| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,693,792 | C→G | 6.3% | R87R (CGC→CGG) ‡ | PP_1489 → | CheW domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,693,792 | 0 | C | G | 6.3% | 248.8 / 6.4 | 79 | R87R (CGC→CGG) ‡ | PP_1489 | CheW domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/36); new base G (2/3); total (40/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.62e-01 | |||||||||||
TGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAG > NC_002947/1693647‑1693936 | tgtTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctg < 6:351459/149‑1 (MQ=255) ccGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgct > 6:149402/1‑149 (MQ=255) cgcgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGTTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctgttgctg < 6:187948/149‑1 (MQ=255) cgcgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctg > 4:333680/1‑149 (MQ=255) cgcgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGCTCAAACGCACCAGCACCCGCcaggagcac > 2:155042/1‑147 (MQ=255) cgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctggt < 3:274530/149‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctggt < 4:14171/149‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCAGGcgggtgctggt < 3:293836/149‑1 (MQ=255) gTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctggtg < 7:45230/149‑1 (MQ=255) gTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctggtg < 7:17192/149‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCAGGCgggtgctggtgc < 2:210936/149‑1 (MQ=255) gCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCAc > 7:2213/1‑148 (MQ=255) tCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTAcc > 7:101279/1‑147 (MQ=255) tCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTAcc > 2:189555/1‑147 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAAGGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑Ag < 1:115095/148‑1 (MQ=255) aGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑Aggc > 5:57221/1‑149 (MQ=255) aGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑Aggc > 7:2076/1‑149 (MQ=255) gCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCCCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑Aggcg > 2:129260/1‑149 (MQ=255) cGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑Aggcggc < 1:129260/149‑1 (MQ=255) cGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACCCACCACCCCCCCCCAGGTGCAGGTGCACGACCC‑Agccggc > 7:57063/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCa < 3:240942/149‑1 (MQ=255) cccAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAg > 2:247817/1‑149 (MQ=255) cccAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAg > 4:173142/1‑149 (MQ=255) ggCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTg < 8:120040/149‑1 (MQ=255) aCCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGcc < 5:216695/149‑1 (MQ=255) ctgcctgGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCt > 1:336484/1‑148 (MQ=255) ctgcctgGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCAGGcgggtgctggt > 6:139188/1‑118 (MQ=255) ctgcctgGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCAGGcgggtgctggt < 5:139188/118‑1 (MQ=255) cctgGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGAt < 8:2213/148‑1 (MQ=255) gggTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTg < 8:101279/149‑1 (MQ=255) gggTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTg < 8:2076/149‑1 (MQ=255) ggTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTg < 4:306018/148‑1 (MQ=255) tCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTg < 6:173534/135‑1 (MQ=255) tCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTg > 5:173534/1‑135 (MQ=255) gcgGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAg > 8:96334/1‑147 (MQ=255) gCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGc > 3:269499/1‑148 (MQ=255) aTTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCAc < 4:366258/149‑1 (MQ=255) tcGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGa > 4:308075/1‑148 (MQ=255) tcGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGa > 6:317892/1‑148 (MQ=255) gCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGACGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGTTGCACTACCG‑CGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAAc > 7:176668/1‑149 (MQ=255) cATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCt < 1:189555/149‑1 (MQ=255) aTCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTg > 2:370521/1‑149 (MQ=255) aTCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTg > 7:273512/1‑149 (MQ=255) tCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGc < 5:149402/149‑1 (MQ=255) tCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGc < 3:173142/149‑1 (MQ=255) ccAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGc > 7:173395/1‑148 (MQ=255) aGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCaa > 2:272736/1‑149 (MQ=255) cTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCATGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAAcc < 1:272736/149‑1 (MQ=255) ttCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGAc < 7:96334/149‑1 (MQ=255) ttCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACACACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGAc < 6:129545/149‑1 (MQ=255) cGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAg > 5:147170/1‑149 (MQ=255) ggTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGt > 7:238199/1‑149 (MQ=255) ggTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGt > 1:28711/1‑149 (MQ=255) tCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTc < 7:114694/149‑1 (MQ=255) gACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGc < 1:247817/148‑1 (MQ=255) gACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGc < 3:333680/148‑1 (MQ=255) ccTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCt > 1:299730/1‑149 (MQ=255) gccTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGt < 1:155042/149‑1 (MQ=255) gatttaGCTTTGGACATCCGGCGGGGCAACGCACGAGCACCAGCCTGGTGCTGGTGCACTACCT‑AGTCGGCATGCATCTTTGCCTGATCCTGTAGCAGGAAACCGAACCCCTGCTTTTCAAACAGGACTAGTTCCAGAACTATGGGGTg < 8:176668/144‑1 (MQ=255) cTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTgg < 1:370521/149‑1 (MQ=255) cTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTg < 6:270936/111‑1 (MQ=255) cTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTg > 5:270936/1‑111 (MQ=255) cTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAg < 6:57221/149‑1 (MQ=255) gCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAACCCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGAt > 4:57862/1‑149 (MQ=255) gCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGAc > 8:25400/1‑116 (MQ=255) gCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGAc < 7:25400/116‑1 (MQ=255) gCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTCGCCAACCGGATGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGAt > 8:107602/1‑149 (MQ=255) ccAGCCGGCGGTGAAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATg > 7:47751/1‑149 (MQ=255) aGCCGGCGGTGCACCGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATgcg > 1:38102/1‑149 (MQ=255) gCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTCGCCAACCGGATGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATgcgc < 7:107602/149‑1 (MQ=255) ggcggTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGCAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAACCCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCt > 1:276102/1‑149 (MQ=255) gTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCt < 8:273512/149‑1 (MQ=255) aaCGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAg > 8:168359/1‑129 (MQ=255) aCGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGcc > 1:90368/1‑149 (MQ=255) aCCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGt < 4:378716/149‑1 (MQ=255) aCCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGt > 3:378716/1‑149 (MQ=255) aCCAGCACCAGGCGGGTGCTGGTGCAGTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGt > 7:272265/1‑149 (MQ=255) gCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTgcgc < 8:173395/149‑1 (MQ=255) ccGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAg > 6:376295/1‑148 (MQ=255) | TGTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCG‑AGGCGGCCTGCAGCTTGGCCTGATCCTGGAGCAGGCCACCGAAACCCTGCGTTGCCAACCGGACGAGTTCCAGCCCTATGGGGTGGACACAGGCGATGCGCCTTATCTGGGCCCGGTGCGCCAG > NC_002947/1693647‑1693936 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |