| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,580,944 | C→A | 15.2% | K151N (AAG→AAT) | ttgB ← | efflux pump membrane protein TtgB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,580,944 | 0 | C | A | 15.2% | 168.3 / 20.2 | 66 | K151N (AAG→AAT) | ttgB | efflux pump membrane protein TtgB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (25/31); new base A (7/3); total (32/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.80e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.95e-01 | |||||||||||
CGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGC > NC_002947/1580797‑1581090 | cGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCt > 1:227917/1‑149 (MQ=255)cGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCt < 2:225294/149‑1 (MQ=255) gggTCAGCTGGAACTTATTCTGCTTTGCCGGATCGAGCCAGATACTGATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCTGGTCGTCCTTg < 4:362072/149‑1 (MQ=255) gcAGCTCCAACTAATTCACCCCGGCCGCCACGAGCCACAGACGCAGGGCGTACTGCGCCCCGAACACCTGGCAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTc < 4:325143/148‑1 (MQ=255) cTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCAtgc > 1:209521/1‑149 (MQ=255) gAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCAtgctgc > 7:63220/1‑149 (MQ=255) aCTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCg > 4:242447/1‑149 (MQ=255) cAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCg < 8:67985/148‑1 (MQ=255) aGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATATGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGAATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCg > 2:30440/1‑147 (MQ=255) aGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGga < 2:121267/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGAGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGACATTGGTCATGCTGCCGTCTTCg > 7:331590/1‑146 (MQ=255) aggtgCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTAGTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTGCGAGACGATAATGTTGGCGAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGgag < 2:269476/144‑1 (MQ=255) ggCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGAc < 8:309732/147‑1 (MQ=255) ggCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGAc < 5:139107/147‑1 (MQ=255) ccGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGgatcacagg > 6:70720/1‑142 (MQ=255) ccGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAgg > 4:24115/1‑149 (MQ=255) ccGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAgg > 6:133364/1‑149 (MQ=255) cGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGc < 1:303732/149‑1 (MQ=255) cGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGc < 5:133364/149‑1 (MQ=255) gATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCAtg > 4:263252/1‑125 (MQ=255) gATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCAtg < 3:263252/125‑1 (MQ=255) gATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACcagca < 3:230730/149‑1 (MQ=255) tGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGttc < 3:24115/149‑1 (MQ=255) gCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGACGATCACCAGACGGAAGttct > 6:185691/1‑148 (MQ=255) gCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGttctt < 7:200975/149‑1 (MQ=255) cggaCTGCGCACAGAACACCTGGAAGTGACCTACACCCGCTGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCTGGAAGttctt < 8:331590/145‑1 (MQ=255) cGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACATACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGttctt > 3:191403/1‑148 (MQ=255) gTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCa < 2:258828/149‑1 (MQ=255) cACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTg > 2:256269/1‑149 (MQ=255) gcaggaggtgcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGc > 3:381187‑M1/65‑108 (MQ=255) gcaggacgtgcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGc < 4:381187‑M1/44‑1 (MQ=255) cTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGa < 7:127773/149‑1 (MQ=255) ggAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATa > 6:88754/1‑149 (MQ=255) aaGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATAcc < 1:30440/149‑1 (MQ=255) gcccACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCGGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCt < 2:307729/146‑1 (MQ=255) gcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGa < 5:336613‑M1/47‑1 (MQ=255) gcagcagcaaggtatccgcgtcaccaaagcagtgaagaacttcctgctggtgatcGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGa > 6:336613‑M1/56‑102 (MQ=255) cTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgc > 3:331140/1‑149 (MQ=255) cTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgc > 3:327531/1‑149 (MQ=255) acacCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgctg > 1:5913/1‑149 (MQ=255) acacCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgctg > 8:128366/1‑149 (MQ=255) cacCCGCGGTAAGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTtgctgct < 5:185691/147‑1 (MQ=255) ccGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACt > 5:187018/1‑149 (MQ=255) tACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGc < 2:209521/149‑1 (MQ=255) tACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGc < 6:187018/149‑1 (MQ=255) cgcgAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGTCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCgg < 7:128039/149‑1 (MQ=255) gcgAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCtgctgc > 4:38524/1‑149 (MQ=255) gagaTCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGgcag > 2:14981/1‑149 (MQ=255) gggTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCg < 2:227917/148‑1 (MQ=255) ccTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCTGccgcaggaagtgc < 3:38524/149‑8 (MQ=255) tGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGAcgcg < 4:206753/107‑1 (MQ=255) tGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGAcgcg > 3:206753/1‑107 (MQ=255) tGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTgg > 7:29296/1‑148 (MQ=255) tGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGc > 2:290738/1‑149 (MQ=255) aTGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAg < 2:92224/149‑1 (MQ=255) gaCGATATAGTTGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCATGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCt > 6:360790/1‑149 (MQ=255) cGATATAGTCGGCCAGGTCGTCATTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTg > 7:285120/1‑149 (MQ=255) gATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGt > 8:182143/1‑149 (MQ=255) atatAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGtt < 7:128366/149‑1 (MQ=255) atatAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGtt > 2:230095/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgt < 1:256269/148‑1 (MQ=255) ttGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgtac < 4:191403/149‑1 (MQ=255) GCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgtac > 7:128395‑M1/1‑146 (MQ=255) GCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTATTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCAATTCCTGAGGCATCAGCGGGATGGCCAGGTTCATCTAGTtctgtacca < 8:128395‑M1/148‑2 (MQ=255) CAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgtacctgta > 4:331140‑M1/1‑149 (MQ=255) aGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCGCCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTctgtacctgtac < 8:140558/149‑1 (MQ=255) cTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTgcgc < 3:26980/147‑1 (MQ=255) cTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTgcgc > 4:26980/1‑147 (MQ=255) | CGGGGTCAGCTGGAACTTATTCAGCTTGGCCGGATCGAGCCAGATACGCATGGCGTACTGCGCACCGAACACCTGGAAGTCACCTACACCCGCGGTACGCGAGATCGGGTCCTGCATGTTCGAGACGATATAGTTGGCCAGGTCGTCCTTGGTCATGCTGCCGTCTTCGGAGACCAGGCCGATCACCAGCAGGAAGTTCTTCACTGCTTTGGTGACGCGGATACCTTGCTGCTGCACTTCCTGCGGCAGCAGCGGGGTGGCCAGGTTCAGCTTGTTCTGTACCTGTACCTGCGC > NC_002947/1580797‑1581090 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |