| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,435,822 | A→T | 6.6% | C48S (TGC→AGC) | PP_1256 ← | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,435,822 | 0 | A | T | 6.6% | 223.4 / 5.1 | 76 | C48S (TGC→AGC) | PP_1256 | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/37); new base T (3/2); total (37/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.76e-01 | |||||||||||
GCCTTGGGCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCT > NC_002947/1435674‑1435970 | gcCTTGGGCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCa < 6:192667/149‑1 (MQ=255) ggCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTg > 8:135607/1‑149 (MQ=255) gCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTgg < 3:130668/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCTGCGCGCTGGCCTggg < 3:180590/149‑1 (MQ=255) cGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACg > 2:175149/1‑149 (MQ=255) ggTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGCACATACTCCCGAATCCCTAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTgg < 1:126704/149‑1 (MQ=255) tCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCTGCGCGCTGGCCTgg < 8:48282/138‑1 (MQ=255) tCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCTGCGCGCTGGCCTgg > 7:48282/1‑138 (MQ=255) tCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGtt < 4:235328/148‑1 (MQ=255) aCGGCTCTGTCGATCAGGGACGCGCCGAGCTCCTCGTTCTGTGTGGCGTT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TGATGTAACACTGCTCGTTTGTCGAGCTATGTTTCGCTGTAGCCATCGATTTCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGTCCTGGGCCACGTGTTCGCCtgt < 4:283020/149‑1 (MQ=255) aCGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCtg < 8:143693/148‑1 (MQ=255) ggCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCCCGTGTTCGCCTGTgc > 7:299190/1‑149 (MQ=255) tCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAg > 6:13880/1‑149 (MQ=255) cGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAgg > 4:34216/1‑149 (MQ=255) gATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCTAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAgg > 1:274966/1‑148 (MQ=255) gATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAgg > 1:269585/1‑148 (MQ=255) gggCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑cc > 8:153618/1‑149 (MQ=255) cATCTCCGAGTGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGc < 4:162672/149‑1 (MQ=255) aTCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCtgt < 6:162244/129‑1 (MQ=255) aTCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCtgt > 5:162244/1‑129 (MQ=255) tCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTc > 5:131577/1‑149 (MQ=255) tCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTc > 1:337194/1‑149 (MQ=255) tCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGAGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTc > 5:371314/1‑149 (MQ=255) 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ccTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAGGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCtgt > 1:5523/1‑118 (MQ=255) ccTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCtgt < 2:5523/118‑1 (MQ=255) cTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGAc < 7:348176/149‑1 (MQ=255) tgtgtgGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCt > 4:380325/1‑130 (MQ=255) tgtgtgGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCt < 3:380325/130‑1 (MQ=255) gtgtgGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGtt > 6:79571/1‑149 (MQ=255) 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cGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCt > 5:83544/1‑149 (MQ=255) cGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCt > 6:154076/1‑149 (MQ=255) gttgttCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGc < 2:269585/147‑1 (MQ=255) gttgttCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGc < 2:274966/147‑1 (MQ=255) gttgttCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTg > 3:349205/1‑149 (MQ=255) ttCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCg < 7:153618/148‑1 (MQ=255) ttCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATACCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCgg > 3:23534/1‑149 (MQ=255) aTGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACGGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGc < 6:131577/149‑1 (MQ=255) tttCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCctc > 8:139880/1‑149 (MQ=255) cgcgGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTg < 7:148045/148‑1 (MQ=255) cgcgGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTg < 5:154076/148‑1 (MQ=255) gcgGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTgg < 6:271815/148‑1 (MQ=255) gcgGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGc < 5:79571/149‑1 (MQ=255) gCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATcag > 6:374684/1‑149 (MQ=255) tCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCACCGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATccgcag > 6:300847/1‑149 (MQ=255) aaTGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGtt < 5:374684/149‑1 (MQ=255) ccgccCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑TCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCt < 1:175149/149‑1 (MQ=255) ccgccCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCt < 6:83544/149‑1 (MQ=255) cccAGGCCTGCGCGCTGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCtgt > 6:170866/1‑148 (MQ=255) cccAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCtgtg < 8:104507/149‑1 (MQ=255) cccAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCtgtg < 4:103822/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCTGCGCGCTGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCtgt > 4:275356/1‑147 (MQ=255) ccAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCtgt > 2:128115/1‑147 (MQ=255) ccAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGa < 4:349205/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGa < 1:24529/149‑1 (MQ=255) cAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGGCCCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGAt < 1:270298/96‑1 (MQ=255) cAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGAt > 2:270298/1‑95 (MQ=255) cAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCa > 7:22902/1‑149 (MQ=255) gcgcgcAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATg < 7:107783/149‑1 (MQ=255) cgcgcAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCgg < 4:217382/104‑1 (MQ=255) cgcgcAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCgg > 3:217382/1‑104 (MQ=255) gcgcAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTa < 3:34216/149‑1 (MQ=255) aGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGcct > 7:81963/1‑149 (MQ=255) aGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGcct > 8:216655/1‑149 (MQ=255) | GCCTTGGGCAGGCCGGTTTCGATCACGGCGCGGTCGATCAGGGCATCGCCGAGGGCCTCGATCTGTGTGGCGAT‑‑‑‑‑‑GGCT‑TCAAGGAACTCTGCTCGTTGTTCGAGCGATGTTTCGCGGTAGGCATCGAATGCCGCCCAGGCCAGCGCGCAGGCCTGGGCCACGTGTTCGCCTGTGCCGCCGAGGTAGG‑CCGGCTCCAACGTCTGACCGGTGGTTGGGTCGATGGCACGGATGGCGTCGCGGCTGCCGGTTACCGGCCTCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCT > NC_002947/1435674‑1435970 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |