTCGCCTGTgc > 7:299190/1‑149 (MQ=255) tCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAg > 6:13880/1‑149 (MQ=255) cGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAgg > 4:34216/1‑149 (MQ=255) gATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCTAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAgg > 1:274966/1‑148 (MQ=255) gATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAgg > 1:269585/1‑148 (MQ=255) gggCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑cc > 8:153618/1‑149 (MQ=255) cATCTCCGAGTGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGc < 4:162672/149‑1 (MQ=255) aTCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCtgt < 6:162244/129‑1 (MQ=255) aTCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCtgt > 5:162244/1‑129 (MQ=255) tCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTc > 1:337194/1‑149 (MQ=255) tCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTc > 5:131577/1‑149 (MQ=255) tCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGAGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTc > 5:371314/1‑149 (MQ=255) cGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCTGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAAc < 2:287994/149‑1 (MQ=255) cGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAAc < 6:33619/149‑1 (MQ=255) cGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAAc < 6:100957/149‑1 (MQ=255) cGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAAc < 7:296061/149‑1 (MQ=255) cGAGGGCCTCGAGCTGGGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCC‑GCAAGGAACTCTGCTCGTGCTTCGAGCGATGTTTCGCGGTCGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAAc < 8:248785/149‑1 (MQ=255) ccTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAGGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCtgt > 1:5523/1‑118 (MQ=255) ccTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCtgt < 2:5523/118‑1 (MQ=255) cTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGAc < 7:348176/149‑1 (MQ=255) tgtgtgGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCt > 4:380325/1‑130 (MQ=255) tgtgtgGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCt < 3:380325/130‑1 (MQ=255) gtgtgGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGtt > 6:79571/1‑149 (MQ=255) tgGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTggg < 5:138475/149‑1 (MQ=255) gAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGa > 7:239058/1‑149 (MQ=255) t‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGATCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCCACGACAGACCGGGGGGTGGGGCGagg > 8:289201/1‑147 (MQ=255) gCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATgg < 5:13880/148‑1 (MQ=255) t‑tCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCAc > 3:61497/1‑149 (MQ=255) ggAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGGTTGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGa > 1:275074/1‑99 (MQ=255) ggAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGa < 2:275074/99‑1 (MQ=255) tctGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTc > 3:296519/1‑149 (MQ=255) tctGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATCCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTc > 5:271815/1‑149 (MQ=255) tGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTcgc > 3:103822/1‑149 (MQ=255) tCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGc > 7:104507/1‑149 (MQ=255) cGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCt > 6:154076/1‑149 (MQ=255) cGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCt > 5:83544/1‑149 (MQ=255) gttgttCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGc < 2:274966/147‑1 (MQ=255) gttgttCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGc < 2:269585/147‑1 (MQ=255) gttgttCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTg > 3:349205/1‑149 (MQ=255) ttCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCg < 7:153618/148‑1 (MQ=255) ttCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATACCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCgg > 3:23534/1‑149 (MQ=255) aTGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACGGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGc < 6:131577/149‑1 (MQ=255) tttCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCctc > 8:139880/1‑149 (MQ=255) cgcgGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTg < 7:148045/148‑1 (MQ=255) cgcgGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTg < 5:154076/148‑1 (MQ=255) gcgGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTgg < 6:271815/148‑1 (MQ=255) gcgGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGc < 5:79571/149‑1 (MQ=255) gCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATcag > 6:374684/1‑149 (MQ=255) tCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCACCGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATccgcag > 6:300847/1‑149 (MQ=255) aaTGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGtt < 5:374684/149‑1 (MQ=255) ccgccCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑TCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCt < 1:175149/149‑1 (MQ=255) ccgccCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCt < 6:83544/149‑1 (MQ=255) cccAGGCCTGCGCGCTGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCtgt > 6:170866/1‑148 (MQ=255) cccAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCtgtg < 8:104507/149‑1 (MQ=255) cccAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCtgtg < 4:103822/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCTGCGCGCTGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCtgt > 4:275356/1‑147 (MQ=255) ccAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCtgt > 2:128115/1‑147 (MQ=255) ccAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGa < 1:24529/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGa < 4:349205/149‑1 (MQ=255) cAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGAt < 1:270298/96‑1 (MQ=255) cAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGAt > 2:270298/1‑95 (MQ=255) cAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCa > 7:22902/1‑149 (MQ=255) | AATGCGCGCCTTGGGCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCA > NC_002947/1435667‑1435962 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |