| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,561,513 | T→A | 5.1% | N193I (AAC→ATC) | pctA ← | methyl‑accepting chemotaxis protein PctA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,561,513 | 0 | T | A | 5.1% | 237.7 / 2.4 | 78 | N193I (AAC→ATC) | pctA | methyl‑accepting chemotaxis protein PctA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/41); new base A (2/2); total (35/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.74e-01 | |||||||||||
GGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTTGGTGGTCAT > NC_002947/1561366‑1561658 | gggCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGtt > 4:165084/1‑149 (MQ=255)gggCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGtt < 5:81528/149‑1 (MQ=255) gCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGa < 1:158944/149‑1 (MQ=255) aaGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCa < 7:324602/148‑1 (MQ=255) ggTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCAACGACCAgg < 6:194483/148‑1 (MQ=255) gTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCAACGACCAgggc < 4:226546/149‑3 (MQ=255) agcagGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGc < 4:122622/149‑1 (MQ=255) gcagGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCg > 4:105703/1‑149 (MQ=255) cagGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCg > 5:105110/1‑148 (MQ=255) agGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTa > 6:158037/1‑149 (MQ=255) gggTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATcc > 1:4699/1‑148 (MQ=255) gTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCAt > 6:228714/1‑149 (MQ=255) tCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGATCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCAt > 5:341348/1‑148 (MQ=255) tCTGGCCATCGCGTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGTTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCa < 6:341348/147‑1 (MQ=255) ggCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATgccg > 1:144304/1‑149 (MQ=255) ggCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATgccg > 4:102983/1‑149 (MQ=255) gCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATgccgc > 1:371997/1‑149 (MQ=255) gCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAg < 3:105703/148‑1 (MQ=255) tttGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGtt > 6:299654/1‑148 (MQ=255) tttGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGtt > 7:358666/1‑148 (MQ=255) tGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCa < 5:176574/148‑1 (MQ=255) aCTTCGGTCTGCTCGCAGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGTGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGTGTTCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGa < 4:16305/149‑1 (MQ=255) aCTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGa < 5:277987/149‑1 (MQ=255) cTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAg < 2:225273/149‑1 (MQ=255) cTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTAAACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAg > 1:323785/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGtt < 6:105110/148‑1 (MQ=255) cGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGtt < 2:49818/148‑1 (MQ=255) cGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGtt < 1:31201/148‑1 (MQ=255) gTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTtgat > 6:153309/1‑149 (MQ=255) tCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTtgatg < 1:103505/149‑1 (MQ=255) tCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTtgat > 4:285333/1‑148 (MQ=255) cAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCTGGAACATGTCCTACATCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTtgatg < 4:278730/148‑1 (MQ=255) gCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATc > 8:205947/1‑149 (MQ=255) cGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGc < 8:99611/149‑1 (MQ=255) gTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAg < 3:102983/149‑1 (MQ=255) tCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAgg < 2:371997/149‑1 (MQ=255) aGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGGCAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGc < 6:359252/148‑1 (MQ=255) tttCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGt > 1:249399/1‑149 (MQ=255) gtgtGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGc < 3:285333/149‑1 (MQ=255) tgtgCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGcc < 2:249399/149‑1 (MQ=255) tgctgcGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAg < 4:133782/149‑1 (MQ=255) gTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGc < 1:351806/122‑1 (MQ=255) gTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGc > 2:351806/1‑122 (MQ=255) gTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCa > 1:234152/1‑149 (MQ=255) tCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCAc > 4:356525/1‑149 (MQ=255) cGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGc > 2:289270/1‑149 (MQ=255) aCAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCCGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCa < 5:184362/149‑1 (MQ=255) aGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAAc < 5:185511/149‑1 (MQ=255) aCTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACgctg < 3:356525/149‑1 (MQ=255) ttCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACgctgct > 6:34275/1‑149 (MQ=255) tCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGctgctg > 7:336120/1‑149 (MQ=255) cATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGctgctg < 3:165084/148‑1 (MQ=255) aTGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCAc < 3:243432/101‑1 (MQ=255) aTGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGctgctg > 5:278941/1‑147 (MQ=255) aTGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGctgctg > 2:147596/1‑147 (MQ=255) aTGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCACTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCAc > 4:243432/1‑101 (MQ=255) tGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGctgctg > 8:248602/1‑146 (MQ=255) tGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGga < 7:248602/148‑1 (MQ=255) ccAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGAcc < 7:205947/149‑1 (MQ=255) ccAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGAcc > 7:194136/1‑149 (MQ=255) cTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGCGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGa < 8:336120/149‑1 (MQ=255) aTCCGTGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTAGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAgg < 2:323785/148‑1 (MQ=255) aTCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTACTGGAGACCTTGCTGAgg < 2:4699/148‑1 (MQ=255) cGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGc < 8:358666/149‑1 (MQ=255) tGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGAt < 4:71048/149‑1 (MQ=255) aCCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCACATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGAc > 8:15198/1‑149 (MQ=255) ccAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGAc > 8:189947/1‑148 (MQ=255) ggATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATc < 1:289270/149‑1 (MQ=255) gATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCt < 4:153370/149‑1 (MQ=255) tCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCttg > 1:67115/1‑149 (MQ=255) ttccTGGTCAACGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTtgg > 2:294479/3‑149 (MQ=255) gCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCttgt < 5:299654/146‑1 (MQ=255) gCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTtgg > 3:162675/1‑149 (MQ=255) ccTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTtggtg < 6:278941/149‑1 (MQ=255) ccTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTtggtg > 8:142531/1‑149 (MQ=255) ccTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTtggtg < 5:34275/149‑1 (MQ=255) ccTGGTCGTGGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTtggtg < 2:37224/149‑1 (MQ=255) ccTGGTCAACGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTtggtg > 2:310155/1‑149 (MQ=255) ggTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTTggtggt > 5:335568/1‑148 (MQ=255) tCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTTGGTGGTCAt < 1:147596/149‑1 (MQ=255) | GGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTTGGTGGTCAT > NC_002947/1561366‑1561658 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |