Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,468,805 | T→C | 6.8% | Q446Q (CAA→CAG) | algK ← | alginate biosynthesis protein AlgK |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,468,805 | 0 | T | C | 6.8% | 211.8 / 3.4 | 74 | Q446Q (CAA→CAG) | algK | alginate biosynthesis protein AlgK |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/30); new base C (2/3); total (41/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.53e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ATGCCGGCTTTCACGAAGGGATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTGCGGGCGGATGCCGTGGCCCTC > NC_002947/1468660‑1468948 | aTGCCGGCTTTCACGAAGGGATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGc < 8:309398/149‑1 (MQ=255) tGCCGGCTTTCACGAAGGGATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCt < 6:139134/149‑1 (MQ=255) tGCCGGCTTTCACGAAGGGATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCCCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGCCCAGCAACTGCt > 6:245483/1‑149 (MQ=255) tGCCGGCTTTCACGAAGGGATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGGGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGCCCAGCAACTGCt > 6:240079/1‑149 (MQ=255) cGGCTTTCACGAAGGGATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTggg > 4:118180/1‑149 (MQ=255) cTTTCACGAAGGGATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGCCCAGCAACTGCTGGAcca < 5:240079/149‑2 (MQ=255) cTTTCACGAAGGGATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGCCCAGCAACTGCTGGAcca < 5:245483/149‑2 (MQ=255) tttCACGAAGGGATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTg > 4:93811/1‑143 (MQ=255) tttCACGAAGGGATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTg < 3:93811/143‑1 (MQ=255) gAAGGGATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCTCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTgcg < 6:115009/149‑1 (MQ=255) gAAGGGATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTgg < 7:33108/138‑1 (MQ=255) gAAGGGATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTgg > 8:33108/1‑138 (MQ=255) gAAGGGATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTgcg > 8:154178/1‑149 (MQ=255) gAAGGGATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCGGGGCCTGGTTgcg > 4:232314/1‑149 (MQ=255) gATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGAt > 5:217120/1‑149 (MQ=255) gAGGGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAg < 1:311538/148‑1 (MQ=255) gAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAg < 7:194126/148‑1 (MQ=255) tCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCGTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGgtgt > 8:228935/1‑147 (MQ=255) cATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGTGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAg < 8:164688/149‑1 (MQ=255) aTAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAg < 1:72875/148‑1 (MQ=255) gAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTg < 3:87565/149‑1 (MQ=255) tCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTc > 3:342384/1‑146 (MQ=255) aCCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAgct > 2:44607/1‑149 (MQ=255) aCCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAgc < 3:340228/148‑1 (MQ=255) ccGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTGGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGGGGACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATGAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAgctg < 7:252442/149‑1 (MQ=255) cttcttTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCtgctgc < 6:217120/146‑1 (MQ=255) cttcttTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTgcag > 8:356975/1‑148 (MQ=255) cttcttTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTCCTATTCGCGCACTGAGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTCGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTgcag > 5:39517/1‑148 (MQ=255) ttcttTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTgcag > 4:322662/1‑147 (MQ=255) cttTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGt > 4:230917/1‑149 (MQ=255) tttCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGCTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGt < 5:354592/146‑1 (MQ=255) tttAGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGgt > 6:27169/1‑116 (MQ=255) tcgtcgTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAACTGCTGCAGCAGCTCga < 7:154178/148‑2 (MQ=255) tcgtcTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGa > 1:381653/1‑149 (MQ=255) tcTTGAAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTAGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCAAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGATGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTg > 7:188428/1‑149 (MQ=255) aGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCTGTTGTTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGt > 6:27155/1‑149 (MQ=255) gggCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAgctgc < 3:123616/122‑1 (MQ=255) gggCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAgctgc > 4:123616/1‑122 (MQ=255) gCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCgg > 7:160321/1‑149 (MQ=255) gAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCCGTTGTTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTgg < 5:27155/149‑1 (MQ=255) gggCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGcc > 5:287979/1‑149 (MQ=255) ccAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCGTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTGGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGc < 7:228935/149‑1 (MQ=255) cTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTg > 6:382397/1‑149 (MQ=255) tATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTgg > 6:315208/1‑149 (MQ=255) aTTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTggg > 1:237430/1‑149 (MQ=255) ttCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTgg < 6:292755/147‑1 (MQ=255) ttCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGc > 8:219762/1‑149 (MQ=255) cgcgCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCg > 5:358958/1‑148 (MQ=255) gcgcCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCtgctgc < 3:271129/99‑1 (MQ=255) gcgcCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCtgctgc > 4:271129/1‑99 (MQ=255) cTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACAccc < 4:342384/149‑1 (MQ=255) tGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTACCTGGTCCAGCAGATGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACAcc > 8:192337/1‑147 (MQ=255) cAGGCTGCCGCGTGCACGCTGTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTTGGCGAACAACCAGCCGt > 2:302147/1‑149 (MQ=255) cTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACAcc > 5:192032/1‑138 (MQ=255) cTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACAcc < 6:192032/138‑1 (MQ=255) cgcgTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGt > 1:353429/1‑149 (MQ=255) gcgTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGtt < 3:230917/149‑1 (MQ=255) cgTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTg < 6:39517/149‑1 (MQ=255) cgTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTg > 2:202366/1‑149 (MQ=255) cACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTgcggg > 5:31979/1‑149 (MQ=255) cACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTAGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTgcggg > 7:297715/1‑149 (MQ=255) aCGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTgcgggc > 6:383707/1‑149 (MQ=255) aCGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTgcgggc > 5:50473/1‑149 (MQ=255) ttCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTGCGGGCGGAt < 3:118180/147‑1 (MQ=255) ccTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTGCGGGCGGATGcc < 3:232314/148‑1 (MQ=255) gTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTGCGGGCGGATGCCGTgg < 7:219762/148‑1 (MQ=255) gTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTGCGGGCGGATGCCGTgg < 4:257278/148‑1 (MQ=255) gTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTGCGGGCGGATGCCGTgg > 3:257278/1‑148 (MQ=255) ccAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTGCGGGCGGATGCCGTGGccc < 3:322662/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGGTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTGCGGGCGGATGCCGTGGccc < 7:356975/149‑1 (MQ=255) cagcagTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGaa < 3:82747/108‑1 (MQ=255) cagcagTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGaa > 4:82747/1‑108 (MQ=255) cagcagTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTGCGGGCGGATGCCGTGGCCCt > 4:82915/1‑149 (MQ=255) agcagTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTGCGGGCGGATGCCCTGGcccag > 5:72946/1‑147 (MQ=255) | ATGCCGGCTTTCACGAAGGGATTGAGCGTCATAGCGAGTCCTCACCGTCTACTTCTTTTTCGTCGTCTTGCAGGGCTTCGAGGGCCAGGGTGCTATTCGCGCCCTGCGCCAGGCTGCCGCGTGCACGCTTTTCCTGGTCCAGCAGTTGCTGGGCCTGGTTGCGCTGATCAGGTGTCAGTTGCTGGTCGAGCTGCTGCAGCAGTTCGGCTGATTGCGGCGTCGGGTTGGCCTGCGACAGCTGGGCGAACACCCAGGCGTTGCCCGGTTGCGGGCGGATGCCGTGGCCCTC > NC_002947/1468660‑1468948 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |