| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,774,628 | C→G | 7.7% | S604C (TCC→TGC) ‡ | PP_1581 → | BNR domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,774,628 | 0 | C | G | 7.7% | 225.8 / 9.8 | 78 | S604C (TCC→TGC) ‡ | PP_1581 | BNR domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/35); new base G (3/3); total (40/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.66e-01 | |||||||||||
TCCTCGCGGATCTGGCTTGGCCGTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGCACTGCCAGGGTCATTGAGCAGGAGGTCGTGGCCGGCACCAGTGTGTCG > NC_002947/1774483‑1774773 | tgctggcgGATCTGGGTTGGCCGTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGt < 1:75682/144‑1 (MQ=255) cTCGCGGATCTGGCTTGGCCGTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATTATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTg < 6:190792/149‑1 (MQ=255) cTCGCGGATCTGGCTTGGCCGTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTg < 7:89232/149‑1 (MQ=255) cTCGCGGATCTGGCTTGGCCGTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTg < 4:178870/149‑1 (MQ=255) tCGCGGATCTGGCTTGGCCGTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTgg > 8:113211/1‑149 (MQ=255) gcgGATCTGGCTTGGCCGTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGc < 7:113211/149‑1 (MQ=255) cgGATCTGGCTTGGCCGTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACGGAGTTGGGct < 3:253299/149‑2 (MQ=255) ggATCTGGCTTGGCCGTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCaa < 2:137789/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCCGTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTTCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCa < 2:142592/146‑1 (MQ=255) gCTTGGCCGTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCAc < 5:235781/147‑1 (MQ=255) gCTTGGCCGTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACGGAGTTGGGctcca < 3:209357/144‑5 (MQ=255) cTTGGCCGTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTa > 1:230266/1‑149 (MQ=255) ttGGCCGTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTAc > 8:202781/1‑149 (MQ=255) gTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGAtt < 3:128572/149‑1 (MQ=255) gTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGAtt > 6:390634/1‑149 (MQ=255) ctcCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTGTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATtgt < 5:224988/148‑1 (MQ=255) tcCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAAGCCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATtgt > 1:96379/1‑148 (MQ=255) tcCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGa > 7:304135/1‑149 (MQ=255) cGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGAcc > 8:270642/1‑149 (MQ=255) cGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGAcc < 2:230266/149‑1 (MQ=255) cGAGCGGTCGACTGTTGACCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGAcc > 8:168036/1‑149 (MQ=255) gtggTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTc > 2:72565/3‑149 (MQ=255) tggTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCg < 1:72565/148‑1 (MQ=255) cGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCg > 7:324992/1‑149 (MQ=255) ggTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCgg < 8:304135/149‑1 (MQ=255) ggTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCgg < 4:111172/149‑1 (MQ=255) tCGACTGTTGACCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCgggg < 7:168036/149‑1 (MQ=255) tGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGAtt < 6:100059/131‑1 (MQ=255) tGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGAtt > 5:100059/1‑131 (MQ=255) ttGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATgg > 3:208173/1‑149 (MQ=255) tgctgGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGAt > 4:273883/1‑149 (MQ=255) ctgGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCCCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACGGAGTTGGGctcca > 7:317490/1‑104 (MQ=255) ctgGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCCCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACGGAGTTGGGctcca < 8:317490/108‑5 (MQ=255) gAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCgg > 4:124144/1‑129 (MQ=255) gAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCgg < 3:124144/129‑1 (MQ=255) gAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCt < 8:324992/147‑1 (MQ=255) gAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTc > 8:333453/1‑148 (MQ=255) aacGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCgg > 7:248239/1‑125 (MQ=255) aacGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCgg < 8:248239/125‑1 (MQ=255) aacGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATc‑gc > 1:48432/1‑149 (MQ=255) aacGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATc‑gc < 7:333453/149‑1 (MQ=255) atatCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTAt < 8:195991/149‑1 (MQ=255) tatCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTAt > 7:120500/1‑148 (MQ=255) gagaGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCACTCTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACACGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGAc > 1:281265/1‑148 (MQ=255) gagaGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACaa > 1:363084/1‑149 (MQ=255) agagGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATA‑GCGTATGACaac > 1:350166/1‑149 (MQ=255) ggAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACaacgaa > 6:346659/1‑149 (MQ=255) aa‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGa < 7:270642/149‑1 (MQ=255) ccTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACcg > 8:334425/1‑149 (MQ=255) cGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAg < 2:96379/149‑1 (MQ=255) gCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTAACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGc > 3:132088/1‑149 (MQ=255) ttGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGCCGATGGGTTGATGCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCgg > 6:336091/1‑149 (MQ=255) ttgtctATGGTATGATGATGGTGGCAC‑CTGGCCTCACAAAGTTGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGc < 7:279548/146‑1 (MQ=255) gCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGc < 2:363084/148‑1 (MQ=255) ctctATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCgg > 8:220069/1‑146 (MQ=255) ggATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGc < 6:134628/148‑1 (MQ=255) gatgatGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGACCGTACCGCGAAGCGGCAGATTCGCAc > 8:357319/1‑149 (MQ=255) gatgatGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGCAc > 3:208423/1‑149 (MQ=255) tgaGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGCACTGc > 8:353880/1‑147 (MQ=255) tCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGCACTGCCAGGGTCAtt < 8:328861/149‑1 (MQ=255) tCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGCACTGCCAGGGTCAtt < 3:273883/149‑1 (MQ=255) tCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGCACTGCCAGGGTCAtt < 4:105253/149‑1 (MQ=255) cTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGCACTGCCAGGGTCATTGAg > 4:99517/1‑148 (MQ=255) tGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGCACTGCCAGGGTCATTGAg > 8:226421/1‑147 (MQ=255) ggCCTCACATTGTGGTGCTGCAGCCCAACTCCGTTTTGCAAGTCACGTACCCTATTGTGACCTTCGGGTACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTTTGTCAACTAACGGTCCGCGAAGCGGCAGATTCGCACTGCCAGGGTCATTGAGCag < 2:350166/149‑1 (MQ=255) 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cTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGCACTGCCAGGGTCATTGAGCAGGAGGTCGTGGCCGGCAc < 7:226421/149‑1 (MQ=255) ttgCCCAACGGAGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGCACTGCCAGGGTCATTGAGCAGGGGGTCGTGGCCGGCACCAg > 2:275305/3‑149 (MQ=255) ttgCCCAACGGAGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGCACTGCCAGGGTCATTGAGCAGGAGGTCGTGGCCGGCACCAg > 6:161550/3‑149 (MQ=255) aGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGCACTGCCAGGGGCATTGAGCAGGAGGTCGTGGCCGGCACCAgt < 8:120500/149‑1 (MQ=255) gCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGCACTGCCAGGGTCATTGAGCAGGAGGTCGTGGCCGGCACCAgtg > 2:309579/1‑149 (MQ=255) gCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGAGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGAATCGCACTGCCAGGGTCATTGAGCAGGAGGTCGTGGCCGGCACCAgtg > 1:79612/1‑149 (MQ=255) ccAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGAACTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGCACTGCCAGGGTCATTGAGCAGGAGGTCGTGGCCGGCACCAgtgtg > 5:102977/1‑149 (MQ=255) aCTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGCACTGCCAGGGTCATTGAGCAGGAGGTCGTGGCCGGCACCAGTGTGTCg < 2:341363/149‑1 (MQ=255) | TCCTCGCGGATCTGGCTTGGCCGTTCTCCGAGCGGTCGACTGTTGATCTGCTGGAACAACGATATCGAGAGGAAAA‑CCCTCACGCTTGCTCTATCGGATGATGAGGGGGTCAC‑CTGGCCTCACAAAGTGGTGCTGGAGCCCAACTCCGTTGGGCAAGTCACGTACCCGATTGTGACCTTCGGGGACGATGGGTTGATCCTCATC‑GCGTATGACAACGAACGGACCGCGAAGCGGCAGATTCGCACTGCCAGGGTCATTGAGCAGGAGGTCGTGGCCGGCACCAGTGTGTCG > NC_002947/1774483‑1774773 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |